人類也令海洋生物的棲息地喪失，尤其是沿海生態系統已被人類破壞。例如淺海海草生長區、紅樹林等棲息地，到受人類干擾及嚴重破壞，導致他們的面積都在減少中。至1980年以來，世上有五分之一的紅樹林已經消失。

人類令到海洋被污染。但人類使用或傳播：工業、農業和居家產生的廢氣物（垃圾）等等，入侵生物進入海洋，並在那裏產生有害影響時，造成海洋污染。大部份廢棄物由陸上所產生，但海上運輸也貢獻不少。影響魚類的生長與繁殖，造成水產資源的嚴重損失

人類也導致全球暖化，全球暖化所產生的大部份熱能並非進入大氣或土壤，而是進入海洋。科學家們意識到海洋是人類對氣候變化產生影響的關鍵證據。隨着全球暖化，海洋生物正往海洋宗教冷的部份移動。郵政句顯示海洋溫度升高，以對海洋生態系統造成損害。例如一項對印度洋中浮游植物變化的研究顯示在過去60年此處的浮游植物數量以下降20%。若本世紀末的全球暖化水平超過2°C，預料部分物種有機會絕種、地區性絕跡和生態系統崩潰的風險會迅速上升

研究表明，世界上最大的动物——蓝鲸，每天可能吞食多达1千万个塑料微粒。这些塑料微粒通常来自分解的塑料制品，流入海洋中，对海洋生物造成巨大危害。

除了鲸鱼，还有许多其他物种也受到塑料污染的影响。其中，701种海洋动物会吞食塑料垃圾，包括69种海洋哺乳动物、全部种类的海龟、363种鱼类和82种无脊椎动物。这些动物不仅吞食塑料，还被海洋垃圾缠住而无法脱身，导致死亡的情况也时有发生。

虽然吃下塑料通常不会立即导致死亡，但塑料微粒可能影响动物的繁殖、迁徙和持续觅食能力。