genomics in breast cancer by Filipa Costa https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933 en-us 2023-05-01 20:29:21 UTC 2023-05-26 14:17:55 UTC hello@padlet.com maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2574194617 2023-05-01 20:30:39 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2574194617 Cancro da mama maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575127203 Globalmente, o Cancro da Mama é um dos tipos mais comuns que afetam as mulheres, representando um terço dos diagnósticos de cancro.
Existem variados tipos de cancro da mama consoante o tipo de célula, a sua localização e a forma como se desenvolve. Embora a etiologia ainda seja desconhecida, o perfil genético permite a separação em subtipos moleculares. Atualmente, as formas mais comuns de classificar o cancro da mama são por análise do perfil de expressão do recetor de estrogénio (Erα), recetor de progesterona (PR) e do human epidermal growth factor 2 (HER2).]]> 2023-05-02 12:39:41 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575127203 Metástase maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575209456 Comumente ao cancro da mama, estão associadas as metástases esqueléticas, sendo os ossos um dos locais mais comuns para o cancro da mama metastizar.
O osteotropismo depende muito da assinatura genética das células malignas, logo pacientes com certos subtipos estão mais propensos a metástases nos ossos.]]> 2023-05-02 13:38:15 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575209456 maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575221436 2023-05-02 13:45:55 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575221436 maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575235112 D. H. Kim, Y. S. Kim, N. Il Son, C. K. Kang, and A. R. Kim, “Recent omics technologies and their emerging applications for personalised medicine,” IET Syst. Biol., vol. 11, no. 3, pp. 87–98, 2017, doi: 10.1049/iet-syb.2016.0016. 

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]]> 2023-05-02 13:55:19 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575235112 Biomarcadores mluiz1 https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575633116 São moléculas específicas que podem ser usadas como indicadores de diagnóstico e progressão de doenças, e resposta a tratamentos.
Podem ser proteínas, ácidos nucleicos, metabólitos e outras moléculas presentes no sangue, urina, tecidos ou outros fluidos corporais 
A expressão de genes, a estrutura do DNA e a modificação epigenética podem influenciar a presença ou ausência de biomarcadores.

]]> 2023-05-02 18:39:28 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575633116 O que é a genómica? maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575656239 A genómica é a ciência interdisciplinar responsável pelo estudo dos genes e a sua função. Inicialmente, o foco da genómica foi a sequenciação de genomas, sendo atualmente aplicada em inúmeras aplicações, como no desenvolvimento de novos mecanismos de diagnóstico e novas terapêuticas.]]> 2023-05-02 18:58:57 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575656239 Cancro da mama e genómica maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575665115 A genómica é uma ferramenta aliada no que toca ao diagnóstico do cancro da mama.
A genómica pode ser utilizada para diagnóstico, pela deteção de biomarcadores comumente expressos num paciente com esta patologia, como também pode ser utilizada para a classificação do cancro de acordo o perfil de expressão.
A genómica no cancro é essencial também para a descoberta de novos genes envolvidos na patologia que possam estar envolvidos no desenvolvimento de novas terapias.
A aliança da genómica ajuda a diagnósticos precoces e melhores prognósticos.]]> 2023-05-02 19:06:46 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2575665115 Objetivo principal mluiz1 https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2576472573 Discutir a importância das técnicas de ómicas, como a genómica, proteómica, metabolómica e epigenómica, para o estudo dos mecanismos moleculares subjacentes à doença e para informar abordagens personalizadas de diagnóstico e tratamento. ]]> 2023-05-03 09:04:52 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2576472573 Ómicas e medicina de precisão mluiz1 https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2576487002 A análise dos dados de ómicas pode revelar informações sobre a predisposição genética do paciente para determinadas doenças, bem como as alterações moleculares subjacentes a essas doenças em nível celular e molecular. 
Ao personalizar o tratamento com base nos resultados da análise de ómicas, a medicina de precisão pode ser mais eficaz do que os tratamentos convencionais 

