La úlcera gastroduodenal y la enfermedad por reflujo gastroesofágico constituyen enfermedades motivadas por la acidez gástrica, por lo que el tratamiento se orienta a reducir la secreción de ácido, los fármacos que logran este objetivo son fundamentalmente los inhibidores de la bomba de protones y los antihistamínicos h2. Los inhibidores de la bomba de protones son fármacos anti secretores que actúan sobre la bomba de protones de la célula parietal, bloqueando la enzima hidrógeno potasio ATP ASA, los inhibidores de la bomba de protones se utilizan en el manejo de las enfermedades relacionadas con el ácido gástrico incluyendo la úlcera duodenal, úlcera gástrica, enfermedad por reflujo gastroesofágico, esofagitis erosiva, la infección por Helicobacter Pylori y los síndromes hiper secretores como el síndrome de Zolinger Ellison, también son utilizados como gastro protectores en los pacientes tratados con AINES. Los inhibidores de la bomba de protones disponibles son omeprazol, Lansoprazol, Pantoprazol y esomeprazol. Respecto a su absorción y biodisponibilidad es similar para todos ellos, aunque puede haber diferencias en la rapidez de acción entre unos y otros. 

La recomendación es tomarlas antes del desayuno, en comparación con los antagonistas h2 tienen un efecto superior en la supresión de la secreción gástrica de ácido y en la estimulación de la cura de la úlcera gastroduodenal. Son los fármacos de elección en el tratamiento de las úlceras relacionadas con Helicobacter pylori ya que inhiben el crecimiento de la bacteria, en general provocan pocas de acciones adversas, las más habituales son náuseas, diarreas y cefalea, raramente se asocian con alteraciones de la función hepática, reacciones de hipersensibilidad y deficiencia de vitamina b12. Los antagonistas h 2 actúan bloqueando el receptor de histamina de la célula parietal, los más representativos son cimetidina ranitidina famotidina nizatidina y roxatidina, presentan diferencias de potencia, duración, y rapidez de acción, pero en general se pueden utilizar indistintamente. Las concentraciones plasmáticas máximas se alcanzan entre una y tres horas después de su administración y son eliminados tanto por excreción renal como por metabolismo hepático por ello en pacientes con alteraciones hepáticas o renales conviene ajustar la dosis para mejorar al máximo su efectividad. Es recomendable tomarlos antes de realizar una actividad que pudiera desencadenar los síntomas del reflujo, comidas, ejercicio físico, etcétera . En general son fármacos bien tolerados y raramente presentan efectos secundarios en raras ocasiones han dado lugar a ginecomastia, alteración de la función hepática y reacciones de hipersensibilidad. Las reacciones adversas son más frecuentes cuando se administran por vía intravenosa, la cimetidina atraviesa la placenta y se elimina por la leche materna por lo que debe evitarse su uso en embarazo y lactancia.