Dia 28 de fevereiro- 09 horas

Dia 07 de março - 10 horas

Dia 21 de março - 09 horas

Dia 28 de março - 10 horas

Dia 28 de fevereiro

Dia 07 de março

Dia 14 de março

Dia 28 de março

Dia 7 de abril - 17h30

Dia 15 de abril - 14h30

Dia 09 de maio - 09h15

Autores

Ano de publicação

Referência do artigo (APA 7)

Tipo de doença

Tipo de amostra (plasma, etc)

Tipo de molécula que foi medida e designação (proteínas, quimiocinas, genes, etc)

Tipos de kits usados (ELISA, etc)

Em caso de congelação de amostras, por quanto tempo?

Controlos usados (healthy controls, other diseases, etc)

Fórmula de cálculo do score

Como é definido o threshold

Notas

Vários artigos tem usados como controlos outras doenças autoimunes (ou doenças que não sejam interferonpatias, como controlos negativos junto com os healthy controls, ou interfonpatias do tipo I em estado quiescente, como no caso desse artigo, como controlos positivos, que tem níveis expectáveis maiores que os healthy controls e que servem para testar se o IFN score também pode demonstrar ativação prévia e continua do IFN)--» nesse caso nível de IFN score não mudou muito mas padrão de anticorpos sim (análise combinada)

Artigos mais referenciados e IFN-scores mais utilizados

1) Kim, H. et al. Development of a validated IFN score using NanoString technology. J. IFN Cytokine Res. 38, 171–185 (2018). --» IFN-Score com 28 genes (IFI27, IFI44L, ISG15, USP18, RSAD2, LAMP3, IFIT1, IFI44, LY6E, IFI6, CXCL10, OAS1, SOCS1, RTP4, IFIT2, IFIT3, OASL, HERC5, OAS2, GBP1, OAS3, IFIT5, HERC6,IDO1,CD274,DDX60,MX1)

2) Não achei o primeiro artigo a propor esse mas vi que muitos utilizam esse IFN-Score--»IFN-Score com 6 genes (8IFI27, IFI44L, IFIT1, ISG15, RSAD2,SIGLEC1)

Entre os diferentes IFN-scores, quais são os IRG mais constantes?

Quais tipos de amostras seriam de maior interesse?

Controlos (incluir apenas saúdaveis, ou negativos e positivos também?)--» Vários artigos tem usados como controlos outras doenças autoimunes (ou doenças que não sejam interferonpatias, como controlos negativos junto com os healthy controls, ou interfonpatias do tipo I em estado quiescente como controlos positivos, que tem níveis expectáveis maiores que os healthy controls e que servem para testar se o IFN score também pode demonstrar ativação prévia e continua do IFN)

Limitações (IFN-score como variável bimodal, maior fonte de variabilidade interlaboratorial são os controlos utilizados, valor preditivo potencializado por análises combinadas com valores de Ab e citocinas séricas, etc)

Quais outros parâmetros poderiam ser relevantes (para SS)?

Acabar tabela da revisão de literatura

Escolher artigos mais relevantes da tabela de revisão de literatura

Ler artigos sobre esclerose sistémica para definir IFIGs que serão medidos (IFIGs mais citados na doença) - ver comentário da Julia na secção ao lado sobre isto

Ler artigos sobre ensaio clínico com IFNAR e perceber se pode ser relevante

Relação do IFN com diagnóstico da esclerose sistémica (quais as vantagens de usar um IFN score nesta doença) - ver critérios da EULAR

Perceber se existem outras moléculas que complementem o IFN score (ex: BAFF e PIIINP??)

Escolher método que será mais adequado para estabelecimento do IFN score (RT-qPCR??) e estrutura protocolo experimental de maneira simplificada (tipo de amostra e o porquê, congelamento sim/não, etc)

Estabelecer controlos (saudáveis, outras doenças autoimunes) e que critérios abranger nesses indivíduos (idade, sexo, etnia, etc)

Consoante o método escolhido, como será definido o threshold do IFN score (ver artigos que falem mais sobre threshold de scores)

Falar de especificidade e sensibilidade do método relativamente ao diagnóstico da doença

Procurar limitações do próprio método em si e do IFN score (pode não predizer o estado da doença)

Dar exemplos de scores usados para o diagnóstico de outras doenças que envolvam o IFN

colocar genes mais citados no geral na tabela em negrito e especificar no corpo do texto para a SSc

colocar no corpo do texto que há grande variabilidade entre as fórmulas

citar que no theshold de fato há semelhança e quais são

colocar SARD em último e especificar doenças que incluem

dentro de cada doença separar por metodologia

identificar genes em comum!

mais em comum na esclerose sistémica

IFN score é importante mas deve ser associado a outro biomarcadores

colocar uma frase no poster dizendo que a maioria dos artigos utilizou amostras congeladas