Masjid Sultan Abu Bakar mempunyai desain arsitektur yang menggabungkan unsur-unsur unik dan menarik dari pelbagai budaya, mencerminkan pengaruh Melayu, Inggeris, dan Arab. Beberapa aspek penting mengenai desain arsitektur masjid ini termasuk:

1- Direka oleh Arkitek Melayu: Masjid ini direka oleh Tuan Haji Mohamed Arif bin Punak, seorang arkitek Melayu yang terinspirasi oleh senibina Viktoria yang popular pada zaman itu.

2- Pengaruh Inggeris: Desain masjid ini mencerminkan pengaruh budaya Inggeris, yang sejajar dengan kegemaran Sultan Ibrahim terhadap budaya Inggeris. Hal ini dilihat dalam elemen-elemen seperti menara berbentuk jam Inggeris dan kubah utama yang memiliki elemen bintang lima sudut yang melambangkan lima rukun Islam.

3- Pengaruh Arab: Meskipun ada pengaruh Inggeris yang jelas, masjid ini juga mempertahankan unsur-unsur Arab, termasuk lengkungan-lengkungan pintu dan tingkap, ukiran-ukiran kayu dan batu, serta hiasan-hiasan geometri dan kaligrafi.

4- Elemen Melayu: Masjid ini juga memperlihatkan unsur-unsur Melayu dalam bentuk-bentuk bumbung, tiang-tiang kayu, dan penggunaan warna-warna cerah seperti kuning, hijau, dan biru.

5- Simbolisme Islam: Menara-menara masjid yang berbentuk jam Inggeris melambangkan empat fasa bulan dalam kalendar Islam, sementara kubah utama berbentuk bawang dengan warna biru dan putih melambangkan langit dan awan. Atap masjid yang berbentuk limas dengan warna merah dan putih juga melambangkan bendera Johor.

2) Menggabungkan kesederhanaan dan keanggunan.

Daripada struktur, kedudukan setiap bahagian hinggalah penggunaan warna pada perincian, seni bina Islam menekankan semua aspek yang perlu mematuhi syariah.

Ia merupakan salah satu usaha YTM Tunku Mahmud Ibni Almarhum Sultan Tajudin Mukarram Shah pada 22 Rabiul Awal 1330 H bersamaan dengan 11 Mac 1912.

Sebenarnya, sebelum tercetusnya ilham untuk membina masjid ini, masyarakat Kedah menggunakan masjid yang lama dan kecil berbumbungkan nipah.

Disebabkan penduduk yang semakin berkembang dari masa ke masa dan memerlukan ruang yang lebih besar untuk beribadah dan bersosialiasi, pemerintah ketika itu memutuskan untuk membina masjid baharu bagi menggantikannya.

Malah, tapak masjid ini juga dikatakan merupakan makam pahlawan Kedah yang gugur dalam serangan Siam di Kedah pada tahun 1821.

Pembinaan masjid ini telah memakan masa selama tiga tahun dan siap sepenuhnya pada tahun 1915. Ia telah dirasmikan oleh DYMM Almarhum Sultan Abdul Hamid Halim Shah pada 6 Zulhijjah 1333 H bersamaan 15 Oktober 1915.

Menariknya, perasmian ini disekalikan dengan Solat Jumaat dan Tunku Mahmud sendiri yang menggalas tugas sebagai pembaca khutbah ketika itu manakala sultan telah menjadi imam solat Jumaat.

Masjid ini mula dibina pada tahun 1893. Upacara perletakan batu asas Masjid Abu Bakar telah disempurnakan pada 1 Muharram 1310 Hijrah bersamaan 26 Julai 1892 Masihi dan siap sepenuhnya pada tahun 1900. Jurutera yang bertanggungjawab ke atas pembinaan masjid ini ialah YB Dato' Yahya Awaluddin. Manakala pelukis pelan dan kerja-kerja pembangunan masjid oleh Tuan Haji Mohamad Arif bin Punak.

Masjid yang menelan belanja sebanyak RM 400,000 ini telah dibuka dengan rasmi oleh DYMM Sultan Ibrahim ibni Almarhum Sultan Abu Bakar dan diberi nama Masjid Abu Bakar mengambil sempena nama ayahanda baginda Almarhum Sultan Abu Bakar yang menitahkan pembinaan masjid ini.

