Así comenzó el período conocido como Resistencia Peronista. Duró casi 18 años, desde el golpe de estado que derrocó a Perón en 1955 hasta el 25 de mayo de 1973. A lo largo de este período gobernó la dictadura (tanto la Revolución Libertadora como la Revolución Argentina), aunque hubo elecciones en dos ocasiones: en 1958 (Arturo Frondizi fue elegido presidente, lo que puso fin a la Revolución Libertadora) y en 1963 (Arturo Illia fue elegido presidente). Durante esta etapa, Perón tuvo prohibido el regreso a la Argentina, y el peronismo como movimiento político tenía prohibida la participación en elecciones de todo tipo,

Perón intentó volver a la Argentina en 1964; consiguió pasaportes falsos, y mandó a construir una amplia residencia en el barrio de Puerta de Hierro. En la noche del 1 de diciembre de 1964, Perón logró escabullirse de la policía española al esconderse en un automóvil, y logró embarcarse junto a Jorge Antonio, Parodi y Alberto Iturbe en un vuelo regular con destino a Buenos Aires. El presidente argentino de ese entonces, Arturo Humberto Illia, fue informado inmediatamente del plan de Perón, y decidió dejar que sus ministros decidieran qué hacer. Bajo órdenes de los comandantes de las tres Fuerzas Armadas y a pedido de la cancillería argentina, se logró detener el avión en Río de Janeiro. Un oficial militar brasileño abordó el avión y arrestó a Perón y a sus acompañantes, quienes fueron enviados de regreso a Madrid, mientras que el avión siguió su rumbo original a Buenos Aires y Santiago de Chile.

Sin embargo, la proscripción del peronismo no podía mantenerse por siempre. Amenazado por una revuelta masiva, el gobierno de facto de Alejandro Lanusse, establecido durante la Revolución Argentina que derrocó a Illia, se vio obligado a permitir el regreso de Perón al país. Así, pasó a la historia el 17 de noviembre de 1972, el día que Perón volvió a la Argentina. Hoy en día, se sigue celebrando este hecho: todos los 17 de noviembre se celebra el Día de la Militancia Peronista, en conmemoración al regreso de Perón.

Lanusse sabía que, si Perón volvía a la Argentina y se presentaba como candidato político a las elecciones presidenciales de 1973, podía ganar fácilmente. A fin de evitar esto, hizo cambios para prohibirle a Perón que se postule como presidente, ultimadamente prohibiendole otra vez el ingreso a la Argentina el 5 de febrero de 1973. Entonces Perón decidió que, en vez de ser él mismo el candidato, elegiría a alguien de su confianza

para tomar el puesto. Esa persona fue Héctor Campora, quién ganó las elecciones y asumió la presidencia el 25 de mayo de 1973. Con esto, se puso fin a la época de proscripción del peronismo en Argentina; Perón regresó definitivamente el 20 de junio de 1973. Ese mismo día y como producto de su regreso, se llevó a cabo un tiroteo, la Masacre de Ezeiza, que se saldó con 13 muertos y, al menos, 365 heridos.

Unos meses después de su regreso definitivo, Perón se presentó como candidato a presidente de la Nación en las elecciones del 23 de septiembre de 1973, en las que triunfó con un 62% de los votos. Sin embargo, falleció poco después, el 1 de julio de 1974, en ejercicio de la presidencia.

La misma consistió en una fuerte devaluación del peso, un aumento de tarifas de servicios públicos, transporte, combustibles de más del 100%, y un tope a las negociaciones salariales, lo que derivó en grandes perjuicios económicos para mucha gente y un desabastecimiento en gran cantidad de productos esenciales. Inauguró la etapa de alta inflación, que duró hasta 1985 con la llegada del Plan Austral, y además detonó el primer paro general del sindicalismo a un gobierno peronista, cosa bastante inédita para la época.