Al clasificar los organismos en grupos y nombrarlos, ordenamos el mundo microbiano natural y hacemos posible la comunicación eficaz de todos los aspectos de organismos particulares como el comportamiento, la ecología, la fisiología, la patogenia o las relaciones evolutivas. 

La creación de nombres nuevos debe seguir las reglas descritas en el Código Internacional de Nomenclatura de las Bacterias. Dicho código representa el marco formal mediante el cual las bacterias y las arqueas se deben nombrar oficialmente y los procedimientos por los cuales se pueden cambiar los nombres existentes, por ejemplo cuando nuevos datos justifican la reordenación taxonómica.