Masjid Abu Bakar ini mula digunakan buat pertama kalinya pada hari Jumaat 1 Syawal 1317 Hijrah bersamaan 2 Februari 1900 Masehi untuk Sembahyang Jumaat. Masjid ini dapat menampung lebih 2500 orang jemaah bagi satu-satu waktu. Masjid yang masih teguh dan digunakan sehingga kini ini mempunyai ciri-ciri rekabentuk masjid-masjid di Asia Barat. Masjid Abu Bakar mempunyai menara dua tingkat iaitu bulat di bahagian atas dan empat segi di bahagian bawah serta berkubah.

Ciri seni bina Masjid Zahir ini mempunyai pengaruh Timur Tengah dan India dengan berlatarbelakangkan tulisan-tulisan khat dan juga 5 kubah yang melambangkan 5 rukun Islam.

Masjid ini juga turut terinspirasi oleh Masjid Azizi yang terletak di Sumatera Utara. Ia merupakan peninggalan Kesultanan Langkat dan merupakan masjid paling cantik di Nusantara.

Masjid Kampung Laut merupakan sebuah masjid tertua yang masih wujud di Kelantan dan di antara yang tertua di Nusantara. Masjid ini dikatakan dibina dalam abad yang ke-18 oleh pengembang Islam yang berulang-alik antara Champa dan Jawa dengan bantuan penduduk tempatan. Tapak asal masjid ini terletak di Kampung Laut, Tumpat di pinggir Sungai Kelantan.

Sehingga 1966, masjid ini digunakan sebagai tempat beribadat yang utama oleh penduduk di sekitar Kampung Laut. Akan tetapi masjid ini rosak akibat banjir yang melanda Negeri Kelantan pada penghujung tahun 1966 dan awal tahun 1967. Kerajaan Negeri telah menutup masjid tersebut dan membina sebuah masjid yang baru di tempat yang lebih selamat. Pada November 1967, Kerajaan Negeri dengan kerjasama Persatuan Sejarah Malaysia di Muzium Negara telah merombak bangunan Masjid Kampung Laut dan membina semula di tapak barunya di Nilam Puri mengikut bentuk yang asalnya serta menggunakan semua bahan yang lama seberapa yang boleh. Walau bagaimanapun, hanya sebahagian ruang utama masjid sahaja yang dapat didirikan semula.

• Pada tahun 1914, masjid ini menjadi tempat perhimpunan rakyat Johor untuk menyambut kepulangan Sultan Ibrahim selepas lawatan ke Eropah.

• Pada tahun 1957, masjid ini menjadi saksi penyerahan kuasa dari British kepada Malaysia, menandakan peralihan penting dalam sejarah politik Malaysia.

• Pada tahun 1923, Jambatan Johor-Singapura diresmikan, dan masjid ini turut memainkan peranan dalam peristiwa ini.

• Pada tahun 1940, Bangunan Sultan Ibrahim juga diresmikan dalam sebuah upacara penting.

Pada asalnya, masjid ini mempunyai bentuk yang sama dengan Masjid Agung Demak di Jawa dan Masjid Kono di Champa. Pembinaan masjid ini menggabungkan banyak unsur-unsur seni dan falsafah keagamaan pada bentuk senibinanya.

Rumah ibu bertingkat tiga dikaitkan dengan falsafah ketuhanan. Lapisan bawah diibarat penuh dengan kekotoran, makin ke atas semakin bersih akhirnya menuju ke alam luas yang tidak terbatas terlepas dari sebarang bentuk dan ianya kembali kepada Allah S.W.T.

Kemahsyuran rekabentuk Masjid Kampung Laut yang unik telah menjadi suatu lambang kemegahan rakyat negeri Kelantan. Penampilan bentuk bumbung bersegi tiga (bertenggek/ bertingkat) menirus ke atas, buah gutung dan menorah adalah lambang keunggulan Masjid Kampung Laut yang sekaligus menyemarakkan lagi keagungan Islam di Kelantan.

Terdapat banyak bangunan kerajaan menerapkan identiti masjid ini dengan mengaplikasikan rekabentuk bumbung bertingkat tiga lapis dan buah gutung seperti bangunan Pejabat Setiausaha Kerajaan Kelantan, Pejabat Menteri Besar dalam Kota Darul Naim, bangunan Majlis Agama Islam Kelantan dan Jabatan Hal Ehwal Agama Islam Kelantan.