El 19 de marzo de 1844 se produjo en Azua el enfrentamiento de las tropas dominicanas lideradas por el general Pedro Santana y las tropas haitianas encabezadas por el presidente haitiano, Charles Hérard Ainé. La Guerra de la Independencia Dominicana fue el proceso histórico que inició con la proclamación de la República Dominicana y su separación de Haití en febrero de 1844.

 Durante los 22 años que precedieron a la independencia, toda la isla de La Española estuvo bajo el dominio de Haití, a consecuencia de la ocupación por parte de este país del estado de Haití Español, surgido fugazmente en 1821 en la parte oriental de la isla. Batalla del 30 de marzo o batalla de Santiago fue la segunda batalla posterior a la Guerra de la Independencia Dominicana y se libró el 30 de marzo de 1844, en Santiago. En esta batalla, el general José María Imbert, al mando de una parte del ejército del norte, derrotó al general Jean-Louis Pierrot, quien comandaba las tropas del ejército haitiano en una relación numérica superior a su favor.
La Primera República dominicana comenzó el 6 de noviembre de 1844 con la proclamación de la primera Constitución, y terminó el 18 de marzo de 1861 con la anexión de la nación a España. A lo largo de dichos 17 años, con un Estado frágil y bajo constante amenaza de invasiones haitianas, se sucedieron 8 gobiernos.​Debido a una profunda recesión económica, amenazas haitianas y la guerra de secesión en los Estados Unidos España re anexionó el territorio en 1861, y no ha sido hasta 1865 que la República Dominicana recuperó su libertad de manera definitiva. 

Núñez de Cáceres recibió a Boyer entregándole las llaves de la ciudad, pero el homenajeado las rechazo, argumentando que no había venido como conquistador.

El primer decreto hecho por Boyer fue la abolición de la esclavitud. Aunque la esclavitud era virtualmente inexistente desde hacia mas de un siglo en santo domingo, la medida, adelantada a su tiempo, significo para las masas de mulatos y negros libertos dominicanos un ascenso social jamás concebido.

 Después de la presidencia provisional de Ramón Báez, Jiménez fue elegido en octubre, y pronto se enfrentó a las nuevas demandas, incluyendo el nombramiento de un director estadounidense de obras públicas y asesor financiero y a la creación de una nueva fuerza militar al mando de oficiales de EE. UU. 

El Congreso Nacional rechazó estas demandas y comenzó el proceso de destitución contra Jiménez. Los Estados Unidos ocuparon Haití en julio de 1915, con la amenaza implícita de que la República Dominicana podría ser la próxima.

Derrota en Montecristi 1864

El que a los españoles les convenía la batalla frontal y a los restauradores el combate irregular se muestra en los hechos acontecidos en Montecristi, en mayo de 1864, cuando 6000 soldados procedentes de Santiago de Cuba comandados por José de la Gándara y apoyados en 13 piezas de artillería, derrotaron a los restauradores que presentaron resistencia a su desembarco y a la toma de dicha ciudad. La Batalla de Santomé fue una de las batallas libradas por el pueblo dominicano contra las invasiones haitianas, luego de que las autoridades haitianas se dieran cuenta que los dominicanos habían proclamado su independencia de Haití. La batalla tuvo lugar el 22 de diciembre de 1855, en la sabana de Santomé, en la hoy Provincia de San Juan, República Dominicana.

-          Repartición de tierras a los ex esclavos.

-          Leyes contra la vagancia

-          Aprobación del divorcio

-          Implementación del francés como idioma oficial.

-          Separación de la iglesia y el estado.

Las medidas de Boyer en torno a la separación jurídica del estado, la posesión de la tierra y la legalización del divorcio afectaban los intereses de la iglesia católica, colocándola como su principal opositora.

Por otros lados, naciones como Inglaterra, España, Francia y estados unidos, tomaban medidas para aislar diplomáticamente a Haití al negarse a reconocer como nación a un conglomerado de ex esclavos, pues en esos territorios la esclavitud aún era legal.