館內設有兩個常設展廳，展出多件珍貴的歷史文物，配合多元化的視聽節目，全面地講述孫中山先生的生平事蹟，以及在香港十九世紀末至二十世紀初的維新與革命運動中所扮演的重要角色。

展館展出約150件藏品，七成是市民館藏，其餘由不同博物館借出，逾半屬一級國家文物。孫中山先生與香港關係密切，他在香港接受中學（皇仁書院)和大學（香港大學）教育，原想當醫生的他，搖身一變成為革命家，推翻滿清，建立共和，在港推動革命思想和籌劃起義活動。

 

1883年，孫先生從檀香山返國時途經香港，對香港留下了深刻的印象，成爲他日後求學之地。同年秋天，孫中山先生再次到香港，先就讀於拔萃書室，後轉到中央書院(皇仁書院)讀書。1883-1885年中法戰爭期間，香港華人為抗議法國侵略而拒絕給法國貨船卸貨，以至罷工、罷市，對照於滿清政府的屈辱求和，推動了孫中山的革命思想。

 

1886年，孫先生入讀廣州博濟醫院附設的醫科學校。次年，他得悉香港西醫書院的開辦，認爲那裏課程較完備，而且香港的言論較自由，方便鼓吹革命，於是他再次回到香港讀書。孫中山在校期間，交遊至廣，尤與楊鶴齡、陳少白、尢列朝夕相處，談論革命，被人稱爲「四大寇」。

 

孫中山先生自香港西醫書院畢業後，曾在澳門及廣州行醫，直至1894年在檀香山成立了興中會，並於1895年在中環士丹頓街13號「乾亨行」成立了香港興中會總會。入會者除「四大寇」外，尚有孫先生的好友如鄭士良、陸皓東及區鳳墀，以至香港輔仁文社的楊衢雲、謝纘泰等人，由楊衢雲出任會長。

 

興中會總會成立後，曾於1895年和1900年分別在廣州及惠州起義。1896年，香港政府指孫中山危害本地的治安與秩序，禁止他在港居留。孫先生只好在船上指揮在港的革命黨人，並於1899年派陳少白回港創辦《中國日報》。1905年同盟會在東京成立，從此孫先生領導的革命起義，便透過同盟會、香港分會及南方支部統籌策劃。

1911年辛亥革命爆發時，孫中山先生正在美國宣傳革命及籌募經費。同年12月21日，他在返國的途中路經香港。民國成立後，他仍多次進出香港，還與港督司徒拔午宴，並於到香港大學作公開演講。1924年11月14日，孫中山在北上共商國是時途經香港，最後一次踏足香港的土地。

由於孫中山先生一生與香港關係如此密切，香港孫中山紀念館的成立意義深遠。