Plateotômica by Érika Mallmann https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4 Criado com um passe de mágica en-us 2021-11-23 19:16:07 UTC 2025-11-29 17:46:13 UTC hello@padlet.com Estrutura de proteínas erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909142918 2021-11-23 19:17:06 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909142918 RCSB PDB erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909146116 Figura 1: Análise do site RCSB PDB]]> 2021-11-23 19:19:11 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909146116 Swiss-model erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909150071 Figura 2: Análise do site Swiss-model]]> 2021-11-23 19:21:43 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909150071 Questões: erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909152096 2021-11-23 19:23:11 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909152096 1. Os modelos (SWISS-MODEL) e as estruturas obtidas por métodos experimentais (RCSB PDB) são parecidos (tem a mesma conformação, estruturas secundárias)? erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909152644 Como é possível perceber nas imagens acima, nos dois sites, a questão de resultados, mostram como elas são bastante semelhantes, de acordo com a suas sequências; variando suas estruturas e composições conforme o modelo sequenciado.]]> 2021-11-23 19:23:32 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909152644 2. O modelo e a estrutura resolvida estão no mesmo estado oligomérico (monômero, dímero, trímero, etc...)? erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909153379 Se comparar um site com o outro, utilizando da mesma sequência, sim, como por exemplo na sequência do Canal de ânions voltagem dependente, as estruturas são em um dímero (homo-dímero). Porém se analisar todas, elas podem variar, tendo estruturas diferentes, citando os dois exemplos do Beta-galactose, que o do Homo sapiens é dímero e o Eschericha coli que é polímero.]]> 2021-11-23 19:23:51 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909153379 3. Existem outras moléculas ligadas a essa estrutura? Se sim, quais? (ligand = ligante, carbohydrate = carboidrato, íons...) erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909153740 O canal de ânions voltagem dependente (Danio rerio), tem sim, sendo o ligante Lauryl Dimethylamine-n-oxide (C 14 H 31 NO) - SYELZBGXAIXKHU-UHFFFAOYSA-N.]]> 2021-11-23 19:24:05 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909153740 4. Qual a conformação geral da estrutura secundária (alfa-hélice, folhas beta, ambos, ou outra? Explique com suas palavras se preferir). erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909154040 Analisando a estrutura do canal de ânion, a conformação é folhas beta, por ser formada por uma espécie de cadeia, que vai um para direita outro para esquerda, ou como em um zig-zag, sendo um estrutura planar que se dobra, com regiões vizinhas associadas por ligações de hidrogênio, sendo de estrutura flexível.]]> 2021-11-23 19:24:19 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909154040 5. Por qual motivo você acha que as estruturas da beta-galactosidase de humanos e de E. coli são tão diferentes estruturalmente se tem a mesma função? erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909154345 Acredito que sejam diferentes, por conta do uso e também por ser um indivíduo diferente, com um sistema totalmente diferente.]]> 2021-11-23 19:24:33 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909154345 6. Qual a estrutura chamou mais sua atenção? O que o deixou curioso em relação às proteínas? erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909154722 A que mais me chamou a atenção como citei anteriormente, foi a Estrutura cristalina do canal 2 do ânion dependente de voltagem do peixe-zebra, pela formação da estrutura, com dois tubos juntos, que é bem diferente dos outros exemplos que foram mostrados.

]]> 2021-11-23 19:24:49 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909154722 Swiss-model erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909342113 Figura 3: Representação por spacefill]]> 2021-11-23 22:06:22 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909342113 Swiss-model erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909344311 Figura 6: Representação por ball and stick]]> 2021-11-23 22:08:52 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909344311 RCSB PDB erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909346313 Figura 5: Representação por ball and stick]]> 2021-11-23 22:11:09 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909346313 RCSB PDB erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909346646 Figura 4: Representação por spacefill]]> 2021-11-23 22:11:31 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909346646 Análise erikamallmannlj015 https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909368351 Observando os dois site mostrados durante o curso é possível perceber que os resultados aparecem com valores bastante parecidos, no entanto o RCSB PDB tem alguns recursos a mais. Sendo que os dois tem bastante qualidade, e fáceis de manusear, podendo explorar diversas funções interessantes, como é possível ver nas imagens acima e mais detalhadas as proteínas abaixo. ]]> 2021-11-23 22:36:30 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/1909368351 Avaliação wemersonoliveira https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/2097979995 O relatório era para ter sido feito seguindo as normas do IF com introdução, referencial teórico, metodologia e resultados. ]]> 2022-03-16 13:03:31 UTC https://padlet.com/erikamallmannlj015/amkskg6sfys15zb4/wish/2097979995