El clima del Chinchasuyo variaba desde el desértico costero hasta el frío de montaña. La red hidrográfica del Chinchasuyo se conforma por ríos como el Marañón, Santa, Chicama, etc. La fauna contaba con aves, por ejemplo palomas, tórtolas, picaflores, halcones, águilas, perdices, entre otros. La vegetación del Chinchasuyo variaba desde el desierto costero hasta los Andes. En la costa principalmente hayamos plantas como el molle, las cactáceas columnares, el palo santo, etc.

Collasuyo contaba con una vegetación variada desde el desierto costero hasta la selva amazónica. En las zonas altas encontramos mayormente plantas adaptadas al frío como el ichu, la puya raimondi y arbustos como la tola. Por otro lado también hay hay una gran variedad de camélidos como la llama, alpaca, vicuña y guanaco. Es una zona con varios accidentes geográficos como desiertos, valles, mesetas, lagos, nevados y volcanes. Los mas destacables siendo el altiplano andino, el lago Titicaca, la cordillera de los Andes y la selva amazónica. En las zonas altas se haya un clima frío de montaña con heladas y nevadas. El Collasuyo se conformo de ríos caudalosos como el Amazonas, Ucayali, Madre de Dios, Beni, Mamoré, Pilcomayo, Bermejo, Salado, Maule, etc.