و سنستعرض الان الأقسام التي تتبع هذه الادارات التابعه لوكالة الثروة الحيوانية و وابرز  المهام التي تقوم بها : 

اولاً: قسم الصيدلة و المختبرات البيطرية : 

١- وحدة الصيدلية البيطرية
تقوم الصيدلية البيطرية بتوفير التحصينات ( الامصال ) اللازمة لمكافحة الامراض المعدية في مملكة البحرين كما توفر الادوية و المستلزمات الطبية البيطريه التي تحتاجها الاقسام التابعه للوكالة  ومن اهم المهام لها كذلك إصدار التراخيص لاستيراد أو تصدير الادوية و المستلزمات الطبية البيطرية للمنشآت الخاصة كما تقوم بإصدار تراخيص مزاولة المهنة للعاملين وتراخيص المنشآت الخاصة ( الصيدليات و المستودعات البيطرية ) والاشراف والرقابة عليها. 

٢- مجموعة المختبرات الطبية البيطرية : 
يعد هذا القسم العصب الأساسي للقطاع حيث انه يقوم في فحص جميع الحيوانات الواردة الى مملكة البحرين عبر المنافذ لضمان سلامتها قبل دخولها كما يقوم بفحص اللحوم ( الحمراء و البيضاء ) و منتجاتها للتأكد من سلامتها و خلوها من الامراض قبل دخولها للاسواق للاستهلاك الآدمي وكذلك فحص عينات حملات الاستقصاء الوبائي وحملات التقصي للأمراض في الحيوانات من خلالها.
ثانياً :قسم العيادات و مكافحة الامراض : 
 قسم مهم و اساسي حيث يقوم بدورات منتظمة  في تحصين حيوانات المجترات الصغيرة والكبيرة كما يقوم بعمل المسوحات و الاستقصاء الوبائي و التقصي للامراض في مملكة البحرين ومن ضمن مهام القسم ايضا إصدار تراخيص مزاولة المهن و المنشآت الطبية البيطرية الخاصة  ( العيادات و المستشفيات الخاصة ) والاشراف والرقابة عليها.

ثالثاً: قسم المحاجر البيطرية:
مهمة القسم الرئيسية هي حجر الحيوانات التى تدخل الى مملكة البحرين عبر المنافذ المختلفه للتأكد من خلوها من جميع الامراض و ذلك بعد جمع العينات منها و ارسالها الى المختبرات البيطرية كما يقوم بإصدار تراخيص استيراد و تصدير الحيوانات بأنواعها و الطيور واللحوم الحمراء والبيضاء  من و الى مملكة البحرين 

رابعاً:قسم الانتاج الحيواني:
 و هو قسم مهمته متابعه مزارع الانتاج الحيواني و الدواجن والاشراف عليها وترخيصها كما يقوم القسم بالرقابة والاشراف على محلات بيع الحيوانات والطيور الحية وترخيصها لمزاولة النشاط.

الثروة الحيوانية من الثروات المهمة في مملكتنا الحبيبة و وجب علينا جميعاً التعاون و التكاتف للمحافظه عليها و السعي للارتقاء الى اعلى المستويات العالمية التنافسية بالعمل الدؤوب و المستمر و البحث و التطوير .