Es muy importante para las rutas migratorias de aves entre el continente africano y el europeo, y a su vez supone el último refugio para numerosas especies en peligro de extinción.

Doñana está formado por un espectacular paisaje de tierras llanas, donde destacan dos principales ecosistemas: los bosques de pino y matorral mediterráneo, que crecen en un suelo básicamente arenoso, y la inmensa marisma, que son terrenos inundables formados por arcillas impermeables con un régimen hídrico muy estacional.

Más de 300 especies de aves habitan en este territorio, y unas 130 se reproducen habitualmente aquí. La mayoría de estas aves son acuáticas, de este modo su medio preferido son las extensas marismas que posee el Parque. 

Podemos encontrar hasta un número de 37 especies de mamíferos, donde destaca el lince ibérico; 36.000 aves (en donde 12.700 se reproducen en el Parque); 21 especies de reptiles; 11 especies de anfibios y 200 especies de peces de agua dulce. 

No nos olvidamos de los miles de invertebrados (insectos, anélidos, arácnidos, entre muchos otros).

Actualmente sólo se puede llegar a ver en la sierra de Andújar (Jaén), y aquí en Doñana, donde quedan las últimas poblaciones que existen en tierras llanas a nivel del mar.

Apenas 10 parejas habitan en nuestro Parque siendo uno de sus últimos refugios.

En el año 1980, la Unesco clasificó el Parque Nacional de Doñana como Reserva de la Biosfera con unas 77.260 hectáreas.

La Unesco mencionó que la importancia de Doñana se basa en la variedad de ecosistemas que alberga y el alto número de especies que representa.

En el año 1994, fue catalogado por la Unesco como Patrimonio de la Humanidad, y eso hizo que mejoraran las posibilidades de conservación de la zona.

En el año 1998, se produjo el Desastre de Aznalcóllar. Fue una riada de lodos tóxicos provenientes de una mina de la empresa Boliden-Apirsa, que llegó a afectar al río Guadiamar y parte de las aguas del parque.

En el año 2000, el Ministerio de Medio Ambiente, tras la catástrofe de Aznalcóllar que no llegó a afectar directamente al Parque, promovió el programa "Doñana 2005", cuyo fin era la regeneración hídrica de las marismas.

El Parque Nacional de Doñana y el Parque Natural se convirtieron en el "Espacio Natural de Doñana", un único territorio dividido en áreas con diferentes grados de protección ambiental.

En el año 2010, se expropiaron 9200 hectáreas de parque de la Junta de Andalucía, pasando a formar parte de Medio Ambiente.

En el año 2012, la Unesco aprobó la ampliación de la Reserva de la Biosfera de Doñana.

Este clima mediterráneo se caracteriza por tener inviernos húmedos y veranos secos, que son resultado de las variaciones del frente polar y de las altas presiones subtropicales. 

En primavera y en otoño se pueden dar lluvias torrenciales provocadas por la acumulación de calor en las masas de agua durante el verano, y la llegada de gotas frías polares.

En invierno pueden aparecer anticiclones térmicos.

Las temperaturas son suaves durante todo el año.

Las temperaturas máximas varian unos 17 °C desde el invierno hasta el verano. 

Lo más significativo del clima son los tres o cinco meses de aridez en verano, cuando está bajo el dominio del anticiclón subtropical.

Hay muchas especies de árboles, como el pino; de flores, como la rosa; y de arbustos. 

Este ecosistema de dunas móviles es casi inexistente en otros lugares de la Península Ibérica, siendo consecuencia del fuerte viento del sur-oeste. 

El enterramiento de la vegetación y de árboles que luego emergen muertos, a cargo de los lentos movimientos de arena es uno de los más conocidos fenómenos de la zona de playa del parque.

Zona costera al Oeste del Parque nacional, es un terreno de dunas fósiles con varias lagunas y zonas húmedas, ocupada por una gran masa forestal de pino y eucaliptos y abundante fauna, incluyendo ejemplares de lince.

Parque Norte-Pinares de Hinojos: 

Zona situada al norte del Parque Nacional, con zonas de marisma y bosques. 

Parque Este-Brazo de la Torre-Entremuros: 

Zona situada al este del Parque Nacional, con zonas de marisma y caños, donde acuden las aves que habitan en Doñana durante los veranos e inviernos de sequía. Parte de las marismas están transformadas para el cultivo del arroz.

Pinar de La Algaida-Marismas de Bonanza: 

Zona situada al sureste del Parque Nacional, que incluye un gran bosque de pinos y una zona de marisma en la que existen explotaciones de salinas. Estas marismas son las únicas que se siguen inundando con las mareas, ya que las demás dependen exclusivamente de los cauces de agua dulce y de la lluvia, y en ellas se encuentran flamencos y avocetas. El Pinar de la Algaida existe por repoblación desde principios del siglo XIX y contiene una gran colonia de milanos.

Diversos estudios y grupos ecologistas insisten en una serie de problemas que ponen en riesgo flora, fauna, agua y suelo. Si bien la presión urbanizadora y sus diversas demandas ha sido un problema a lo largo de los años, éste no es el único problema. 

La Unesco ha valorado en diversas ocasiones la inscripción del Parque en la lista del patrimonio mundial en peligro. El Parque se encuentra incluido en la Lista Roja del Patrimonio en peligro.

Por otro lado, la necesidad de extraer el Guadalquivir para permitir la entrada-salida de buques hacia el Puerto de Sevilla, se ha señalado como causa de serias alteraciones en la dinámica del río. 

Adena ha vinculado el paso de estos barcos con la entrada de nuevas especies de animales en los ecosistemas, cuando éstos soltaban agua de lastre en la que se contenían estas especies. El Puerto de Huelva forma uno de los principales riesgos medioambientales.

La fresa es cultivada en invernaderos, en una superficie bajo plástico en el entorno de Doñana de entre 4.500 y 6.000 hectáreas, de donde sale más del 60% de la producción de fresa española.

Las demandas de agua de complejos residenciales cercanos también podrían afectar la dinámica de aguas en el Parque. 

Por último, se plantean el riesgo de salinización de sus aguas relacionados con el cambio climático y la profundización de su capa de agua. Así, la entrada de agua salada procedente del Atlántico podría poner en peligro a varias especies de animales y a la flora del Parque. 

Por el contrario, los riesgos de desertización también serían visibles.

Ocurrió en el año 1998. 

Ese día una balsa de la empresaBoliden-Apirsa en Sanlúcar la Mayor y que contenía en torno a 8 hm³ de residuos de metales pesados se rompió produciendo un importante vertido al cercano río Guadiamar y desplazándose a través de éste al Preparque. 

Aunque ahí fue frenado mediante muros y desviado al Guadalquivir, camino al mar se evidenció los riesgos ambientales a los que está sometido el débil ecosistema del espacio natural de Doñana.

Se creó en 1.965 gracias al Gobierno de España para garantizar las investigaciones científicas en los ecosistemas de la zona, donde se investigan también otros ecosistemas nacionales e internacionales. 

La EBD, se distribuye en un centro de investigación en Sevilla, la Reserva Biológica de Doñana en Almonte y una Estación de Campo en el Parque Natural de las Sierras de Cazorla, Segura y Las Villas en la provincia de Jaén.

A este centro pertenece la RBD dentro del Parque Nacional y con 6.794 hectáreas a la que se le suma la Reserva Biológica de Guardamar.