Según información brindada por las autoridades que realizan los allanamientos e incautaciones en la zona afectada por la minería ilegal, donde se realizaban actividades a cielo abierto: (extracción de oro artesanalmente con Mercurio), y Corpoamazonía, nos indican que la ésta actividad se lleva a cabo en la Vereda Palmeiras y Puerto Amor del municipio de San José del Fragua – Caquetá, contaminando la quebrada Palmeiras y causando daños al ecosistema del lugar, con afectación ambiental aproximada a los 2 kilómetros, contaminando las fuentes hídricas por el uso de Mercurio y Cianuro.

Por ser un ecosistema de agua dulce, cuyo ambiente es agua con muy bajos contenidos de sales, inferiores al 0,05%, con ácidos orgánicos y diversos sedimentos, siendo un ecosistema lótico por su constate corriente de agua en dirección definida; fueron afectadas las plantas acuáticas tanto flotantes, como emergidas y  sumergidas, así  como un sin número de fauna silvestre como: peces (sardinas, rayas), reptiles (serpientes, anguilas, babillas, temblones)  e invertebrados (lombrices, gusanos, babosas);  También por la deforestación de los siguientes árboles: (carbones, cedros, lacres, palmas, cananguchas) y contaminación, los animales que habitaban en los árboles como: (loros de diferentes especies, azulejos, torcazas, guacharacas, algodones, etc.)