Primeramente, las cerezas del café se deben despulpar ya sea manual o por medio de una despulpadora con mucho cuidado de no dañarla. la semilla se debe fermentar y lavar con agua limpia. Debe dejarse secar a la sombra y con buenas condiciones de aireación, en un lapso de 24 horas se les debe aplicar calor a una temperatura no mayor de 37° lo cual, permite que al terminar el proceso la semilla obtenga una humedad del 12%. 
En el caso de las variedades mejoradas como la Variedad Castillo, de amplia adaptación, y las Variedades Castillo zonales, la semilla se obtiene a través de los Comités de Cafeteros y es producida por Cenicafé, para garantizarle al caficultor una buena calidad de su composición (Alvarado, 2004)

Cochinillas de las raíces: en el almacigo las raíces pueden ser atacadas por cochinillas por lo que es necesario conocer el punto de origen, para su control se emplean gránulos dispersables en agua WG; este tipo de formulas permite que el producto se disperse con el agua y rápidamente se genera una suspensión de partículas.

Las variedades de porte bajo permiten el uso de mayores densidades comparadas con las variedades de porte alto. Las variedades de porte alto han alcanzado una densidad de 10.000 plantas por hectárea, mientras las variedades de porte alto alcanzan una densidad de 5.000 plantas por hectárea. Establecer altas poblaciones de plantas en condiciones favorables, generan mayor eficiencia en el uso de los recursos.