Preguntas de investigación Proyectos Degradación de lignocelulosa by Laura Lizeth Diaz Ortiz https://padlet.com/lldiaz3/zxjn2k4kr1wquiw8 En este padlet cada uno de los dos grupos que se conformaron en Agrosavia deberá publicar su pregunta de investigación. El Grupo 1 deberá escribir 5 contribuciones a la pregunta del Grupo 2 y escribir 2 debilidades con respecto a la pregunta del Grupo 2. Lo mismo para el Grupo 2, escribir 5 contribuciones y 2 debilidades a la pregunta del Grupo 1. en-us 2023-04-20 19:27:58 UTC 2023-06-02 17:33:04 UTC hello@padlet.com pregunta grupo 2: https://padlet.com/lldiaz3/zxjn2k4kr1wquiw8/wish/2567664358 ¿Cuáles son los microorganismos que integran el consorcio microbiano? ¿Es posible vincular el perfil de ácidos grasos asociados al metabolismo y la degradación de celulosa con lo reportado en la literatura para estos microorganismos?
Esta pregunta tiene dos secciones, la primera es la identificación de los microorganismos que esta apoyada en la técnicas:
- PCR multiplex
- Microscopia
- SEM
La segunda parte está relacionada con el perfil de AGUs y cómo este se puede relacionar con la capacidad de bioconversión de celulosa de los organismos identificados.]]> 2023-04-25 18:22:32 UTC https://padlet.com/lldiaz3/zxjn2k4kr1wquiw8/wish/2567664358 Pregunta grupo 1: https://padlet.com/lldiaz3/zxjn2k4kr1wquiw8/wish/2568117368 ¿Qué características metabólicas y funcionales están asociadas a los procesos de degradación de celulosa y lignocelulosa en microorganismos provenientes del rumen?

Esta pregunta está orientada hacia la generación de productos como ácidos grasos volátiles como resultado de la degradación de celulosa y lignocelulosa]]> 2023-04-26 02:37:49 UTC https://padlet.com/lldiaz3/zxjn2k4kr1wquiw8/wish/2568117368 Retroalimentación Grupo 1 https://padlet.com/lldiaz3/zxjn2k4kr1wquiw8/wish/2570911841 Contribuciones: 

1. Pueden proponer adicionalmente una técnica de secuenciación que les permita identificar los microorganismos. 
2. El perfil de AGUs en literatura pueden ayudar a elucidar los procesos metabólicos por la microbiota del rumen, y verificar cuáles de estas rutas parten de la celulosa. 
3. Que bueno que hayan incluído las posibles técnicas que usarían.
4. Nos parece interesante que piensen orientarse con la literatura en las posibles rutas metabólicas que degradan la celulosa en rumen, eso le da mucha profundidad. 
5. Su pregunta es específica, eso le da coherencia y no es ambigüa.

Para reforzar: 

Las técnicas que proponen para identificar los microorganismos presentes en el consorcio, no permiten realmente llegar a la taxonomía de estos. 

La segunda pregunta se deriva de identificar los microorganismos presentes por lo que no es posible ejecutarla con las técnicas propuestas. ]]> 2023-04-27 20:38:52 UTC https://padlet.com/lldiaz3/zxjn2k4kr1wquiw8/wish/2570911841 Retroalimentación del grupo 2 https://padlet.com/lldiaz3/zxjn2k4kr1wquiw8/wish/2571172852 Contribuciones:

1. Tienen en cuenta la metodología de ácidos grasos volátiles que será llevada a cabo y la integran con posibles características metabólicas.
2. La mención de características funcionales dentro de la pregunta es relevante, ya que da a entender que a partir del estudio se pueden dar nuevas posibilidades de uso a los microorganismos.  
3. Al hablar del metabolismo, es posible tener en cuenta las rutas de degradación y cómo se puede utilizar la celulosa y lignocelulosa como fuente de carbono y energía. 
4. Es interesante que delimiten a los rumiantes como hospederos de los microorganismos anaeróbicos utilizados. 
5. Consideramos un acierto hablar sobre las características metabólicas de los microorganismos porque esto abre la puerta a incluir análisis de metabolitos producidos y determinar la importancia de sus funciones.

Debilidades

1. No queda muy claro a partir de qué información se enfocan en lignocelulosa y puntualmente en organismos del rumen.
2. El enfoque de la pregunta se hace hacia ácidos grasos volátiles, por lo cual no se les da tanta importancia a procedimientos como la secuenciación, los cuales permiten la identificación de los microorganismos a trabajar. 


https://uniandes-my.sharepoint.com/:w:/g/personal/sv_guayara_uniandes_edu_co/ERMyxoG2Cg9OmOkXcHEG8ioBWftezJwK_wQrcPx3SFdUbg?e=hRh1LL


]]> 2023-04-28 02:10:07 UTC https://padlet.com/lldiaz3/zxjn2k4kr1wquiw8/wish/2571172852 Pregunta final https://padlet.com/lldiaz3/zxjn2k4kr1wquiw8/wish/2587759909 Primera parte
¿Es el consorcio formado por B9 y Rf capaz de degradar celulosa? 
Segunda parte
¿Quiénes están en el consorcio? 
Tercera parte: Funcionalidad
¿Cuáles AG son producidos por B9 y cuáles por Rf? 

¿De qué manera el consorcio artifical conformado por Rf y B9 es capaz de degradar y metabolizar celulosa? ]]> 2023-05-11 20:47:06 UTC https://padlet.com/lldiaz3/zxjn2k4kr1wquiw8/wish/2587759909