Se distinguen los siguientes tipos de bosque: bosque de laderas bajas, ríos y orillas de quebradas (400-950 m), bosque de laderas altas (950- 1.500 m) y bosques de crestas y cimas de montañas (1.500-2.300 m). Casi toda el área se mantiene en estado prácticamente prístino; sin embargo, hay zonas habitadas por indígenas Cofán que practican actividades de subsistencia (agricultura, caza, pesca) .

También se han registrado 42 especies de mamíferos grandes, incluyendo al menos 12 amenazados de extinción, como el tapir andino (Tapirus pinchaque), el armadillo gigante (Priodontes maximus), el perro de monte (Speothos venaticus) y el zorro de oreja corta (Atelocynus microtis). Es notable la presencia de 12 especies de primates, además del oso de anteojos (Tremarctos ornatus) y otros mamíferos grandes, así como algunas potenciales especies nuevas. En cuanto a anfibios y reptiles, se han registrado 31 especies, incluyendo también especies potencialmente nuevas.