]]> 2023-05-03 09:18:17 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2576487002 3D genomics maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2577112206 Disciplina que estuda a estrutura tridimensional da cromatina e função tridimensional dos genomas. Foca no estudo da conformação 3D e a regulação da função intranuclear de genomas- replicação de DNA, recombinação de DNA, genome folding, entre outras. A genómica 3D engloba estudos feitos não só na genómica como na epigenómica com o desenvolvimento das técnicas de self-chromosomal conformation capture (3C). Estas técnicas high-throughput são uma alternativa muito mais rápida com uma capacidade enorme de obtenção de dados, essencial para o futuro da aplicação da genómica na medicina personalizada.]]> 2023-05-03 17:48:43 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2577112206 Abstract filipadac https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594623442 O Cancro da Mama (CM) apresenta-se como a forma mais prevalente de cancro, sendo a principal causa de morte relacionada com o cancro em mulheres. Um grande número de pacientes com CM experiencia metástases esqueléticas, quais pode resultar em complicações graves (conhecido como skeletal-related events), impactando drasticamente a qualidade de vida e sobrevivência do paciente. Desta forma, a identificação de biomarcadores capazes de estratificar o risco de pacientes com CM desenvolverem metástases ósseas (MO) é fundamental para definir estratégias de diagnóstico e terapias personalizadas, principalmente na fase inicial da doença. 
Neste sentido, as ómicas impulsionaram a investigação de diversos biomarcadores promissores para a tendência do CM se espalhar pelos ossos. Incluindo genes desregulados, proteínas e microRNAs. A presente revisão aborda o conhecimento atual sobre o desenvolvimento de MO em casos de CM e explora os estudos mais recentes que descrevem possíveis biomarcadores de MO, com base na aplicação das ómicas no estudo do CM.]]> 2023-05-17 12:06:08 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594623442 Tecnologias ómicas filipadac https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594690719 As tecnologias ómicas foram desenvolvidas com o objetivo de recolher grande quantidade de dados de uma só vez, num curto período de tempo com alto rendimento. Estas possibilitam o estudo de toda a atividade celular a nível molecular de tecidos e órgãos. Para além de apenas se conseguir interpretar qualitativamente as diferentes moléculas em estudo, consegue-se também fazê-lo de forma quantitativa. Devido à grande sensibilidade, especificidade e precisão desta tecnologia, permite uma deteção rápida dos principais biomarcadores de diferentes doenças. 

Existem várias vertentes: genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica, entre outros.]]> 2023-05-17 12:59:45 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594690719 filipadac https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594698442 Osteotropismo:  refere-se à capacidade de certas substâncias, como medicamentos ou células, de se direcionarem seletivamente ao tecido ósseo. Usado frequentemente em contexto tratamento de cancro, onde agentes osteotrópicos são utilizados para direcionar e destruir as células cancerígenas que se espalharam para os ossos.

BTM: bone turnover markers]]> 2023-05-17 13:05:37 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594698442 Atualmente maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594789262
  • NGS
  • FISH 
  • Microarray analysis 
  • RT-PCR 
  • Nanostring 
  • Gene expression analysis 
  • Computational analysis 
    • ]]>     2023-05-17 14:05:19 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594789262     Com genómica 3D maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594797909
  • Hi-C 
  • ChIA-PET 
  • GAM
  • SPRITE 
    • ]]>     2023-05-17 14:11:12 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594797909     Métodos utilizados maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594805410 Atualmente, os métodos mais tradicionais são aplicados em vários testes clínicos, tanto em linhas celulares como em amostras de pacientes.
    Os métodos mais sofisticados de genómica 3D ainda se mantêm pelos estudos em linhas celulares ou computacionais por ainda terem muitas limitações quando aplicados a dimensões maiores.]]>     2023-05-17 14:16:34 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594805410     Biomarcadores neoplásicos maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594816255 No diagnóstico e caracterização do cancro da mama já se faz um perfil de expressão de três biomarcadores: Erα, PR e HER2.
    Outros associados à ocorrência de neoplasias são: fosfatase alcalina (ALP) e marcadores tumorais do soro (ex.: CA 15.3 e CA 125)]]>     2023-05-17 14:24:08 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594816255     Biomarcadores BTM maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594825149 A deteção deste tipo de biomarcadores é essencial para a melhor compreensão dos mecanismos celulares envolvidos na metástase mama-osso.
    Uma vez que o seu nível de expressão está alterado em maioria das células cancerígenas, outros potenciais biomarcadores são:
    • MAF 
    • CXCR4 
    • FGF5 
    • IL-6 
    • IL-11 
    • FOXF2
    Tal como maioria dos biomarcadores, o nível/concentração destes será sempre influenciado pelo paciente e não podem ser tomados como uma forma final de diagnóstico.
    ]]>     2023-05-17 14:30:26 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2594825149     Osteotropismo em Cancro da Mama tiagojoaosantosmarques25 https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596104001 No campo de pesquisa do "osteotropismo", foram efetuadas várias análises mutacionais em amostras de cancro da mama, na tentativa de identificar a presença de hotspots de mutações somáticas em 50 genes comummente relacionados com o cancro. Esta análise foi efetuada por sequenciamento de próxima geração (next-generation sequencing).

