Historia de la Bioinformática by Jimena Flores Montufar

2000 - Definición de Bioinformática

2025-01-28 19:25:03 UTC

Brown definió la bioinformática como "el uso de computadores para la adquisición, manejo y análisis de la información biológica", de modo que la contextualiza "en la intersección de la biología molecular, la biología computacional, la medicina clínica, las bases de datos informáticas, el Internet y el análisis de secuencia"

1945 - 1955: 1ra proteína secuenciada completamente

2025-01-28 19:40:15 UTC

Frederick Sanger y sus colegas de la universidad de Cambrige secuenciaron completamente por primera vez una proteína, la insulina

2023 - Metagenómica: Un Nuevo Enfoque en el Estudio de Microbiomas

2025-01-28 19:41:05 UTC

Permite a los científicos estudiar las comunidades microbianas de forma integral y sin necesidad de cultivo. Estas técnica ayudan a la secuenciación y el análisis de material genético recuperado de muestras ambientales.

1992 - Fundación del Instituto Europeo de Bioinformática (EBI)

jimenaflores1528 — 2025-01-28 19:41:45 UTC

El EBI es una de las principales instituciones que promueve la investigación y el desarrollo en bioinformática.

2000 - Proyecto del genoma de Arabidopsis thaliana

jimenaflores1528 — 2025-01-28 19:44:36 UTC

Se publica el genoma de Arabidopsis thaliana, una planta modelo, un gran avance para la biología vegetal.

1995 - Secuenciación del genoma de Mycoplasma genitalium

jimenaflores1528 — 2025-01-28 19:46:55 UTC

Se secuencia el genoma de una de las bacterias más pequeñas, marcando otro hito en la secuenciación genómica.

2008 - Lanzamiento del Proyecto 1000 Genomas

jimenaflores1528 — 2025-01-28 19:49:01 UTC

Un proyecto internacional para mapear la variabilidad genética humana a nivel global.

Con el objetivo secuenciar los genomas de al menos 1.000 voluntarios de múltiples poblaciones de todo el mundo para mejorar nuestra comprensión de la contribución genética a la salud y la enfermedad humanas.

1990 - Llegada de BLAST

paolaflores9197 — 2025-01-28 19:49:27 UTC

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) es una herramienta bioinformática que se utiliza para encontrar similitudes entre secuencias biológicas, se emplea para comparar una secuencia de interés con una base de datos de secuencias conocidas,

En 1990 fue Stephen Altschul quien publico un articulo titulado "Basic Local Alignment Search Tool" describiendo como este mejoraba la velocidad y eficiencia en comparación a los métodos previos que eran computacionalmente muy costosos y lentos, BLAST revolucionó este campo al permitir búsquedas más rápidas y con menos recursos. La introducción de BLAST fue un cambio radical.

1965 - Publicación de "Atlas de secuencia y estructura de proteínas"

2025-01-28 19:50:17 UTC

La doctora Dayhoff desarrolló métodos computacionales que le permitieron comparar secuencias proteicas y a partir de los alineamientos entre ellas investigar las relaciones y por tanto la historia evolutiva entre los diferentes reinos, phyla y taxa biológicos. Su monumental trabajo, que recopilaba todas las secuencias proteicas entonces conocidas, se publicó en un pequeño libro titulado "Atlas de secuencias y estructuras de proteínas"

1980 - 1ra base de datos computarizada con secuencias de A. N. y proteínas

2025-01-28 19:54:50 UTC

La Dr. Dayhoff creó esta base de datos en un computador casero que los usuarios externos podían conectarse por vía telefónica

2010 - Primer genoma de un organismo sintetizado completamente

jimenaflores1528 — 2025-01-28 19:55:49 UTC

Un grupo de científicos de Cambridge, en Reino Unido, creó el primer organismo vivo del mundo con un código ADN completamente sintético.

La bacteria, denominada Syn61, es una versión artificial de la bacteria E. coli que vive en el intestino. Su código genético fue alterado y rediseñado significativamente.

2023 - Metagenómica: Un Nuevo Enfoque en el Estudio de Microbiomas

2025-01-31 16:02:10 UTC

2020 - Biología computacional y modelado estructural

marianagalvan9190 — 2025-01-31 16:20:20 UTC

Avances importantes en biología computacional, especialmente en el modelado de estructuras de proteínas. Herramientas como AlphaFold, desarrollada por DeepMind en 2020

2022 - Plataformas de Inteligencia Artificial en Investigación Biomédica:

marianagalvan9190 — 2025-01-31 16:29:11 UTC

El uso de plataformas como GPT-3 y otras redes neuronales para la automatización de análisis bioinformáticos creció enormemente, facilitando el procesamiento de grandes volúmenes de datos biológicos.

