Essa reprodução é por endodiogenia (formação de células-filhas dentro da célula-mãe) para taquizoítas, endogenia para braquizoítas e por esquizogonia para os esporozoítas, que são as três formas que conseguem invadir o epitélio hospedeiro por possuírem o complexo apical.

2) Os merozoítas continuam se multiplicando continuamente, de forma que rompem a célula hospedeira parasitada e ficam livres para invadir outras células do epitélio intestinal. Uma vez dentro de uma nova célula, podem repetir esse ciclo assexuado ou, eventualmente, podem se diferenciar em gametócitos.
3) Esses gametócitos sofrem maturação e se diferenciam em microgametas (masculinos) e macrogametas (femininos). Os primeiros são móveis e flagelados e assim conseguem sair da célula hospedeira para fecundar os macrogametas, que permanecem no interior de outra célula. Com a fecundação forma-se o zigoto, que produz uma parede cística, originando um oocisto. Este é então liberado para o lúmen do intestino delgado ao romper a célula em que estava e é eliminado (não esporulado) junto às fezes do felino. 
4) Após alguns dias e sob condições favoráveis, esses oocistos, já no ambiente, sofrem esporulação, formando dois esporocistos, com quatro esporozoítas em cada um deles. 
Esse oocisto maduro pode ser ingerido por um hospedeiro intermediário ou definitivo, iniciando um novo ciclo.

3) Com a produção de anticorpos específicos contra a infecção, as formas livres do parasito desaparecem e ele começa a se multiplicar mais lentamente no interior das células e sintetizar uma membrana cística, formando cistos para se proteger do sistema imune do hospedeiro.
4) Esses cistos teciduais, que contêm o parasito na forma de bradizoítas, caracterizam a fase crônica da infecção por Toxoplasma gondii. Eles podem permanecer quiescentes por vários anos e, eventualmente, voltarem à fase aguda. A ingestão desses cistos por outros hospedeiros (definitivos ou intermediários) também pode desencadear um novo ciclo evolutivo.