Com essas duas entidades politicas foi adotado um sistema parlamentarista no Brasil chamado de "parlamentarismo as avessas' que tinha o imperador Dom Pedro II, imbuído das atribuições concedidas pelos Poder Moderador, tendo total liberdade para escolher os integrantes do Conselho de Estado. Este órgão abaixo da autoridade do monarca, poderia escolher os ministros e realizar a dissolução da Câmara de Deputados. Na maioria das vezes, as ações do Conselho só refletiam os interesses do imperador. As eleições do poder legislativo também eram geralmente marcadas por diversos casos de fraude onde conservadores e liberais disputavam o poder.

Como alguns acontecimentos que marcaram a politica interna do segundo reinado temos:

Primeiramente o golpe da maioridade que foi a antecipação da coroação de Dom Pedro II , quando ele tinha apenas 13 anos de idade mesmo que de acordo com a Constituição de 1824, para a coroação imperial era preciso que o herdeiro tivesse 18 anos de idade mas como muitas províncias estavam passando por rebeliões, a solução encontrada para pacificar o Império foi a coroação do imperador, encerrando assim o período regencial e dando inicio de fato ao Segundo reinado.

As eleições de 1840 que foram nomeadas “eleições do cacete” pois em todo o país, espocaram denúncias de fraudes e violências as mais diversas. Mesas eleitorais eram assaltadas, urnas com votos falsificados, assassinatos eram cometidos, sem haver lado inocente. As províncias formatavam eleições de deputados mesmo com evidências de que as votações não tinham obedecido à lei. Resumidamente essas eleições foram uma época muito turbulenta e caótica para o império.

E temos a Revolução Praieira que ocorreu de 1848 a 1850 e foi motivada pelas disputas entre os praieiros e os conservadores. Os principais combates travados nessa revolução aconteceram no interior da província de Pernambuco, embora um grande ataque tenha sido liderado por Pedro Ivo contra Recife. No final os praieiros saíram derrotados e os conservadores permaneceram no poder principalmente pelo apoio do governo.

A questão Christie que iniciou de forma concreta quando o navio britânico Prince of Wales naufragou no Rio Grande do Sul e teve a sua mercadoria tomada por terceiros, com isso o Diplomata da Inglaterra ao Brasil William Dougal Christie exigiu que o governo brasileiro indenizasse a Inglaterra pelo prejuízo e que um oficial inglês acompanhasse toda a investigação do caso. Em 1862, quando o caso do navio ainda era discutido, um grupo de oficiais da marinha inglesa foi preso por cometer uma estrondosa arruaça no Rio de Janeiro. Com esse novo incidente Christie exigiu que a indenização das cargas fosse paga, os oficiais brasileiros envolvidos na detenção fossem exonerados e que houvesse a realização de um pedido de desculpas oficial do Governo Brasileiro, após o governo Brasileiro não aceitar tais termos, o diplomata inglês exigiu que embarcações inglesas apreendessem cinco navios brasileiros que estavam ancorados na Baia de Guanabara. Procurando solucionar o incidente, Dom Pedro II convocou o rei da Belga Leopoldo I para arbitrar a questão que decidiu em favor dos brasileiros e determinou que o tal pedido de desculpas fosse dado pelos ingleses mas sem obter resposta da Inglaterra, o Brasil acabou rompendo relações com a Coroa Britânica. Com relações entre os dois impérios só sendo reestabelecidas em 1865.

E a Guerra do Paraguai que foi o maior conflito armado internacional da historia da América Latina que foi travada entre o Paraguai e a Tríplice Aliança, composta pelo Império do Brasil, Argentina e Uruguai, ela se estendeu de dezembro de 1864 a março de 1870.O primeiro grande incidente da guerra foi a invasão do Mato Grosso do Sul em 26 de dezembro de 1864, com ataque paraguaio ao Brasil sendo uma represália à invasão do território uruguaio, conduzida pelo governo brasileiro em favor dos colorados e contra os Blancos (aliados do Paraguai).

