Pangeran Hidayatullah II hanya diangkat sebagai mangkubumi pada 9 Oktober 1856. Sedangkan Pangeran Anom ternyata mendapat masalah dengan Residen Belanda sehingga diasingkan ke Bandung, Jawa Barat.

Penobatan Pangeran Tamjidillah II oleh Belanda memicu perlawanan di luar istana. Dari pedalaman, Panembahan Muning atau Aling, yang pernah mengabdi kepada Sultan Adam, memimpin penentangan terhadap keputusan sepihak tersebut.

Panembahan Muning berpendapat, dalam situasi saat itu, yang paling pantas naik takhta adalah Pangeran Antasari, keponakan Pangeran Hidayatullah II. Pangeran Antasari berhak menjadi sultan karena ia keturunan Sultan Muhammadilah, Sultan Banjar yang bertakhta pada 1759-1761.

Pasukan Muning berhasil membakar tambang dan pemukiman orang Belanda. Beberapa kejadian inilah yang menjadi penyebab meletusnya Perang Banjar.

Belanda memberhentikan Sultan Tamjidillah II dari takhta pada 25 Juni 1859 dan mengasingkannya ke Bogor karena situasi yang semakin panas. Belanda kemudian menawarkan takhta sultan kepada Pangeran Hidayatullah II.

Upaya tersebut dilakukan Belanda untuk menekan potensi kerusuhan akibat serangan dari pasukan pimpinan Pangeran Antasari. Pangeran Hidayatullah II menolak dan justru memilih bergabung dengan Pangeran Antasari untuk melawan Belanda.

Oleh pendukungnya, Pangeran Hidayatullah II kemudian dinobatkan menjadi Sultan Banjar di Amuntai pada September 1859. Belanda marah dan menghapus Kesultanan Banjar pada 11 Juni 1860.

Pasukan gabungan Pangeran Antasari dan Pangeran Hidayatullah II benar-benar merepotkan Belanda. Maka, Belanda mulai memikirkan taktik licik agar bisa memecah kekuatan tersebut.

Belanda menerapkan strategi liciknya dengan menyandera ibu Pangeran Hidayatullah II. Situasi ini membuat Pangeran Hidayatulah II akhirnya dapat ditangkap pada 2 Maret 1862.

Yanuar Ikbar dalam "Pelurusan Sejarah Perang Banjarmasin (1859-1863)" yang dimuat di laman resmi Badan Penelitian dan Pengembangan Daerah (Balitbangda) Provinsi Kalimantan Selatan (2016) mengungkapkan, Pangeran Hidayatullah II dibawa ke Martapura, kemudian diasingkan ke Cianjur pada 3 Februari 1862.

Pangeran Antasari kemudian dinobatkan sebagai Sultan Banjar oleh rakyat Banjar dan Dayak pada 14 Maret 1862.

Belanda menambah pasukan dengan mendatangkan bantuan dari Batavia untuk menghadapi Pangeran Antasari. Situasi ini membuat Pangeran Antasari harus menerapkan strategi perang gerilya karena kalah jumlah pasukan.

Dalam menjalankan perang gerilya, Pangeran Antasari terserang penyakit cacar dan paru-paru. ia kemudian meninggal dunia pada 11 Oktober 1862.

Perang Banjarmasin pun mendekati akhir sepeninggal Pangeran Antasari. Para tokoh pemimpin rakyat yang tersisa dibunuh, ditangkap, atau diasingkan oleh Belanda.

Atas perjuangan dan jasa-jasanya, Pangeran Antasari ditetapkan oleh pemerintah RI sebagai Pahlawan Nasional dan Kemerdekaan pada 27 Maret 1968.