A coccidiose é fortemente vista em sistemas de criação mais intensivos, caracterizados pela alta densidade de animais alojados, podendo acometer frangos de corte, matrizes, galinhas poedeiras e perus. 

  As espécies de Eimeria sp. são específicas ao hospedeiro,isto é, espécies que infectam poedeiras não são as mesmas responsáveis por infectar perus. Além da especificidade, as diferentes espécies de Eimeria colonizam porções distintas do trato gastrointestinal das aves.

Ao ser liberado, os esporozoítos invadem as células intestinais e se multiplicam de forma assexuada. Os gametas são formados após um número variável de ciclos assexuados dando início à fase sexuada do desenvolvimento (gametogonia). A fase sexuada termina com a produção e liberação de oocistos no lúmen intestinal. 

Em geral, para animais de corte, que apresentam um ciclo de produção mais curto, são administrados medicamentos coccidicidas, capazes de matar os parasitas causadores da doença, o que estimula uma boa ação intestinal e, consequentemente, um maior ganho de peso. Para animais com ciclo de vida/produção mais longos, são utilizados medicamentos coccidiostáticos, capazes de neutralizar os parasitas em diferentes estágios de desenvolvimento, o que mantém as atividades intestinais normais por mais tempo, sem interferir na qualidade de vida desses animais e ainda promovendo resistência ao parasita. Em casos em que a doença gera danos intestinais ligados à perda de peso e má absorção dos nutrientes, os animais podem ser submetidos ao uso de probióticos em sua alimentação, a fim de recuperar os danos causados após a infecção.
Além disso, é importante realizar a limpeza e desinfecção do ambiente para que outras aves não sejam afetadas pela coccidiose.