El sustituto de Plaza fue Lizardo García, aunque solo estuvo en el poder durante un año, entre 1905 y 1906. Un golpe de Estado devolvió la presidencia a Alfaro, quien la mantuvo hasta 1911.

Entre los puntos recogidos en la Constitución se encontraban la eliminación de la pena de muerte, el establecimiento de la libertad de culto y la posibilidad de que todo habitante del país fuera ciudadano.

Por otras parte, se reorganizaron las instituciones públicas, se modernizaron las infraestructuras y se promocionó el papel de la mujer en la sociedad.

En otros aspectos, estos gobiernos dieron al matrimonio, al registro civil y al divorcio un carácter civil, eliminando el control total que la Iglesia tenía sobre estos temas. Además, introdujeron la educación laica y gratuita.

Las bases del alfarismo quedaron decepcionadas por el retraso en la implantación de estos asuntos. Esto, unido a la aparición de una nueva clase oligárquica, acabó con el proyecto liberal. El punto final vino marcado por el asesinato de Alfaro y de otros compañeros el 28 de enero de 1912.

El alfarismo trató de favorecer el crecimiento empresarial. Para ello, emitió leyes que protegía a la industria nacional. Además, reguló los salarios de los trabajadores, en un intento de acabar con la servidumbre indígena y campesina.

Alfaro tomó el mando de Ecuador luego de la caída de Lucio Salazar y ordenó la creación de la Constitución de 1897 que lo declaró presidente constitucional. Fue sucedido por su propio coideario Leónidas Plaza Gutiérrez, aunque después sus diferencias los llevaron a conflictos entre ellos.

Alfaro gobernó entre 1895-1901 y 1906-1911. Gracias a la Revolución Liberal se introdujeron los cambios que modernizarían al atrasado Ecuador, por sobre la cerrada oposición terrateniente, del conservadorismo y la Iglesia. Sin embargo, el anunciado reformismo social no pudo afirmarse.