La colonización española en América fue sistemática y brutal. Gran parte de los indios fueran obligadas a trabajar en los campos y en las minas de forma inhumana, provocando una altísima mortalidad. El grupo de explotación fue tal que incluso se impuso la esclavitud con mano de obra negra procedente de África.

En 1508 se creó el cargo de Piloto mayor, consistió en examinar a los pilotos que iban a realizar la comunicación y transporte con ultramar y fabricar la cartografía oficial para las travesías e incorporar los nuevos descubrimientos al padrón real.

Las segundas ordenanzas se perfecciona el sistema de trabajo: se fijó un horario para los funcionarios de la Casa, con reuniones de trabajo los días laborables de 10 a 11 y de 17 a 18 horas durante el invierno; de 9a 10 y de 17 a 18 en verano [Or. 1], la obligatoriedad de realizar visitas a los presos por causas de la institución [Or. 28] y que, sus funcionarios, en todo caso, deberán actuar «como más convenga a  nuestro servicio»

Segundo viaje: Salió de Cádiz el 25 de setiembre de1493, descubrió las Antillas, Cuba y Puerto Rico. Colón fundó en ese lugar la Isabela en honor a la reina de España. Luego de salir de viaje y descubrir Jamaica, regresó a la Isabela, donde encontró un caos, pues los españoles obligaban a los indios a entregar el oro y se mataban unos a otros. (Briceño V, 2018)

Tercer viaje: Se le impusieron varias condiciones y requisitos para que pudiera realizar el viaje y le tomó más tiempo encontrar gente que quisiera acompañarlo. Partió el 30 de mayo de 1498 de Cádiz con 6 naves. Llegaron a las Islas Canarias, en donde 3 carabelas partieron a la isla la Española y otras 3, donde viajaba Colón hacia Cabo Verde. El 31 de julio descubrieron el río Orinoco y llegaron a Venezuela. En este viaje se dio la rebelión de Francisco Roldán, quien era el alcalde mayor de la Española. (Briceño V, 2018)

Cuarto viaje: Partió de Cádiz el 9 de mayo de 1502 hacia las Islas Canarias, luego a las Pequeñas Antillas y de ahí fueron a Santo Domingo, donde el gobernador Frey Nicolás de Ovando, por orden de los Reyes Católicos, le prohibieron desembarcar, por lo que tuvo que continuar hacia Jamaica y Cuba, bajando luego hacia Honduras en donde el 1 de agosto se dio un contacto entre europeos y mayas. (Briceño V, 2018)

Recorrieron la costa caribeña de Honduras, Nicaragua, Costa Rica y Panamá llegando al río Belén, en donde fundaron la primera ciudad española: Santa María de Belén. Ahí perdieron una de las carabelas, destruida por los temporales. Luego llegaron a Veragua donde perdieron otra carabela. Ya solo les quedaban dos carabelas. Llegaron a Jamaica el 25 de junio de 1503, en donde estacionaron las dos carabelas que les quedaban para no perderlas en el mar. (Briceño V, 2018)

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