主條目：傷害

蜜蜂會反擊對其造成傷害的任何生物，附近所有不在巢內的蜜蜂都會被激怒並反擊該生物。

如果蜂巢被破壞，其中所有的蜜蜂都會以被激怒的狀態釋出，且附近所有不在巢內的蜜蜂都會被激怒。因蜂巢被破壞而被激怒的蜜蜂會無差別地攻擊任何玩家，即使這個玩家並沒有參與對蜂巢的破壞。擊打（不破壞）蜂巢或是在蜂巢上行走並不會激怒蜜蜂。若使用帶有絲綢之觸附魔的工具挖掘蜂巢，該巢內的蜜蜂會隨巢被採下而不會被釋出。

蜜蜂是完全變態的昆蟲，發育周期包括卵（3天）、（6天）、蛹（12天）、成蟲4個階段。蜂后將卵一個一個地產在蜂巢的每個巢室中。利用儲精囊，蜂后可以決定要不要給所產的卵受精，通常取決於卵產在哪一種巢室內。蜂卵三天孵化成幼蟲。

大蜜蜂亞屬中有兩個種。牠們通常會築單個或少數幾個巢穴，巢穴裸露於高高的樹枝、懸崖上面，有時候也會在高層建築上。牠們可以變得非常兇猛。人類的「蜂蜜獵人」會定期地掠奪牠們的蜂蜜，蜂群一旦被激怒可以輕而易舉地將一個人類蟄至死亡。
大蜜蜂亞屬包含以下種以及亞種：
1.大蜜蜂原產於並且廣泛分佈於南亞於東南亞的大部分地區。
2.印度尼西亞大蜜蜂被分類為大蜜蜂的印度尼西亞亞種，或者被分類為獨立的種，在後者情況下小舌亞種和其他譜系可能也必須被認為是獨立的種了。
^3.喜馬拉雅大蜜蜂最初是大蜜蜂的亞種，1980年依形態上的差異分成獨立的種，後來1999年被恩格爾
重新歸為是大蜜蜂的亞種，儘管那些採用遺傳學物種概念的作者們建議牠應當被歸為一個獨立的種，2020年根據特定站點研究觀察顯示，本種確實一直和大蜜蜂共存着，在外形上跟大蜜蜂所差無幾，但沒有和大蜜蜂有雜交的情況發生，因此再度成為獨立的種，也證實了本種的和大蜜蜂有生殖隔離的情形。牠們只生活在喜馬拉雅山脈，卻具有廣泛的行為適應性，使其可以在高緯度地區的低溫外部環境中築巢。牠們是現今體型最大的蜜蜂。