2022 - AlphaFold Protein Structure Database

marianagalvan9190 — 2025-01-31 16:36:35 UTC

se lanzó la AlphaFold Protein Structure Database, un recurso que contiene más de 200 millones de predicciones de estructuras proteicas. Esto aceleró la investigación en biología molecular, ayudando a los científicos a comprender enfermedades relacionadas con proteínas mal plegadas, como el Alzheimer.

2024- Bioinformática aplicada a enfermedades neurodegenerativas

marianagalvan9190 — 2025-01-31 16:45:04 UTC

La bioinformática avanzó en el análisis de enfermedades neurodegenerativas, como el Alzheimer y el Parkinson. La integración de datos genómicos y epigenéticos, junto con tecnologías como el análisis de imágenes cerebrales, proporcionó nuevas perspectivas sobre los mecanismos moleculares subyacentes a estas enfermedades.

1983 - Protein Sequence Database (PSD)

gisselaflores1523 — 2025-02-02 02:41:52 UTC

Para este año PSD era la base de datos mas grande del mundo con mas de 2,000,000 de nucleótidos secuenciados y este hallazgo fue posible con la llegada del internet.. Esta red facilitó acceso para los usuarios así como también el desarrollo de software necesario en el manejo y análisis de innumerables cantidades de datos.

1984 - Protein Identification Resource (PIR)

gisselaflores1523 — 2025-02-02 02:49:47 UTC

Años después de la muerte de la doctora Dayhoff, su sueño de poner en funcionamiento un sistema en línea (online) consistente en programas y bases de datos accesibles a toda la comunidad científica mundial, comenzó a hacerse realidad. Cualquiera podía identificar proteínas a partir de los datos de composición de aminoácidos o de secuencias, como también efectuar predicciones con base en éstas, o sencillamente buscar información

2002 - UniProt

gisselaflores1523 — 2025-02-02 02:53:01 UTC

A partir del año 2002, PIR-PSD se asoció con EBI (European Bioinformatics Institute) y SIB (Swiss Institute of Bioinformatics), para dar origen a una única base de datos de secuencia y función de proteínas, conocida en la actualidad como UniProt

1980 - 1990 El impacto de Margaret Oakley Dayhoff

gisselaflores1523 — 2025-02-02 02:57:23 UTC

El trabajo de Margaret Oakley Dayhoff impulsó la generación de bases de datos primarias como GenBank, FASTA y BLAST (Basic Local Alignment Tool). Mientras GenBank almacenaba y catalogaba las secuencias de ADN y de proteínas, BLAST permitía comparar con mayor rapidez que su predecesor FASTA las secuencias de interés contra cada una de las secuencias contenidas dentro de la enorme base de datos

1990 - Bioinformática

gisselaflores1523 — 2025-02-02 02:59:44 UTC

La bioinformática estuvo muy caracterizada en la década de 1990 por la utilización de bases de datos primarias que contenían información experimental en gran escala en las áreas de genómica y proteómica, lo que permitió comprender las funciones de los genes y de las proteínas.

1990 - Fundación del Proyecto Genoma Humano (HGP)

paolaflores9197 — 2025-02-03 19:55:33 UTC

El Proyecto Genoma Humano es oficialmente lanzado en 1990 como un esfuerzo internacional de colaboración entre científicos de diversas disciplinas, incluyendo genética, bioinformática, biotecnología y medicina. Su principal objetivo es secuenciar y mapear todo el ADN humano, lo que implica identificar y analizar los aproximadamente 3,000 millones de pares de bases que conforman el genoma humano. Este proyecto representa uno de los mayores avances científicos del siglo XX, ya que busca comprender la estructura genética del ser humano y cómo los genes influyen en la salud, el desarrollo y las enfermedades.

1995 - Secuenciación del primer genoma bacteriano (Haemophilus influenzae)

paolaflores9197 — 2025-02-03 20:00:22 UTC

Este logro fue posible gracias a los avances en la tecnología de secuenciación y el desarrollo de nuevos métodos computacionales de ensamblaje del ADN. Haemophilus influenzae es una bacteria modelo en estudios genéticos y es conocida por causar infecciones respiratorias y meningitis en humanos. La importancia de este avance radica en que es la primera vez que se secuencia un organismo vivo completo, demostrando la viabilidad de secuenciar genomas enteros de organismos más complejos. Además, el éxito de este proyecto sirve como un punto de referencia para futuras investigaciones en microbiología, genética y bioinformática.

