Tylko niewielki procent zdjęć został wykonany w rzeczywistych plenerach. Wszystkie pozostałe sceny nakręcono w studiu filmowym Pinewood (wcześniej powstały tam „Gwiezdne Wojny” i ostatnie odcinki przygód Jamesa Bonda). W słynnym studiu zbudowano m.in. miasteczko, w którym mieszka Charlie oraz tytułową fabrykę Willy’ego Wonki.

Duża inspiracją dla Johny’ego Deppa przy tworzeniu postaci Wylliego Wonki była postać Marylin Mansona i jego charakterystyczny image. Podczas zdjęć, wnętrze swojej przyczepy miał obklejone plakatami przedstawiającymi tego artystę oraz słuchał jego nagrań. Można przypomnieć, że przy pracy nad rolą Jacka Sparrowa z filmu „Piraci z Karaibów”, Depp podobież inspirował się postacią Keitha Richardsa, gitarzysty The Rolling Stones.

W filmie „wystąpiło” jedynie 40 prawdziwych wiewiórek. Wszystkie pozostałe stworzono przy użyciu techniki komputerowej.

Pierwszym kandydatem branym pod uwagę przez reżysera do roli Willy’ego Wonki był Marilyn Manson.

Johnny Depp był tak zachwycony rolą Freddie’go Highmore’a w „Marzycielu”, że polecił go Timowi Burtonowi do roli Charlie’go Bucketa.

John August dopiero po napisaniu scenarisza do filmu „Charlie i fabryka czekolady” oglądnął wersję z 1971r.

Scott Frank napisał dwie wersje scenariusza. Po odrzuceniu przez Burtona drugiej wersji, załamał się i odszedł z projektu.

Kiedy Charlie czyści buty Williego Wonki, w okularach postaci granej przez Deppa odbija się ekipa kręcąca film.

Jest to czwarty film nakręcony wspólnie przez Tima Burtona i Johnny’ego Deppa. Wcześniej nakręcili razem „Edwarda Nożycorękiego”, „Ed Wooda” i „Jeźdzca bez głowy”.

John August nigdy nie widział pierwszej wersji filmu „Charlie i fabryka czekolady” z 1971 roku kiedy Tim Burton poprosił go o napisanie scenariusza. Po skończeniu pracy nad scenariuszem August zobaczył w końcu oryginalną wersję filmu i był bardzo zaskoczony tym o ile bardziej pierwszy film był mroczniejszy od jego wersji.

Specjalistyczna kamera warta 540 tysięcy dolarów nie była odpowiednio zabezpieczona podczas kręcenia ujęcia wielkiej kadzi z czekolady. Rezultatem tego było to, że kamera ta wpadła do kadzi i została całkowicie zniszczona.

Na potrzeby filmu firma Nestle wyprodukowała 100 tys. tabliczek czekolady, z których tylko 1850 było jadalnych.

Richard Attenborough, Kirk Douglas, Albert Finney, Richard Griffiths, Anthony Hopkins, Armin Mueller-Stahl, Paul Newman, Max Von Sydow i David Warner to aktorzy którzy byli przesłuchiwani do roli Dziadka Joe.

Koproducentem „Charliego…” jest firma Plan B Entertainment, należąca do rozwodzącej się gwiazdorskiej pary – Brada Pitta i Jennifer Aniston. Po zakończeniu zdjęć ogłoszono, że była to ich ostatnia wspólna produkcja.

Lizaki na drzewach, gigantyczne cukierkowe trzciny i gigantyczne miętówki były zrobione z prawdziwych słodyczy.

Steve Martin, Robin Williams, Christopher Walken, Nicolas Cage, Will Smith, Brad Pitt, Mike Myers, Ben Stiller, The Rock, Bill Murray, Leslie Nielsen, Patrick Stewart, John Cleese, Eric Idle, Michael Palin, Rowan Atkinson, Robert De Niro i Michael Keaton to aktorzy którzy ubiegali się o rolę Willy’ego Wonki.

Autor literackiego pierwowzoru „Charliego…”, Roald Dahl, był oskarżany o rasizm. Doszukiwano się związków pomiędzy książkowymi karłami Oompa-Loompa a afrykańskimi Pigmejami.

206,563.48 galonów amerykańskich (około 6196904,4 litrów) sztucznej czekolady zostało użytych do zrobienia „czekoladowej” rzeki. Natomiast do zrobienia czekoladowego wodospadu zużyto 38,430.42 galonów amerykańskich (około 1152912,5 litrów) owej sztucznej czekolady.

Tim Allen, Dan Castellaneta, James Belushi, Bob Saget i Ed O’Neill to aktorzy którzy ubiegali się o rolę Pana Teavee.

Łódź Willy’ego Wonki mogła ostatecznie unosić się na czekoladzie. Budowa takiej łódki zajęła twórcom filmu 20 tygodni.

Sam Neill był brany pod uwagę przy obsadzaniu roli Pana Salt.

Rola Doktora Wonki została napisana specjalnie na potrzeby filmu, aby wzbogacić postać Willy’ego Wonki o odrobinę rodzinnych wspomnień.

Pasta do zębów w fabryce, w której pracuje tata Charliego nosi nazwę „Smilex”. Taką samą nazwę posiadał gaz, którego użył Joker do zabicia ludzi w filmie „Batman” (1988).

Deep Roy zagrał każdego Oompa-Loompa osobiście, powtarzając te same ruchy setki razy. Następnie wszystkie ruchy zostały cyfrowo przyporządkowane danej postaci, dzięki czemu każdy Oompa-Loompa reprezentuje oddzielny występ Roya. W uznaniu za wysiłek aktora, gaża Roya wzrosła do $1,000,000.

Wiele rzeczy w filmie takich jak drzewa, kwiaty itp. było tworzone przez wytwórnię czekolady Choccywoccydoodah w Brightonie, w Zjednoczonym Królestwie. Wytwórnia pokazywała i sprzedawała kreacje w sklepie, a później dawała do filmu.

Producenci chcieli aby rolę Dziadka Joe zagrał Peter Ustinov jednak aktor zmarł jeszcze przed rozpoczęciem zdjęć do filmu.

Film ten był kręcony w lipcu 2005 roku.

W roku 2003 producenci planowali aby w rolę Dziadka Joe wcielił się Gregory Peck. Jednak aktor zmarł jeszcze przed rozpoczęciem zdjęć do filmu.

Jim Carrey i Adam Sandler byli brani pod uwagę do roli Willy’ego Wonki.

Steve Martin, Nicolas Cage, Michael Keaton, Robin Williams i Christopher Walken mieli szansę zagrać rolę Willy’ego Wonki. Ostatecznie wybrano Johnny’ego Deppa.

Śpiewający głos Oompa-Loompa należał do samego Danny’ego Elfmana, który już nie raz podkładał głos pod różne postaci.

Słowa do czterech z pięciu piosenek wykonywanych w filmie były autorstwa Roalda Dahla, twórcy książki na podstawie której powstał film.

Zdjęcia do filmu kręcono w Buford (stan Georgia) w USA, Gengenbach (Badenia-Witenbergia) w Niemczech oraz w Yorku (hrabstwo Północne Yorkshire), studio Pinewood Studios w Iver Heath (hrabstwo Buckinghamshire) i Londynie w Anglii (Wielka Brytania).