A los judíos en los territorios ocupados se les ordena, por lo general, reportarse en un punto central, a menudo con el pretexto de la deportación o son acorralados durante las incursiones. Luego, los nazis los llevan a un lugar remoto donde, finalmente, los ejecutan. Solo en 1941, aproximadamente unos 900.000 judíos soviéticos son asesinados de esta manera. 

Los judíos tenían importantes puestos en el gobierno y enseñaban en excelentes universidades de Alemania. De los treinta y ocho Premios Nobel ganados por escritores y científicos alemanes entre 1905 y 1936, catorce fueron para judíos. El matrimonio entre judíos y no judíos se estaba volviendo cada vez más frecuente. Si bien los judíos alemanes seguían sufriendo cierta discriminación en su vida social y en sus carreras profesionales, la mayoría confiaba en su futuro como alemanes. Hablaban el idioma alemán y consideraban que Alemania era su hogar.

La mayoría de los ghettos (ubicados principalmente en la Europa oriental ocupada por los nazis) estaban cerrados con muros, rejas de alambre de púas, o portones. Los ghettos eran extremamente insalubres y estaban atestados. El hambre, la escasez crónica, los inviernos duros, y la falta de servicios públicos resultaron en brotes epidémicos y una alta mortalidad.

Los nazis llamaban a estos seis campos "campos de exterminio". La mayoría de las personas deportadas fueron asesinadas de inmediato en grupos grandes mediante gas letal. Los nazis cambiaron al asesinato con gas como su método preferido de asesinato en masa dado que para ellos era "más limpio" y más "eficiente" que los fusilamientos. El uso de gas también les evitaba a los asesinos el estrés emocional que muchos miembros de los equipos móviles de matanza habían experimentado al dispararles a las personas frente a frente.