- Para poder ver las muestras es necesario darles color mediante tinciones, que hacen que las estructuras sean visibles al atravesarlas la luz.

- Estas muestras de tejidos se toman mediante un instrumento que corta láminas muy finas (para poder ser atravesadas por la luz) y que se llama microtomo.

- El brazo es la estructura principal del microscopio y conecta la base con el sistema óptico.

- El sistema mecánico incluye también la platina, es decir, la pieza horizontal donde se coloca la muestra.

- La platina no está conectada de forma fija con el brazo sino que su posición se puede regular mediante los tornillos macrométrico y micrométrico.

- El revólver es la parte del microscopio donde están montados los objetivos, normalmente 3 o 4, y que puede girar para seleccionar el objetivo deseado.

- Finalmente, el tubo conecta los objetivos con el ocular.

- Antes de llegar a la muestra los rayos atraviesan un condensador, la función del cual es concentrar los rayos de luz sobre la preparación a observar.

- Habitualmente el condensador está acoplado con un diafragma para regular la cantidad de luz incidente.

- El siguiente elemento óptico es el objetivo. Esta parte del microscopio consiste básicamente en un conjunto de lentes que reciben la luz proveniente de la muestra y permiten aumentar la imagen observada.

- Por último, el ocular amplía la imagen proveniente del objetivo y es a través de él que se puede observar finalmente la muestra.

•El sistema óptico incluye el conjunto de lentes y elementos de manipulación de la luz necesarios para generar una imagen aumentada.

•El sistema mecánico proporciona el soporte estructural a los anteriores elementos. La imagen contigua muestra las partes esenciales de un microscopio.

- Dentro los microscopios electrónicos, puede distinguirse entre microscopio electrónico de transmisión, que muestran imágenes del interior de la célula a nivel de orgánulos; y microscopio electrónico de barrido, que muestran imágenes de las superficies celulares.

- El funcionamiento del microscopio electrónico consiste en una fuente de electrones que son acelerados a gran velocidad. Estos electrones impactan con la muestra de modo equivalente a como la luz podría iluminarla. Algunos de estos electrones son reflejados por la muestra y otros la atraviesan. Mediante la detección estos electrones es posible reconstruir una imagen de la muestra.

- Fuente de electrones: Es equivalente a la fuente de luz en un microscopio óptico. En este caso es necesario disponer de un emisor de electrones. En general se utiliza un filamento de tungsteno. Estos electrones libres son a continuación dirigidos hacia la muestra.

- Lentes electromagnéticas: Los microscopios ópticos tienen lentes convergentes y divergentes para desviar los rayos de luz y aumentar la imagen de la muestra. En lugar de lentes de vidrio, los microscopios electrónicos utilizan lentes electromagnéticas que generan campos eléctricos y magnéticos que dirigen  a los electrones hacia un punto.

- Cámara de vacío: Este procedimiento debe llevarse a cabo dentro de una cámara de vacío. Si no, los electrones interactuarían con las moléculas del aire y no atravesarían la muestra adecuadamente. La muestra también debe colocarse dentro de esta cámara, por eso no es posible observar muestras vivas con un microscopio electrónico.

- Detector (Pantalla fluorescente): Una vez los electrones han impactado contra la muestra es necesario medir algún tipo de información para poder reconstruir la imagen de la muestra. Una opción consiste en utilizar una pantalla fluorescente. Esta pantalla reacciona de modo distinto según cual sea el número de electrones que impactan en ella. De este modo es posible detectar las zonas donde impactan más o menos electrones y deducir así la imagen de la muestra.

- La información capturada por la pantalla fluorescente es transmitida a un ordenador que puede asignar colores artificiales a la imagen obtenida. En los microscopios ópticos estos componentes no son necesarios porque la luz proveniente de la muestra es directamente observada con el ojo humano. 

- Las muestras se observan directamente en una pantalla de ordenador y originalmente son de color blanco y negro. Así que para poder distinguir las estructuras mejor, se colorean artificialmente con un programa informático.

- Estas muestras de tejidos se toman mediante un instrumento que corta láminas muy muy finas (para poder ser atravesadas por los electrones) y que se llama ultramicrotomo. Las muestras son tan pequeñas y finas que caen en una pequeña cubeta desde donde luego son recogidas. Como muestra del proceso tenemos el siguiente vídeo.

Fuente: Montalvo, C. (2010)

Ápice raíz de cebolla.
Se distinguen las paredes celulares y los núcleos (azules) de la célula vegetal.

Escólex de Tenia
Parásito intestinal que se adhiere a los intestinos mediante los garfios presentes en la estructura llamada escólex

Desventajas:
- Lentes de cristal.

- Resolución: 0,1 µm.

- Hasta 2.000x.

- Muestras muy finas.

- Observa nivel estructura celular.
d. Gracias a la tinción de las muestras con colorantes.
e. Ventajas:
- Fuente: rayo de electrones.

- Lentes electromagnéticas.

- Resolución: 1 nm a 0,001 µm.

- Hasta 450.000x.
Desventajas:

- Muestra muerta y deshidratada.

- Muestras ultrafinas.

- Observa ultrastructuras.

- Se observa a través de una pantalla.

- Ultramicrotomo muy caro.
-Microscopio electrónico muy grande y muy caro.

f. Los colores en las muestras de microscopía electrónica se aplican sobre las imágenes reales mediante un programa informático.
g. X significa el número de aumentos con los que se puede observar una muestra.

h. Se parecen en que gracias a ambos instrumentos el hombre es capaz de observar muestras imperceptibles al ojo humano, pero se diferencian en que en el microscopio óptico sólo permite llegar hasta el nivel de estructura celular, mientras que con el microscopio electrónico podemos llevar a nivel de orgánulos celulares.