Como resposta, em 8 de dezembro de 1660, enquanto a praça de pelourinho estava cheia pela homenagem à Nossa Senhora da Conceição, centenas de homens invadiram a câmara municipal e dominaram a cidade por 5 meses. Nesse tempo, o governador estava fora, o que propiciou a tomada de decisões tais como a suspensão dos impostos do aguardente. Entretanto, quando o governador retornou, os rebeldes foram presos e seu líder, Barbalho Bezerra, foi decapitado. Não obstante, em janeiro de 1661, a Câmara do RJ autorizou a produção da cachaça, o que desagradou a metrópole, que estava investindo no consumo do vinho.

Grão-Pará, que passou a ser monopólio das exportações e prejudicou a economia dos colonos.Como resposta, 80 homens armados- liderados pelos irmãos Beckman- invadiram a Companhia do Comércio, além de organizar uma junta na câmara municipal e fazer a população se revoltas com os jesuítas, pois eles que queriam a cessão da escravização dos índios nativos. A situação ficou assim por aproximadamente um ano, quando a Coroa encarregou o governador Gomes Freire de enviar homens armados, destruíram a cidade e acabaram com a revolta. Isso aconteceu, e um dos irmãos foi executado e o outro, preso em Lisboa.