Il territorio è caratterizzato da montagne (il monte più alto è il Higravstinden, di 1.161 metri s.l.m.), che finiscono a strapiombo sul mare, una ricchezza per le isole, attraendo molti turisti per la loro particolare bellezza.

La costruzione della E10, e di una serie di costosi tunnel e ponti stradali, ha permesso di congiungere direttamente tutte le principali isole dell'arcipelago, rendendole maggiormente accessibili anche agli autoveicoli.

Le Lofoten si trovano oltre il circolo polare artico. Nonostante ciò, il clima è caratterizzato da temperature piuttosto miti principalmente grazie alla corrente del Golfo. La temperatura minima registrata nel 2009 è stata di -13.1 °C, il 7 febbraio, mentre la massima di 26.6 °C il 3 agosto. Le temperature medie mensili più basse nel 2009 sono state registrate nei mesi di dicembre (-0.8 °C) e febbraio (-2 °C).

Data la latitudine, le Lofoten sono interessate dal fenomeno del Sole di mezzanotte, e considerate un ottimo punto di osservazione per le aurore boreali.

L'acqua pesante era indispensabile alla produzione della bomba atomica ed il programma nucleare tedesco era prossimo alla realizzazione e necessitava della produzione della Norsk Hydro. Pertanto agli Alleati occorreva distruggere sia la produzione ultima che l'impianto produttivo, per evitare che le scorte venissero reintegrate. L'operazione Freshman venne condotta con un atterraggio d'assalto di alianti Airspeed Horsa, col quale gli incursori britannici tentarono di raggiungere l'impianto, ma gli alianti precipitarono prima dell'obiettivo e il raid fu un fallimento. Successivamente un nuovo gruppo di incursori norvegesi addestrato in Inghilterra raggiunse la fabbrica e distrusse l'impianto.