Ao longo de sua infância, Gacy esforçou-se para fazer seu severo pai orgulhoso dele, mas raramente conseguia sua aprovação. Esse atrito foi uma constante durante sua infância e adolescência. Uma das mais antigas memórias da infância de Gacy era a de seu pai a surrá-lo com um cinto de couro quando ele tinha quatro anos por ter desarrumado acidentalmente peças de um motor que seu pai havia montado.

John Gacy,sofria constante de seu pai,pq sua mãe o defendia muito, apelidando como bichinha,por sempre correr para os braços de sua mãe.

Durante o seu namoro com Marlynn, Gacy se juntou à sucursal da organização cívica Jaycees e se tornou um incansável trabalhador em prol da organização, acabando por ser eleito o "homem-chave" da instituição em 1964. No mesmo ano, Gacy teve sua segunda relação homossexual. De acordo com Gacy, ele consentiu com esse incidente depois de um de seus colegas da sucursal Jaycee de Springfield embebedá-lo e convidá-lo a passar a noite em seu sofá; o colega então lhe fez sexo oral enquanto ele estava bêbado.

Apenas 27 das vítimas de Gacy foram conclusivamente identificadas. À época de seu julgamento, 22 das vítimas foram identificadas. Em março de 1980, dois outros cadáveres desenterrados do espaço sob o soalho da casa de Gacy foram identificados via registros dentários e radiológicos, tais como os de Kenneth Parker e Michael Marino; ambos foram reportados como desaparecidos a 25 de outubro de 1976, um dia depois de seus desaparecimentos.

• Em maio de 1986, a nona vítima exumada do espaço sob o soalho foi identificada como Timothy Jack McCoy, a primeira vítima de Gacy. Uma outra vítima foi identificada em novembro de 2011 via teste de DNA como sendo William George Bundy, um trabalhador da construção de 19 anos que foi visto pela última vez por sua família a caminho de uma festa a 26 de outubro de 1976.Bundy aparentemente havia trabalhado para Gacy antes de ser assassinado.Logo após a prisão de Gacy, sua família contatou o dentista de Bundy na esperança de enviar seus registros odontológicos para comparação com com os corpos não identificados. Entretanto, os registros tinham sido destruídos depois que o dentista se aposentou. Uma segunda vítima foi identificada via teste de DNA em julho de 2017 como sendo uma rapaz de 16 anos de Saint Paul, Minnesota, chamado James "Jimmy" Haakenson, o qual contatou sua família pela última vez em 5 de agosto de 1976. Trinta e cinco anos depois, seu sobrinho, intrigado pela história familiar não resolvida, preencheu um formulário que a polícia disponibilizou para a reabertura do caso; as características coincidiram com três dos corpos, segundo a investigação do detetive responsável Jason Moran e o xerife local Tom Dart. Após o teste de DNA, Jimmy finalmente foi identificado e sua família pôde fazer um funeral apropriado. Infelizmente sua mãe morreu antes de saber o que houve com o filho. O caso ganhou repercussão e foi reportado em um programa de TV.

-Nomes das vítimas que foram identificadas-

• Timothy McCoy (16)

• 3 de janeiro de 1972 Corpo 9. Espaço sob o soalho.

• John Butkovich (18)

• 31 de julho de 1975 Corpo 2. Garagem.

• Darrell Samson (18)

• 6 de abril de 1976 Corpo 29. Sala de jantar.

• Randall Reffett (15)

• 14 de maio de 1976 Corpo 7. Espaço sob o soalho.

• Samuel Stapleton (14)

• 14 de maio de 1976 Corpo 6. Espaço sob o soalho.

• Michael Bonnin (17)

• 3 de junho de 1976 Corpo 18. Espaço sob o soalho.

• William Carroll (16)

• 13 de junho 1976 Corpo 22. Espaço sob o soalho.

• James Haakenson (16)

• 5 de agosto de 1976 Corpo 24. Espaço sob o soalho.

• Rick Johnston (17)

• 6 de agosto de 1976 Corpo 23. Espaço sob o soalho.

• Kenneth Parker (16)

• 24 de outubro de 1976 Corpo 15. Espaço sob o soalho.

• Michael Marino (14)

• 24 de outubro de 1976 Corpo 14. Espaço sob o soalho.

• William Bundy (19)

• 26 de outubro de 1976 Corpo 19. Espaço sob o soalho.

• Gregory Godzik (17)

• 12 de dezembro 1976 Corpo 4. Espaço sob o soalho.

• John Szyc (19)

• 20 de janeiro de 1977 Corpo 3. Espaço sob o soalho.

• Jon Prestidge (20)

• 15 de março de 1977 Corpo 1. Espaço sob o soalho.

• Matthew Bowman (19)

• 5 de julho de 1977 Corpo 8. Espaço sob o soalho.

• Robert Gilroy (18)

• 15 de setembro de 1977 Corpo 25. Espaço sob o soalho.

• John Mowery (19)

• 25 de setembro de 1977 Corpo 20. Espaço sob o soalho.

• Russell Nelson (21)

• 17 de outubro de 1977 Corpo 16. Espaço sob o soalho.

• Robert Winch (16)

• 10 de novembro de 1977 Corpo 11. Espaço sob o soalho.

• Tommy Boling (20)

• 18 de novembro de 1977 Corpo 12. Espaço sob o soalho.

• David Talsma (19)

• 9 de dezembro de 1977 Corpo 17. Espaço sob o soalho.

• William Kindred (19)

• 16 de janeiro de 1978 Corpo 27. Espaço sob o soalho.

• Timothy O'Rourke (20)

• June 16–23 de junho de 1978 Corpo 31. Rio Des Plaines.

• Frank Landingin (19)

• 4 de novembro de 1978 Corpo 32. Rio Des Plaines.

• James Mazzara (20)

• 24 de novembro de 1978 Corpo 33. Rio Des Plaines.

• Robert Piest (15)

• 11 de dezembro de 1978 Corpo 30. Rio Des Plaines.

• Francis Wayne Alexander (apenas identificado em 2021)

• 
  

Seis das vítimas permanecem sem identificação, cinco das quais foram enterradas no espaço sob o soalho, com mais um jovem enterrado aproximadamente a 4,6 m de distância da churrasqueira de seu quintal. Especialistas usaram os crânios das vítimas não identificadas para criar reconstruções faciais. Baseados na confissão de Gacy, nas informações acerca de onde as vítimas identificadas enterradas no espaço sob o soalho e na análise forense, a polícia esteve apta a determinar quando suas vítimas não identificadas foram mortas.

-Vítimas não identificadas-

• Por volta de janeiro de 1974. Corpo 28. Quintal. Rapaz entre 14–18 anos.

• Entre 13 de junho e 5 de agosto de 1976. Corpo 26. Espaço sob o soalho. Rapaz entre 23-30 anos.

• Entre 6 de agosto de 5 de outubro de 1976. - Corpo 13. Espaço sob o soalho. Rapaz entre 18 e 22 anos.

• Entre 6 de agosto e 24 de outubro de 1976. Corpo 21. Espaço sob o soalho. Rapaz entre 15 e 24 anos.

• Entre dezembro de 1976 e 15 de março de 1977. Corpo 5. Rapaz entre 22 e 32 anos.

• Entre 15 de março e 5 de julho de 1977. Corpo 10. Rapaz entre 17 e 21 anos.