Virreyes: Tanto en la Nueva España como en el Perú, la máxima autoridad era el rey, pero el poder era delegado a un virrey, el cual gozaba de poder ejecutivo, judicial y militar. Gobernaban en el nombre de la Corona y actuaban como representantes directos de la realeza y actuaban como autoridad máxima en el territorio.

Organización Política: Ambos territorios eran regidos como autoridad máxima por un virrey, sin embargo, el poder y el control que se le otorgaba a este presidía directamente desde España, desde el consejo de Indias, que era controlado por la Corona. Después del virrey existían las audiencias, que se encargaban principalmente de la administración de la justicia pero también podían tomar funciones políticas, seguidas por los gobernadores y capitanes generales, luego los corregimientos/ intendencias y finalmente los cabildos.

Impacto de las Reformas Borbónicas: Mientras que en la Nueva España las reformas borbónicas impactaron de manera significativa, promoviendo la reorganización del virreinato, mejorando la administración y la recaudación fiscal mediante la creación de las intendencias, en el Perú tuvieron un impacto distinto. Se usaron para disminuir el poder del Virrey y desmantelar los corregimientos, buscando restablecer el control de la corona. Se fragmentó el virreinato (con la creación del virreinato del Río de Plata y el Virreinato de Nueva Granada) perdiendo así una parte importante de su extensión y su poder, lo que generó que la autoridad central en Lima se debilitará y la administración económica y política se desestabilizara.

Influencia de las Audiencias: Aunque las audiencias fueron instituciones creadas para funcionar como contrapeso junto al virrey, en el Perú la Audiencia de Lima era la más prestigiosa. Con frecuencia, adquiría un papel decisivo al tomar el control total del virreinato, fortaleciendo así su posición y convirtiéndose en un actor de poder constante, lo que terminaba por relegar a los virreyes a ser figuras de un puesto casi transitorio. Además, debido a factores como el tamaño y la dispersión del territorio, la Audiencia de Lima tuvo que asumir mayores responsabilidades de supervisión sobre los gobiernos locales y los territorios donde las fuerzas del virrey se veían limitadas, incrementando así su poder frente a la autoridad del virrey.

Por otro lado, la Audiencia de México en la Nueva España mantenía un poder más equilibrado en relación con el del virrey, como resultado de la mayor estabilidad existente en la organización de la administración, lo que evitaba que la audiencia tuviera que asumir un papel protagónico.

El estilo Plateresco: En la Nueva España se desarrolló un estilo artístico que mezclaba un estilo gótico, renacentista y musulmán. También se incluían elementos de la flora y fauna prehispánicos. A diferencia de el virreinato del Perú que estaban más inclinados al barroco andino que incluía más elementos incas que españoles.  

Organización Social: Ambos virreinatos tenían en la pirámide social primeramente a los españoles, quienes ocupan títulos nobiliarios o escudos y privilegios fiscales. En segundo lugar, a los criollos, quienes eran los españoles nacidos en las Indias, no contaban con muchos títulos políticos, sin embargo, se dedicaban a la industria y comercio. En tercer lugar, estaban los indios quienes eran los nativos de América realizaban los trabajos forzados y por último se encontraban los mulatos y negros quienes trabajaban las tierras. 

Las cartas de relación de Hernán Cortés: Escritas entre 1519-1526, fueron cinco cartas dirigidas para el Rey Carlos V donde se le informaba de todos los sucesos relacionados con la conquista del Nuevo Mundo. Estos textos epistolares son de gran importancia por su valor histórico pese a la notable manipulación de los mismos para el beneficio de Cortés.  

La crónica del Perú: Obra de Pedro Cieza de León (1520-1554), esta obra se encuentra dividida en cuatro partes: La crónica del Perú, El señorío de los incas, Descubrimiento y Conquista del Perú y Las guerras Civiles del Perú; Su importancia es mucha por su contenido histórico, geográfico y etnográfico. Es considerada el primer gran proyecto historiador del Perú por su magnitud.

Comentarios reales de los Incas: Obra publicada por el Inca Garcilaso de la Vega (1539-1616) en Lisboa (1609), es considerada una de sus más grandes obras donde habla sobre la cultura, costumbres e historia de los Incas y otros pueblos del Perú. Está junto a sus otras obras tienen un gran valor cultural ya que reivindica la historia y cultura de los Incas corrigiendo los errores de traducción en crónicas pasadas hechas por los conquistadores españoles.