El seu model explica que l'àtom té una estructura interna. El model de Rutherford consisteix en el que l'àtom té un nucli petit que conté partícules en càrrega positiva que es diuen protons. Els electrons que són la càrrega negativa, volten al voltant del nucli.

Va estudiar sobretot l'estructura interna de l'àtom. En el seu model, els electrons es mouen en òrbites circulars al voltant del nucli. També diu que hi ha diferents nivells d'energia en les òrbites dels electrons.

El model consisteix en el fet que els electrons passen a ser ones de matèria. Per això els electrons es poden moure pel voltant del nucli. Ell va crear la seva pròpia equació que permet saber l'energia dels electrons. Amb aquesta equació podem tenir més informació. També ens pot dir l'estructura dels àtoms o les molècules. És el model més precís.

El seu model és base en el fet que la matèria està formada, per partícules molt petites i invisibles que són els àtoms.

La primera part de la teoria diu que tota la matèria està formada per àtoms, que són indivisibles. La segona part de la teoria diu que tots els àtoms d'un element, són idèntics en massa i en propietats.