O tipo, quantidade e variação no fornecimento do substrato vão influenciar na escolha e automação da tecnologia. O cenário da região escolhida e dos produtos a serem comercializados vão determinar o modelo do negócio.

Por esses motivos, antes de investir alguns milhões de reais em um projeto como esse, é aconselhável contratar consultoria especializada. A elaboração de um Plano de Negócios ajuda a diminuir os riscos do empreendimento.
O biodigestor para bovinos pode ser empregado de algumas formas. A fase líquida ou em lodo do produto do processamento pode ser empregada com um excelente fertilizante no cultivo de uma ampla variedade de culturas. Além disso, dependendo do tipo de matéria orgânica que é utilizada, o produto sólido obtido com o processamento pode ser empregado na dieta do gado. No entanto, é importante destacar que o uso do alimento oriundo do biodigestor para bovinos, embora não implique em queda na qualidade da carne, não é bem aceito para o gado de corte se os dejetos suínos forem empregados, situação que deve ser evitada.
Assim, o emprego do biodigestor para bovinos não é apenas uma solução eficaz para o lixo e os dejetos, mas também uma forma de transformar materiais descartados em energia sustentável. O biogás subproduto do processo atua como um substituto para combustíveis fósseis e lenha, e o efluente que sobra no final do processo de digestão pode ser usado como fertilizante, aumentando a saúde do solo e a produção agrícola.