Spike Lee fonde très vite sa propre société de production, 40 Acres & A Mule Filmworks, en référence à 40 acres et une mule (promesse d'indemnisation faite aux esclaves afro-américains libérés après la guerre de Sécession : 40 acres (16 hectares) de terre à cultiver et une mule pour traîner une charrue).

Spike Lee est connu pour être très engagé dans la défense des droits des afro-américains, comme le prouvent ses films phares tels que Malcom X, avec Denzel Washington dans le rôle-titre, ou encore The Inside Man, où il retrouve à nouveau son acteur fétiche.
C’est d’ailleurs cet engagement qui le fera se démarquer très jeune, avec un court-métrage d'étudiant oscarisé puis un premier long-métrage récompensé à Cannes. Tout le long de sa filmographie, le cinéaste Spike Lee pose un regard critique sur la société américaine. Chacun de ses films parle, en filigrane, de problématiques, sociales, criminelles ou économiques qui transcendent l’intrigue principale. Ses films divertissent autant qu’ils conscientisent.

Mais ses positions politiques vont au-delà de la défense des droits aux afro-américains. Les évènements des États-Unis, tels que les attentats du 11 septembre 2001 ou l’ouragan Katrina, le poussent à mettre à profit ses talents de réalisateur pour des documentaires

Le 19 mai 2018, il décroche le Grand Prix du Festival de Cannes pour son film BlacKkKlansman qui s'inspire de la véritable histoire de l'infiltration d'un policier afro-américain, Ron Stallworth, dans le Ku Klux Klan.

Dans ses dernières réalisations, Spike Lee poursuit son combat contre le racisme et les inégalités faites contre la communauté afro-américaine, entre scènes violentes et comiques. C’est le cas avec BlacKkKlansman : j’ai infiltré le Ku Klux Klan, inspiré d’une histoire vraie ou de Da 5 Bloods, actuellement sur Netflix, film de guerre et d’aventures

Il y a enfin cette question, lancinante, qui traverse tout le film de Spike Lee: être ou ne pas être violent ?
Dans « Do the right thing », les esprits s’échauffent avec la canicule, les crispations, les confrontation. Mookie balance une poubelle dans la vitrine de ses employeurs et fait éclate l’émeute.
Quelle est la bonne solution? L’action politique non-violente et donc potentiellement consensuelle? Ou le recours à la violence avec le risque de l’ostracisation du combat et de la répression pour l’autre ?
Le film se conclut sur deux citations, l’une de Martin Luther King condamnant la violence, l’autre de Malcolm X la justifiant. Spike Lee laisse au spectateur la liberté de réfléchir et d’éventuellement choisir entre les deux options.