2000 - Secuenciación del genoma de Drosophila melanogaster

paolaflores9197 — 2025-02-03 20:06:41 UTC

El análisis de su genoma revela que muchos de los genes presentes en Drosophila tienen homólogos en los humanos, lo que significa que comparten funciones biológicas similares. Este descubrimiento confirma que la mosca de la fruta es un excelente modelo para estudiar enfermedades genéticas humanas y procesos biológicos fundamentales como el desarrollo embrionario y la regulación genética. La secuenciación del genoma de Drosophila también marca el inicio de una nueva era en la biología comparativa, ya que permite a los científicos comparar genomas de diferentes especies para entender la evolución genética y la conservación de genes esenciales.

2001 - Publicación del primer borrador del genoma humano

paolaflores9197 — 2025-02-03 20:15:19 UTC

Uno de los acontecimientos más esperados en la historia de la genética ocurre en febrero de 2001, cuando se publica el primer borrador del genoma humano en dos revistas científicas líderes: Nature y Science. El borrador del genoma humano proporciona un mapa preliminar de la secuencia de ADN humano, aunque con ciertas lagunas y regiones incompletas. Sin embargo, permite por primera vez explorar la organización de los genes humanos y su relación con las funciones celulares y enfermedades genéticas. A partir de este hito, el Proyecto Genoma Humano continúa refinando la secuencia del ADN humano hasta su publicación final en 2003, cuando se considera completa en un 99.9%.

1953 - Descubrimiento de la estructura del ADN

erickestrada1531 — 2025-02-04 00:09:51 UTC

El descubrimiento de la estructura del ADN en 1953 es uno de los hitos más importantes en la historia de la biología. Este descubrimiento fue realizado por los científicos James Watson y Francis Crick, quienes propusieron el modelo de la doble hélice del ADN. Su trabajo se basó en investigaciones previas de otros científicos, como Rosalind Franklin y Maurice Wilkins, quienes realizaron estudios cruciales utilizando la difracción de rayos X

1960 - Primeros intentos de usar computadoras en biología

erickestrada1531 — 2025-02-04 00:18:17 UTC

En 1960, se desarrolló COBOL, el primer lenguaje de programación de alto nivel transportable entre modelos diferentes de computadoras, lo que facilitó el uso de computadoras en diversos campos, incluyendo la biología. Sin embargo, un hito específico en la intersección entre la computación y la biología ocurrió en 1950, cuando el EDSAC (Electronic Delay Storage Automatic Calculator), diseñado por Maurice Vincent Wilkes, se utilizó para resolver un problema en el campo de la biología: una ecuación diferencial relacionada con las frecuencias genéticas.

1970 - Algoritmo de Smith-Waterman

erickestrada1531 — 2025-02-04 00:25:55 UTC

El algoritmo de Smith-Waterman, propuesto por Temple F. Smith y Michael S. Waterman en 1981, es una técnica de alineación de secuencias que se utiliza para encontrar regiones similares entre dos secuencias de ADN, ARN o proteínas. Este algoritmo es una variación del algoritmo Needleman-Wunsch y se basa en la programación dinámica1. A diferencia del algoritmo Needleman-Wunsch, que realiza una alineación global, el algoritmo de Smith-Waterman se centra en la alineación local, lo que significa que identifica las regiones más similares dentro de las secuencias comparadas.

1977 - Secuenciación de ADN de Sanger

erickestrada1531 — 2025-02-04 00:30:34 UTC

Frederick Sanger desarrolló el método de secuenciación de ADN conocido como método de Sanger. Este método revolucionario permitió la secuenciación del genoma del bacteriófago Phi-X174, el primer ácido nucleico secuenciado completamente en la historia. El método de Sanger se basa en el uso de didesoxinucleótidos trifosfato como terminadores de la cadena de ADN. La muestra de ADN se divide en cuatro reacciones de secuenciación separadas que contienen los cuatro desoxinucleótidos estándar y una ADN polimerasa. En cada reacción se añade solo uno de los cuatro didesoxinucleótidos. La incorporación de un didesoxinucleótido en la cadena naciente de ADN termina su extensión, produciendo varios fragmentos de ADN de longitud variable.