https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y Origen y acontecimientos más importantes de la bioinformática en-us 2022-01-26 21:56:03 UTC 2022-02-02 20:59:14 UTC hello@padlet.com https://padlet.net/icons/png/1f9ec.png carlosantillon7009 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016241454 Mecanización para el procesamiento de alimentos.]]> 2022-01-27 16:19:35 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016241454 carlosantillon7009 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016243263 Thomas Kennedy Walker dio inicio a la industria de fermentación con la universidad de Manchester, adoptando el nombre de biotecnología.]]> 2022-01-27 16:20:23 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016243263 carlosantillon7009 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016244417 Norte de Inglaterra, laboratorio de consejería en química y microbiología da inicio a la palabra biotecnología.]]> 2022-01-27 16:20:53 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016244417 carlosantillon7009 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016249279 Por primera vez se secuenció en forma completa una proteína, la insulina, por parte de Frederick Sanger y sus colegas de la universidad de Cambridge, década de 1945- 1955.]]> 2022-01-27 16:22:54 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016249279 carlosantillon7009 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016253687 Cada proteína posee una estructura primaria única, por Sanger.]]> 2022-01-27 16:24:49 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016253687 carlosantillon7009 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016257394 Debido a la gran cantidad de datos, los investigadores se vieron obligados a utilizar estrategias de biología molecular, matemáticas y las computadoras, para enfrentar con éxito el desafío que ello representaba. Y en este punto aparecen la bioinformática y la biología computacional como disciplinas íntimamente relacionadas.]]> 2022-01-27 16:26:22 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016257394 carlosantillon7009 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016260490 Después de la segunda guerra mundial las computadoras estuvieron al alcance de los investigadores con disponibilidad muy limitada, 15% del total de centros de investigación y universidades de los Estados Unidos de América]]> 2022-01-27 16:27:46 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016260490 carlosantillon7009 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016264057 El trabajo de Margaret Oakley Dayhoff impulsó la generación de bases de datos primarias como GenBank, FASTA y BLAST (Basic Local Alignment Tool). Mientras GenBank almacenaba y catalogaba las secuencias de ADN y de proteínas, BLAST permitía comparar con mayor rapidez que su predecesor FASTA las secuencias de interés contra cada una de las secuencias contenidas dentro de la enorme base de datos]]> 2022-01-27 16:29:28 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016264057 carlosantillon7009 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016267651 La doctora Dayhoff desarrolló métodos computacionales que le permitieron comparar secuencias proteicas y a partir de los alineamientos entre ellas investigar las relaciones y por tanto la historia evolutiva entre los diferentes reinos, phyla y taxa biológicos. (1925-1983).]]> 2022-01-27 16:31:03 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016267651 carlosantillon7009 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016286825 La Base de datos mas grande del mundo con con más de 2’000,000 de nucleótidos secuenciados, con sus respectivas referencias y anotaciones.]]> 2022-01-27 16:39:02 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016286825 carlosantillon7009 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016342710

FRANCO, M. A. R. Í. A. L. I. L. I. A. N. A., CEDIEL, J. U. A. N. F. E. R. N. A. N. D. O., & PAYÁN, C. É. S. A. R. (2008, 13 enero). Breve historia de la bioinformática. Scielo. Recuperado 13 de enero de 2008, de http://www.scielo.org.co/pdf/cm/v39n1/v39n1a15.pdf

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]]> 2022-01-27 17:03:03 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016342710 daliamedrano https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016808325 Hershey y Chase probaron que era el ADN, y no las proteínas, lo que los bacteriófagos transmitían a las bacterias al infectarlas. ]]> 2022-01-27 21:14:42 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016808325 daliamedrano https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016847382 Trabajando juntos en la National Biomedical Resource Foundation, Margaret Dayhoff y Robert S. Ledlley desarrollaron COMPROTEIN, completamente escrito en FORTRAN, como un programa completo de computación para la IBM 7090, diseñado para determinar la estructura primaria de proteínas usando el método de secuenciación Edman. ]]> 2022-01-27 21:47:49 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016847382 daliamedrano https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016871052 Dayhoff y Eck publican la primera base de datos de secuencias biológicas, llamándola Atlas de secuencia y estructura de proteínas, cuya primera edición contenía 65 secuencias de proteínas, siendo la mayoría de ellas variantes interespecíficas de un puñado de proteínas. En este atlas se utilizó por primera vez el código de aminoácidos de una letra, desarrollado también por Dayhoff y que aún se utiliza hoy en día.]]> 2022-01-27 22:10:50 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016871052 daliamedrano https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016887524 Saul Needleman y Christian Wunsch proponen el primer algoritmo de programación dinámica para alinear secuencias de proteínas en su artículo A general method applicable to the search for similarities in the amino acid sequence of two proteins. Este algoritmo se sigue usando para la comparación de secuencias biológicas.]]> 2022-01-27 22:27:40 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016887524 daliamedrano https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016900009 Algoritmo desarrollado por Da-Fei Feng y Russell F. Doolitle, nombrado por ellos como "Alineamiento progresivo de secuencias" y que consiste en:

1. Alineación de todos los pares de secuencias con el algoritmo Needleman-Wunsch.
2. Extracción de puntajes de similitud para cada par alineado.
3. Construcción de un árbol de similitud con estos puntajes.
4. Alineación de las dos secuencias con más similitud, seguidas de las siguientes dos de mayor semejanza y así sucesivamente.

