Con l’espugnazione dell’insediamento sannita nel 293 a.C. ad opera dell'esercito romano guidato dal console Lucio Papirio Cursore, durante la terza guerra sannitica, l’insediamento a valle acquisisce maggiore rilevanza e vi si concentreranno numerose attività edilizie che culmineranno con l’assetto in età augustea.12 ettari, delimitati da una cinta muraria quadrangolare, sulla quale si aprono quattro porte monumentali in linea con il cardo e il decumano, gli assi stradali principali del municipio. All’incrocio degli assi maggiori si apre il foro, la piazza principale della città, su cui si affaccia la maggior parte degli edifici pubblici, tra cui spicca il bel colonnato della basilica, edificio con funzioni amministrative e non religiose.

Il nome antico dell’insediamento, già legato al centro sannitico, Saipins, o Saipinom è confluito in quello romano di Saepinum e sopravvissuto nel nome attuale del borgo di Sepino nato nell’alto medioevo; tutti hanno in sé la stessa radice del verbo latino saepio «recingo» e lasciano intuire la naturale vocazione del luogo, destinato alla sosta e al riposo delle greggi transumanti. Il nome Altilia deriverebbe dal termine arabo Al Tell ossia «città in rovina», doveva essere questa la condizione della città nell’ultima fase della sua vita, quando i Saraceni arrivarono in regione e invasero il territorio.

Ad oggi i resti dell’antica città romana (portata parzialmente alla luce dagli scavi archeologici) si mescolano ai casali in pietra, costruiti tra il XIV ed il XIX secolo con il materiale proveniente dai crolli degli edifici romani in rovina, allorquando l’area tornerà ad essere nuovamente abitata.

L'anfiteatro, di forma ellittica, è stato per metà scavato nel banco naturale di arenaria, e per la restante parte costruito in elevato, con il materiale di cava. Le due porte principali, dette convenzionalmente porta nord e porta sud, erano riservate, la prima, all'ingresso o all'uscita trionfante dei gladiatori, mentre la seconda all'uscita degli sconfitti. Ai lati di entrambe, quattro vani di servizio, gli spoliaria.

Della struttura originaria, oggi completamente restaurata, si conservano, oltre alle porte, anche parte di ima e di media cavea.  Il pubblico poteva accedere ai posti a sedere attraverso 12 vomitoria verticali e corridoi esterni, detti ambulacra, e assistere allo spettacolo riparati dal sole o dalla pioggia grazie al velarium, un sistema di copertura mobile costituito da tende azionate da corde.

La struttura è realizzata in opus mixtum, in cui si alterna l'opus quasi reticolata, con cubilia  realizzati in pietra tufacea locale, e l'opus in laterizio, in mattoncini. In base alla sua grandezza, è stato possibile stimare che potesse contenere circa 10 mila spettatori, rientrando così nella categoria degli anfiteatri di medie dimensioni.

Della scoperta facevano parte capitelli, cornici e statue tra cui due grandi statue maschili che al momento del ritrovamento vennero identificate in Augusto e Tiberio, riferibili all'età Giulio-Claudia (I sec. d. C.), tuttavia, secondo l'usanza del tempo vennero trasferite nel Museo Nazionale di Napoli, dove sono rimaste fino all'apertura del museo. Negli anni successivi, altro materiale si aggiunse alla raccolta originaria, ma i catastrofici eventi della seconda guerra mondiale decretarono la chiusura del museo, anche perché i locali del convento vennero utilizzati per accogliere gli sfollati e, in parte, come aule scolastiche. Solo negli anni settanta, la Soprintendenza del Molise riesce a ricostruire il museo grazie alla donazione del convento di Santa Chiara allo Stato da parte del comune di Venafro.

 Ubicato alle pendici del Matese, il sito era in una posizione strategica rispetto alle direttrici che si incontrano nella piana di Boiano: la via transumante in seguito nota come tratturo Pescasseroli-Candela, il tracciato minore che scende verso la costa adriatica raggiungendo Larino e quello che, scavalcando il Matese, conduce al versante campano e al Monte Cila. Questi elementi rendevano l’area del santuario luogo privilegiato per gli scambi e la frequentazione del sito è attestata sin dal VII-VI sec. a.C. Solo nel IV sec. a.C. si ebbe la sistemazione dell’edificio su due terrazze, delimitate da mura in opera poligonale sulle quali furono costruiti gli edifici e a cui si accedeva attraverso due ingressi, posti a est e a ovest. La terrazza inferiore era dominata da un lungo edificio porticato con prospetto scenografico aperto sulla piana sottostante.