Cuando apareció la primera edición de «El origen de las especies por selección natural» de Charles Darwin en 1859, causó una conmoción científica sin precedente por su contenido, que explicaba que las especies pueden cambiar a lo largo del tiempo y aportaba un gran número de evidencias. Weismann escribió en 1883 un ensayo en el que negaba el efecto de los caracteres adquiridos sobre la herencia. Una aportación importante de Mendel fue el conocer que ciertas características pueden enmascarar u ocultar a otras, que es el caso de la dominancia y recesividad y que otras si se pueden mezclar.

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La teoría de Lamarck plantea que la gran variedad de organismos no es, como se creía hasta entonces, «siempre igual» sino que los seres vivos se inician siendo formas muy simples que van cambiando con el tiempo.
Las bases de sus investigaciones consistían en
– Los organismos vivos son cuerpos organizados producidos en la Tierra por la naturaleza a través de una gran cantidad de tiempo.
– La vida, sea animal o vegetal, en su perpetua evolución, va desarrollando poco a poco órganos más especializados y diversificados.
– Con el tiempo, condiciones ocasionadas por cambios de la Tierra y asimilación de diversos hábitos de mantenimiento de los organismos dan lugar a la diversidad de la vida.
A partir de sus investigaciones se formuló dos leyes básicas
– En todo animal el uso frecuente de sus órganos fortifica sus funciones, mientras que el desuso constante de los mismos debilita su potencia hasta hacerlos desaparecer.
– La genética se encarga de perpetuar, a través de futuras generaciones, las modificaciones que los cuerpos organizados han tenido que experimentar para cubrir sus necesidades frente a los cambios de su entorno.

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La teoría neutralista de la evolución molecular establece que la gran mayoría de los cambios evolutivos a nivel molecular son causados por la deriva genética de mutantes neutros en cuanto a la selección natural.​

Como los Individuos de una única especie, que comparten una misma proteína como puede ser la hemoglobina, por ejemplo. Lo cual es raro porque, tenemos en cuenta que un gen es algo que comparten los individuos de una misma especie y no quedaba muy claro por qué pasan estas variaciones dentro de un único tipo de proteína, que en principio tendría que ser la misma para todos los miembros de la especie. Opina que las mutaciones en su mayoría son neutras y que, de hecho, la selección natural interviene más bien poco en lo que es la escala molecular. Kimura no se opone a la selección natural, pero opina que a nivel molecular las mutaciones básicamente tienen en su mayoría efectos neutros.

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El Equilibrio puntuado afirma que la mayor parte de la historia evolutiva se caracteriza por periodos de estasis puntuados por cambios relativamente rápidos en un carácter cuando se forma un nuevo linaje. Las pruebas fósiles disponibles han puesto de relieve que varios linajes parecen seguir este patrón de evolución. El saltacionismo es un cambio repentino y de gran magnitud, producido entre una generación y la siguiente, es la hipótesis que en la teoría evolutiva se enfrenta al gradualismo darwinista y propone la saltación como mecanismo de especiación.

Evidencias:

Existen algunas especies que a la fecha permanecen en estasis, es decir su registro fósil no presenta cambios; un ejemplo de estos es el celacanto que al revisar su registro fósil presenta una apariencia muy similar a cuando desapareció del mismo y fue encontrado vivo hoy en día en las costas de África con la misma apariencia del registro fósil, por esta razón se le conoce como fósil viviente.


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