Nessa área encontra-se uma grande quantidade de rios, tornando a bacia do Rio Amazonas como uma das mais ricas bacias hidrográficas do planeta, coletando água de inúmeros afluentes, das constantes chuvas e também de nascentes nivais localizadas nas elevadas altitudes do oeste do continente americano. O clima é do tipo equatorial, predominantemente úmido (em função da evapotranspiração realizada pela floresta), com chuvas constantes, geralmente quente e com baixa amplitude térmica, com médias de temperatura girando em torno dos 24ºC.

A vegetação da Amazônia é comumente segmentada em três subtipos: a) as matas de igapó, localizadas em áreas de constante inundação; b) as matas de várzea, situadas em pontos de inundações periódicas, com destaque para a Seringueira; e c) as matas de terra firme, que não se localizam em pontos de inundações e ocupam a maior parte do espaço, sendo também as maiores espécies.

A hidrografia é caracterizada pela presença da bacia do Tocantins-Araguaia. Mas como essa região é considerada como o divisor de águas do país, encontram-se também áreas da Bacia do São Francisco e do Paraná. A existência do Aquífero Guarani também torna essa faixa natural como uma importante zona de recursos hídricos do Brasil. O clima da região envolve a existência de duas estações bem definidas: um verão quente e chuvoso e um inverno com alguns períodos frios e muito seco, ou seja, com baixíssimas umidades.

A maior parte dos solos do cerrado é ácida, porém ricos em ferro e alumínio. Por esse motivo, a agricultura só veio a avançar completamente sobre esse domínio morfoclimático após a descoberta da técnica da calagem, na qual se adiciona calcário para diminuir a acidez do solo e favorecer o plantio. A expansão rápida e descontrolada da fronteira agrícola na região fez com que o cerrado perdesse a maior parte de sua vegetação natural, estando esse bioma hoje com menos de 20% de seu espaço ainda preservado.

O domínio dos mares de morro recebe essa denominação em virtude de suas formas de relevo, conhecidas por seu formato convexo, em formas de “meias laranjas”, como se pode dizer popularmente, aparentando literalmente mares de pequenos morros propriamente ditos.

O clima é bastante ativo, agindo diretamente na modelagem do relevo, o que ajuda a explicar a sua aparência acima descrita. As chuvas são frequentes, com médias de 1500 mm na maior parte das áreas e índices maiores em faixas de maiores altitudes, fazendo com que as redes de drenagem sejam abundantes e que predominem os processos erosivos e intempéricos à parte das ações das águas pluviais.

Uma boa parte das formas de relevo é composta por planaltos, constituídos basicamente por basaltos (um tipo de rocha vulcânica), o que indica a presença de vulcanismos em eras geológicas anteriores. A sedimentação dessa formação rochosa deu origem, em alguns pontos, à “terra roxa”, um tipo de solo bastante fértil e favorável ao plantio.

A Mata de Araucária, predominante na região, foi bastante explorada ao longo da história para a produção de móveis e também de papel, de tal modo que resta apenas 10% de sua vegetação original.

No entanto, há um intenso uso do solo na região. O plantio costuma ser realizado em áreas de várzea, o que foi responsável pela quase extinção das matas ciliares locais, além da atividade pecuária que intensificou o desgaste do solo, havendo várias áreas em que atua o processo.

O relevo dessa região ajuda a explicar, em partes, as condições climáticas locais. Trata-se de uma área de várias depressões, onde o relevo ao redor, sobretudo os planaltos, morros e chapadas, contribui para barrar a umidade advinda das massas de ar, principalmente as oceânicas.