생물정보학활용 프로그램(수업) 아이디어 by MJ KIM https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa en-us 2023-07-22 03:39:40 UTC 2025-10-07 11:40:50 UTC hello@padlet.com 멘델 유전법칙에 등장하는 식물의 유전자 챗GPT로 검색 parakim31 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649413190 2023-07-22 03:58:36 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649413190 GMO오염 parakim31 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649414289 2023-07-22 04:04:38 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649414289 고사리 다양성(형태학적 분류 계통수) parakim31 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649414395 2023-07-22 04:05:14 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649414395 소나무 종 형태특성과 계통수 분류 parakim31 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649414493 2023-07-22 04:05:52 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649414493 벚꽃지도만들기 parakim31 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649414558 2023-07-22 04:06:17 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649414558 HIV 역전사 확인 parakim31 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649415566 2023-07-22 04:11:11 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649415566 질병 크로모좀별 모둠에서 할당받아 진행 parakim31 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649415846 2023-07-22 04:12:22 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649415846 프라이머제작(생명공학자라는 가정으로 관심사에 따라) parakim31 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649416367 2023-07-22 04:15:01 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649416367 막단백질 구상(합성생물) parakim31 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649416634 2023-07-22 04:16:52 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649416634 스토리텔링(프로그램 필요성에 대한 공감) parakim31 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649419954 2023-07-22 04:37:18 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649419954 이끼 beatjungle2019 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649420430 존재감없지만 존재력 강한 이끼의
생태적 지위와 천이 과정에서의 중요성
기후변화에 대응책으로 제안되는 이끼

주변에서 볼 수 있는 이끼들(솔이끼, 우산이끼, 깃털이끼 등) 의 동정과 분류 및 계통수 작성]]> 2023-07-22 04:40:05 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649420430 https://www.bookjournalism.com/talks/3929 gbsmehjad https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649422358 2023-07-22 04:50:09 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649422358 Three loci were sampled: chloroplast ribosomal small protein 4, the intronic regionof the mitochondrial NADH dehydogenase subunit 5, and partial sequences of the nuclear 26S ribosomalRNA. gbsmehjad https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649423157 2023-07-22 04:53:44 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649423157 Chat GPT(이끼 계통수 작성을 위한 추천 유전자) psf202107 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649423200 이끼 계통수 작성을 위한 서열 분석에 유용한 유전자들 중 일부를 추천해 드리겠습니다. 이끼류는 식물 중 가장 원시적인 계통으로, 생물 진화 연구에 중요한 역할을 하고 있습니다. 다음은 이끼 계통수 작성을 위해 유용한 몇 가지 유전자들입니다:

  1. 루비스코(RUBISCO): 이끼류 역시 광합성을 수행하며, 루비스코는 이산화탄소를 고정하여 유기물로 전환하는데 관여합니다.
  2. 라보노이스(LABONIN): 이끼의 생장과 발달에 영향을 미치는 유전자로서 이끼의 크기와 형태 결정에 중요합니다.
  3. 스포라드(스포란 발달 유전자): 이끼의 생식구조인 스포란의 발달과 관련된 유전자들로, 이끼류 간의 진화적 관계를 연구하는 데 유용합니다.
  4. 전사 인자 유전자(TFs): 이끼의 다양한 생리적 반응과 발달에 영향을 주는 유전자들로서, ABI3, ABI5, MYB, AP2 등이 있으며, 진화 연구에 중요한 정보를 제공할 수 있습니다.
  5. 미토콘드리아 유전자: 미토콘드리아는 고유의 DNA를 가지고 있으며, 미토콘드리아 DNA 서열 분석은 이끼의 진화와 계통 관계를 연구하는 데 도움이 됩니다.
  6. 염기 서열 유전자(MADS-box, rbcL): 이끼의 계통 관계를 밝히는 데 사용되는 대표적인 유전자들로서, 서열 분석에 유용합니다.
  7. 염기 서열 비교에 유용한 다른 유전자들: 18S rRNA, ITS (Internal Transcribed Spacer), cpDNA (엽록체 DNA) 등이 이끼 계통수 작성에 도움을 줄 수 있습니다.

이끼류의 계통 관계를 밝히기 위해서는 이러한 유전자들의 서열 분석을 수행하고, 다양한 종류의 이끼로부터 데이터를 수집하여 분석하는 것이 좋습니다. 이러한 유전자들의 서열 정보는 계통 수립 및 생물 진화에 대한 연구에 중요한 자료가 될 수 있습니다.
]]> 2023-07-22 04:53:48 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649423200 이끼 DNA바코드 beatjungle2019 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649423529 https://link.springer.com/article/10.1007/s00300-014-1509-7]]> 2023-07-22 04:54:59 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649423529 parakim31 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649423659 2023-07-22 04:55:42 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649423659 수업 설계 psf202107 https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649426736  - 말랑한 것에서 시작해 심화하는 게 좋으니~
 - 이끼로 테라리움 만들기 작업과 연결

1. F: 연구 영역 소개
 - 나무가 다양한 것처럼 / 이끼도 정말 다양할까?
 - 형태적 분류
 - 최근에는!? 
 - 생물정보학으로 연결 
 ** 참고 **
  - 생물정보학에 대한 안내
  - KOBIC 소개
   - 관련 News(alpha fold 등)
    
2. A: 학문적 내용
  1) 관찰하는 것, 만들어보는 것, 배우는 것
    - 학교 주변 이끼 채집
    - 실체 현미경으로 확인
    - 동정하기 [책, 스마트렌즈 등 활용]
  2) 생물정보학 활용 방법
   - 특징 파악: NCBI + 어떤 유전자 서열?
   - 분석하기: Python / Biopython 

3. M: 식물학 전공 교수님과 이끼 동정 및 분류에 대한 대화

4. E: 확장
    - 형태학적 분류를 통한 계통수 작성
- 추천 유전자 6가지를 조별로 나눠 계통수 작성하기

]]> 2023-07-22 05:12:39 UTC https://padlet.com/parakim31/mhrtp2bw8wbz23wa/wish/2649426736