Más allá de las víctimas mortales del terremoto y del tsunami, los efectos negativos de la catástrofe se dejarán sentir transcurridos años después. De los cuales se destacan, el envenenamiento de los acuíferos de agua dulce debido a la infiltración del agua del mar; el depósito de una capa de sal en las tierras de cultivo inundadas por el tsunami, lo cual las hace inviables para la siembra; la muerte de los microorganismos del suelo necesarios para su recuperación; la propagación de desechos sólidos, líquidos y productos químicos industriales; la contaminación del agua debido a la destrucción del sistema de alcantarillado y las plantas de tratamiento de aguas residuales; entre muchas otras cosas.