    A aplicação de técnicas genómicas levaram à identificação, nalgumas linhas celulares, de uma aberração associada ao número de cópias de fator de transcrição que regula a expressão de vários genes envolvidos na propagação do cancro da mama para o tecido ósseo.
    Após esta aplicação, observou-se que o fator de transcrição MAF, quando sobre-expresso, está associado com um alto risco nalgumas características do tumor primário e a um pior prognóstico em pacientes de cancro da mama em estado pré-menopausa.]]>     2023-05-18 10:26:04 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596104001     Identificação de um perfil genético associado ao osteotropismo no cancro da mama tiagojoaosantosmarques25 https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596185045 Esta foi uma das primeiras tentativas de estabelecer uma identificação de osteotropismo associado ao cancro, tendo em conta os perfis genéticos de várias linhas celulares, utilizando a análise por microarray. Com isto, foram identificados vários genes que, na sua maioria, codificavam para proteínas da superfície celular ou secretadas, tendo um papel fundamental em várias etapas do cancro da mama, como a invasão celular ou o direcionamento para o esqueleto, bem como ativação da osteoclastogénese e ativação de osteoclastos.]]> 2023-05-18 12:11:06 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596185045 RT-PCR tiagojoaosantosmarques25 https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596203997 Em estudos seguintes, foi identificada uma sobre-expressão do gene IL-1 beta em linhas celulares de cancro da mama por Real-Time PCR. Esta expressão estaria associada com o direcionamento do tumor para o tecido ósseo e, por isso, foram analisados, posteriormente, algumas amostras de pacientes com cancro da mama que tinham passado por períodos longos de tratamento anti-cancerígena, por imunohistoquímica (IHC). Foi observada uma correlação significativa entre os níveis deste biomarcador e o desenvolvimento subsequente de metástases ósseas.]]> 2023-05-18 12:33:00 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596203997 Dados obtidos no artigo tiagojoaosantosmarques25 https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596206095 Claramente, o enorme número de dados resultantes de uma investigação tão extensa confirma a importância deste tópico e a elevada complexidade e heterogeneidade dos tumores malignos da mama, cuja caracterização molecular está, provavelmente, longe de estar concluída. Nenhuma das assinaturas mencionadas entrou atualmente na prática clínica de rotina, o que sugere a necessidade de mais investigação prospectiva.

