La organización de la escuadra chilena había contado con el apoyo de O’Higgins. El director supremo de Chile no mezquino ningún tipo de ayuda para el compañero de armas en la gesta liberadora. 

San Martin presentó la renuncia al ejercito de los Andes ya que su cago no tenía sustento jurídico. El 26 de marzo, en un sobre cerrado, le entrego al jefe de Estado Mayor, las razones de su decisión. “queda sentado como base y principio que a la autoridad que recibió el General de los Andes para hacer la guerra a los españoles y adelantar la felicidad del país, no ha caducado ni puede caducar, pues que su origen que es la salud del pueblo, es inmudable.”

A San Martin se le presenta un gran dilema uno de los más importantes en su vida: volver a Buenos Aires y embarcarse en una lucha fratricida en favor de un gobierno porteño que solo bregada por sus propios asuntos y no representaba los intereses de las provincias, o continuar la marcha hacia el Perú, completando el Plan Continental. Así se lo hacía saber en forma reservada a O’Higgins:” Se va a descargar sobre mí una responsabilidad terrible, pero si no se emprende la expedición al Perú todo se lo lleva el diablo” 

El panorama para seguir la campaña al Perú no es para nada alentador, pero San Martin se niega rotundamente a poner sus tropas al servicio de una guerra civil. Sus oficiales le recomiendan retirarse a Chile, donde va a estar más seguro.

Alvarado en forma secreta encarga la construcción de una camilla ligera y cómoda que pudiera transportar al General a través de la cordillera de los Andes. El general se resiste a dejar parte de su ejército, pero agravada su enfermedad Alvarado logra persuadir al General del grave riesgo que corría su vida.

Una caravana de sesenta granaderos transporto a San Martin a través de los andes y el 14 de enero de 1820 lo instalaron en Santiago de Chile.

Mientras recuperaba su salud se enteró de la definitiva sublevación del ejército del Norte. La nación se desintegraba y se dirimía en los poderes de los caudillos provinciales. Y sin el respaldo económico, vio aún más complicada la campaña liberadora del Perú.

Al promediar el día, Osorio se encontró superado por la ofensiva de San Martin y se dio a la fuga. Enterado San Martin de la huida de Osorio envió a su capitán a perseguirlo a través de los desfiladeros cordilleranos. 

San Martin Leyó algunas de las cartas recibidas de desleales personajes de Santiago al pie de un árbol y sin pensar las arrojo al fuego. 

“Querer contener con las bayonetas el torrente de opinión de América, es como intentar la esclavitud de la naturaleza. Examine con imparcialidad el resultado de los esfuerzos del gobierno español en tantos años y, sin detenerse en los triunfos efímeros de las armas del rey, descubrirá su importancia contra el espíritu de la libertad”, le escribe San Martin al virrey del Perú.

La victoria le permitió a San Martin revertir lo sucedido en Cancha Rayada, apuntalar la independencia de chile y aniquilar la capacidad de respuesta de los realistas en la región.

La tarde del 25 de marzo 1818, ante el asombro de los pobladores, entra San Martin en Santiago seguido por su caballería. 

Se lo ve triste y agotado. En sus ropas lleva el polvo de la derrota de Cancha Rayada. Dirigiéndose a Guido, le dice: “Mis amigos me han abandonado, pero recobraremos lo perdido y arrojaremos del país a estos chapetones”.

 

Luego de la derrota de los realistas en la batalla de Chacabuco, el poder español veía seriamente amenazado su poderío en la región del sur de américa. El virrey de Perú, enterado del fracaso de los españoles, envió una flota a la ciudad chilena de 15 buques al mando del brigadier Mariano Osorio.

Los españoles habían planeado recuperar concepción, reembarcarse hasta el puerto de Valparaíso y desde allí avanzar sobre la ciudad de Santiago. Pero estos planes no sorprenderían a San Martin, que ya se había puesto al tanto de las maniobras realistas. 

El 12 de febrero de 1818 se proclama en la ciudad de Santiago de Chile la Independencia Chilena.

Reunidas las fuerzas de O’Higgins y San Martin el 19 de marzo, acamparon en un lugar próximo a la cuidad de Talca. Durante la noche las tropas de Osorio cayeron por sorpresa sobre el campamento.

Pero fue San Martin quien ingreso a Santiago Y dirigiéndose al pueblo proclamo: “¡chilenos! Era natural que este golpe inesperado y la incertidumbre los hiciera vacilar; pero ya es tiempo de volver sobre vosotros mismos y observar que el ejército de la patria se sostiene con gloria al frente del enemigo”.