]]> 2022-01-27 22:41:43 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016900009 daliamedrano https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016905434 Surge como una simplificación del algoritmo Feng-Doolitle. Este software aún es utilizado en la actualidad y se le sigue aplicando mantenimiento.]]> 2022-01-27 22:47:36 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016905434 cesaribanez2851 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016913687 Arpanet es un embrión de lo que mas adelante es Internet.
Era una red de computadoras construida como un medio resistente para enviar datos militares y conectar principales grupos de investigación a través de los Estados Unidos.]]> 2022-01-27 22:57:30 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016913687 cesaribanez2851 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016914512 Los genetistas estadounidenses Stanley Cohen y Herbert Boyer desarrollaron la tecnología de ADN recombinante, una metodología para unir artificialmente fragmentos de ADN (ácido desoxirribonucleico) que no se encuentran juntos en la naturaleza. Ésa técnica permitió la transferencia genes de una especie a otra.]]> 2022-01-27 22:58:38 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016914512 cesaribanez2851 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016914595 El Southern Blot es una técnica de hibridación que permite identificar fragmentos de ADN separados por electroforesis en gel y transferidos a una membrana de nitrocelulosa o nylon. Su nombre procede de la persona que lo diseñó Sir Edwin Mellor Southern y permite la detección simultánea de varias secuencias diana de distintos tamaños con una única hibridación. ]]> 2022-01-27 22:58:45 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016914595 cesaribanez2851 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016917492 El Human Genome Project lograba completar el mapa del genoma humano. La iniciativa, que había comenzado en 1990, consiguió terminar el encargo dos años antes de tiempo, gracias a la colaboración internacional y a los avances en los campos de la genómica y la tecnología informática.]]> 2022-01-27 23:02:03 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016917492 cesaribanez2851 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016917707 Un consorcio internacional de científicos publica en la revista "Nature" un borrador del 90% del genoma de la rata. La rata común (Rattus norvegicus) es el tercer mamífero cuyo "libro de la vida" se ha descifrado, después del hombre y el ratón.]]> 2022-01-27 23:02:07 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016917707 cesaribanez2851 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016917775 El proyecto HapMap es una colaboración de científicos al igual que el Proyecto Genoma Humano. Oficialmente, el proyecto comenzó en octubre del 2002 y la primera fase terminó 3 años más tarde. El objetivo de la fase I del proyecto fue genotipar al menos un SNP común.]]> 2022-01-27 23:02:13 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016917775 cesaribanez2851 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016917843 UniProt presenta el primer borrador del proteoma completo del ser humano, con más de veinte mil entradas.]]> 2022-01-27 23:02:19 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016917843 daliamedrano https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016920981 Dayhoff, Schwartz y Orcutt crearon un framework matemático basado en matrices de sustitución PAM que contenían valores de probabilidad en mutaciones de aminoácidos.]]> 2022-01-27 23:06:23 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016920981 daliamedrano https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016935070 El grupo de Genética Computacional de la Universidad de Wisconsin desarrolla el primer paquete de programas para análisis de secuencias, que consistió en una colección de 33 herramientas de líneas de comando para manipular ADN, ARN o secuencias de proteínas. Estuvo diseñado para operar en minicomputadoras DEC VAX-11.]]> 2022-01-27 23:24:19 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016935070 daliamedrano https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016946442 Surge la primer revista especializada en bioinformática, CABIOS, a raíz del incremento de disponibilidad de computadoras y su enorme potencial en análisis de datos biológicos. Esta revista es creada con el propósito de democratizar la bioinformática entre los científicos relacionados con la computación y la biología. Actualmente aún se publica y ha sido renombrada como Bioinformatics.]]> 2022-01-27 23:39:27 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016946442 daliamedrano https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016952419 Craig Venter secuencia el primer genoma completo de un organismo de vida libre, la Haemophilus influenzae en el Instituto para la Investigación Genómica. ]]> 2022-01-27 23:46:30 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2016952419 cristoferpinto8724 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2020324242 fue un ingeniero químico, bioquímico y activista estadounidense. ]]> 2022-01-30 21:50:32 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2020324242 cristoferpinto8724 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2020387400 2022-01-30 23:39:39 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2020387400 cristoferpinto8724 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2020404899 5,386 pares de bases que codifican 9 proteínas ]]> 2022-01-31 00:10:46 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2020404899 cristoferpinto8724 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2020414449 Para terminar la década con el primer cromosoma humano (el 22) completamente secuenciado en 1999 con tan sólo 33.4 Mbps. ]]> 2022-01-31 00:28:06 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2020414449 cristoferpinto8724 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2020419022 La secuenciación de EST (Expressed Sequence Tags, marcaje de secuencias expresadas.) es una pequeña subsecuencia de una secuencia nucleotídica transcrita. Se pueden usar para identificar genes que se transcriben y en el descubrimiento de genes, y para determinación de secuencias.]]> 2022-01-31 00:34:51 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2020419022 cristoferpinto8724 https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2020421868 También es conocido como el Human Genome Project o Proyecto Genoma Humano]]> 2022-01-31 00:39:18 UTC https://padlet.com/daliamedrano/t2c56uh0dvi8qn7y/wish/2020421868