    Este grande número de dados, e o seu respetivo tratamento, é facilitado com os atuais repositórios e bancos de dados disponíveis para matérias científicas, nomeadamente as bases de dados primárias, numa primeira instância, para investigadores colocarem os seus resultados primordiais.]]>     2023-05-18 12:35:19 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596206095     microRNAs tiagojoaosantosmarques25 https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596567520 RNAs não codificantes (ncRNAs) são reguladores críticos de processos celulares. Em particular, miRNAs são pequenos ncRNAs que atuam como modeladores epigenéticos, visando o turnover de mRNAs específicos, através dos quais regulam um número elevado de processos, incluíndo a transdução de sinais, ciclo celular, proliferação celular e metabolismo. Através disto, os miRNAs têm sido investigados pela sua capacidade de participar no processo de propagação óssea e como potenciais biomarcadores para a colonização esquelética do cancro da mama.]]> 2023-05-18 17:27:55 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596567520 maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596644975 O cancro é uma doença multifatorial que envolve várias alterações genéticas durante a sua evolução.
    A compreensão destas alterações é uma das chaves necessárias para futuras técnicas de diagnóstico e tratamento.
    As ómicas permitem a obtenção de uma enorme quantidade de dados, sendo a genómica e também a epigenómica áreas essenciais para desvendar e entender as alterações que ocorrem nas células cancerígenas.]]>     2023-05-18 18:41:24 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596644975     Limitações atuais maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596659081 Embora existam várias técnicas na genómica que permitam já obter muita informação sobre potenciais biomarcadores para neoplasias malignas e metástases, a informação atual ainda é muito pouco explorada para ser aplicada.
    Para além da genómica é necessário integrar as outras ómicas para conseguir explicar maioria das informações obtidas.
    A genómica 3D apresenta técnicas para a obtenção mais rápida de dados mais integrativos entre ómicas (essencialmente epigenómica) e mais explicativos dos mecanismos celulares e moleculares desta patologia.]]>     2023-05-18 18:56:49 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596659081     Perspetivas futuras maleluia https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596661342 Os estudos das ómicas deverão ser aplicados cada vez mais em estudos pré-clínicos e clínicos de forma a definir cada vez mais biomarcadores que possam de facto ser aplicados na clínica e facilitar tanto o diagnóstico como o tratamento e prognóstico dos pacientes oncológicos.]]> 2023-05-18 18:59:15 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596661342 Recentemente tiagojoaosantosmarques25 https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596744137 Foi desenvolvido um sistema de pontuação associado aos miRNAs, utilizando uma abordagem bioinformática aplicada a um número elevado de pacientes. Um score alto, determinado em amostras do tumor primário, está correlacionado significativamente com um prognóstico fraco de pacientes com cancro da mama e associado a um risco elevado de metástases ósseas.

    Os resultados dos vários estudo associados aos miRNAs sugerem que estas moléculas podem atuar não apenas como potenciais biomarcadores de prognóstico para colonização esquelética, mas também como alvos terapêuticos promissores para restaurar a homeostasia fisiológica do osso e contra-atacar a destruição induzida pelo cancro. Apesar destes resultados, é necessária uma investigação clínica aprofundada antes de qualquer aplicação clínica destas moléculas. ]]>     2023-05-18 20:53:28 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596744137     Investigação de osteotropismos tiagojoaosantosmarques25 https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596747049 Vários péptidos têm sido investigados como potenciais biomarcadores de predição de cancro da mama. Num artigo de revisão, um painel de proteínas incluía moléculas envolvidas em processos celulares, como a proliferação, diferenciação e adesão, bem como a sinalização de quimocinas e mineralização óssea.
    Através de LC/MS/MS, foi identificado um número de péptidos sobre-regulados significativamente nas populações de células do tecido ósseo danificadas, sendo estes péptidos investigados como possíveis biomarcadores de prognóstico.

    Utilizando uma abordagem proteómica quantitativa (SILAC-MS), foi possível identificar outra proteína sobre-expressa (DOCK4) no tecido ósseo.

    A expressão do recetor alfa do estrogénio (ERRalfa) tem sido correlacionada com o carácter invasivo das células tumorais. Uma análise de transcriptómica em amostras de cancro da mama confirmou esta assoicação, levando ao desenvolvimento de uma inibição farmacológica pré-clínica do ERRalfa, através de um agonista inverso específico, o qual consegue reduzir o crescimento do tumor primário e a formação de micro-metástases ósseas em ratinhos.

    ]]>     2023-05-18 20:58:46 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596747049     tiagojoaosantosmarques25 https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596829226 O estudo de terapias alternativas para o tratamento do cancro em humanos requer, na maioria das vezes, alguns passos de experimentação em modelos animais, antes de poderem ser testados em indivíduos da espécie humana. Esta experimentação representa um assunto que deverá ser discutido de um ponto de vista ético, no qual, nos últimos tempos, tem havido uma tentativa de diminuir, ou mesmo eliminar, a utilização de modelos animais em temas de pesquisa como o cancro.]]> 2023-05-18 23:38:55 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2596829226 filipadac https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2606256424 apresentação]]> 2023-05-26 14:17:55 UTC https://padlet.com/filipadac/wxa1puam3x69g933/wish/2606256424