Este modelo indica-nos que o átomo é formado por uma pequena região central, chamada núcleo, onde existem dois tipos de partículas: os protões e os neutrões. Em volta do núcleo existe uma região muito maior que se chama de nuvem eletrónica, e é nela que se encontram os eletrões.

Apesar de os átomos serem partículas neutras (não apresentam carga elétrica), no seu interior existem partículas com carga elétrica. Assim, o núcleo tem carga elétrica positiva, porque os protões apresentam carga elétrica positiva. Os neutrões, como o seu nome indica são neutros (não têm carga elétrica). A nuvem eletrónica, por sua vez apresenta carga elétrica negativa, pois os eletrões também têm carga elétrica negativa

Segundo o sua teoria os eletrões movem-se há volta do núcleo em orbitas bem definidas, as orbitas estão associadas á sua energia e designam-se por níveis de energia. E quanto mais afastadas do núcleo estiverem maior será a energia do eletrão no nível correspondente

Ernest provou a sua teoria a partir de um experimento, que contém uma amostra do elemento radioativo polônio dentro de um bloco de chumbo. A radiação alfa (α) que saía do polônio passava por um pequeno orifício do bloco de chumbo e ia em direção a uma finíssima lâmina de ouro. Atrás dessa lâmina de ouro havia um anteparo fluorescente, pois foi recoberto de sulfeto de zinco, que mostraria uma luminosidade onde as partículas alfa incidissem.

Com isto consegui mostrar que o átomo possui uma região central chamada de núcleo atômico, onde fica praticamente toda a massa do átomo e que apresenta carga positiva, e uma região denominada de eletrosfera, onde os eletrões ficam a girar ao redor do núcleo.

A descoberta do elétron por Thomson mudou completamente a forma como as pessoas viam os átomos. Até o final do século XIX , pensava-se que os átomos eram pequenas esferas sólidas. Thomson então propôs um modelo do átomo consistindo de cargas positivas e negativas, presentes em quantidades iguais para que um átomo fosse eletricamente neutro. Ele propôs que o átomo era uma esfera, mas as cargas positivas e negativas estavam embutidas nela . Os cientistas modernos entendem que os átomos consistem em um núcleo de protões carregados positivamente e neutrões neutros, com eletrões carregados negativamente orbitando o núcleo. No entanto, o modelo de Thomson é importante porque introduziu a noção de que um átomo consiste em partículas carregadas.

Dalton propôs que toda matéria é composta por pequenas partículas indivisíveis chamadas átomos, a partir das lei da conservação de massa e das proporções.

Dalton também propôs que cada átomo de um elemento, como o ouro, são iguais a todos os outros átomos desse mesmo elemento. Ele também notou que os átomos de um determinado elemento são diferentes dos átomos de todos os outros elementos . Um átomo de sódio é diferente de um átomo de carbono. Os elementos podem compartilhar alguns pontos de ebulição e fusão e eletronegatividades similares, mas não existem dois elementos que tenham exatamente o mesmo conjunto de propriedades.

Na terceira parte da teoria atômica de Dalton, ele propõe que compostos são combinações de dois ou mais tipos diferentes de átomos. Um exemplo de um desses compostos é o sal de cozinha. O sal de cozinha é uma combinação de dois elementos diferentes com propriedades físicas e químicas únicas. O primeiro, sódio, é um metal altamente reativo. O segundo, o cloro, é um gás tóxico. Quando eles reagem, os átomos se combinam a uma razão de 1:1 para formar os cristais brancos que podemos colocar em nossa comida.

Por ultimo Dalton sugere que reações químicas não destroem ou criam átomos. Elas simplesmente os reorganizavam. Usando de novo nosso exemplo do sal, quando o sódio se combina com o cloro para formar sal, os átomos de sódio e de cloro ainda existem. Eles simplesmente reorganizam-se para formar um novo composto.

O objetivo destes filósofos era entender como a natureza é constituída, quais seus elementos mais básicos e por que acontecem as transformações que observamos.

A teoria era que por exemplo se pegarmos qualquer coisa, como uma pedra, é possível dividi-la em partes menores, pois ela é constituída por um conjunto de elementos. Porém, chegará um momento em que não será mais possível continuar com essa divisão, porque teremos chegado a partículas que “não podem ser cortadas”, ou seja, teremos chegado aos átomos que constituem a pedra