No inicio o Paraguai teve varias vantagens sob a tríplice aliança, como o fato de que os exércitos da aliança estavam menos preparados do que os paraguaios assim como o Paraguai tendo começado com uma ofensiva bem sucedida. Porem a derrota na batalha naval do Riachuelo assim como as derrotas nas campanhas no Rio Grande do Sul e em Corrientes e a rápida mobilização de tropas pelos países da tríplice aliança colocaram o Paraguai em uma posição defensiva. Mesmo assim devido a fatores como Desentendimentos no comando dos exércitos da Tríplice Aliança e a geografia do território paraguaio, fizeram com que as ofensivas dos aliados ganhassem pouco impulso. Porem após varias ofensivas pela tríplice aliança a capital paraguaia Assunção foi ocupada em 1º de janeiro de 1869 pelo general brasileiro João de Souza da Fonseca Costa com o exercito brasileiro, sendo presentes também quatro mil soldados argentinos,200 uruguaios e 800 soldados e oficiais da Legião Paraguaia(aliados da tríplice aliança). Com os aliados instalando um governo provisório para substituir Solano López.

No começo do Segundo Reinado o café já era o principal produto da economia brasileira, representando 40% da exportação do país e mais da metade da produção mundial. O café chegou a superar o açúcar, que ocupava o espaço de principal produto de exportação brasileira. Essa produção se concentrava no começo na região do Vale do Paraíba devido a preços convidativos no mercado internacional, aproveitamento de estradas e de um sistema de transporte do período aurífero, disponibilidade de imensas áreas de terras de floresta virgem e um tráfico negreiro eficiente entre os portos da África central e do Brasil. Nessa primeira fase da economia cafeeira era utilizado uma produção extensiva (predomínio da mão de obra humana e baixa mecanização) e um sistema de produção chamado Plantation que utilizava grandes latifúndios, monocultura, trabalho escravo e exportação para o mercado externo.

Porem na década de 1880 tivemos a transferência do principal centro produtor para o Oeste Paulista e norte do Paraná, com as principais causas do declínio da atividade cafeeira no Vale do Paraíba sendo a escassez e a elevação do preço da mão-de-obra escravizada devido a leis abolicionistas como a lei Eusébio de Queiroz , e a degradação dos solos da região. Nessas novas regiões a produção do café era feita em áreas de "terra roxa" que é um tipo de solo avermelhado muito fértil e utilizavam uma mistura de mão de obra escravizada e imigrantes europeus de maioria italianos e alemãs.

A lei Eusébio de Queiroz que foi aprovada em setembro de 1850, decretando a abolição do oficial do tráfico negreiro no Brasil. A lei foi acompanhada de medidas de repressão a essa atividade, fazendo com que o tráfico negreiro tenha deixado de existir de forma concreta efetivamente a partir de 1856.

A lei do Ventre livre que determinou que, de 28 de setembro de 1871 em diante, as mulheres escravizadas dariam à luz apenas bebês livres. A lei também determinava como essa liberdade aconteceria e ainda previa a indenização para o senhor de escravos em certo cenário.

A lei dos sexagenários que foi aprovada em 1885 e determinou que os escravizados com 60 anos ou mais deveriam ser livres. Essa lei foi concebida no gabinete do Barão de Cotegipe para manter a discussão sobre o fim da escravidão viva e conceder tempo para uma solução negociada que pusesse fim ao sistema escravagista de forma não violenta.

E por fim a Lei Áurea que foi a lei que determinou a abolição da escravatura no Brasil, em 13 de maio de 1888. Por meio dessa lei, mais de 700 mil escravizados conquistaram sua liberdade, e seus antigos donos não receberam nenhuma forma de indenização do Estado brasileiro. Com a responsável por assinar esse documento sendo a princesa Isabel que era na época a herdeira do trono. Essa abolição do trabalho escravizado foi resultado da mobilização do movimento abolicionista, da sociedade brasileira e dos escravizados, com a década de 1880 presenciando uma grande mobilização política, jurídica e social em defesa da abolição.

A questão militar, na qual os veteranos da Guerra do Paraguai, influenciados sobremaneira pela filosofia francesa positivista de Augusto Comte, colocar-se-iam contra o regime vigente. A Questão Militar envolveu os oficiais mais antigos da hierarquia do Exército, combatentes da guerra de 1864, e os jovens oficiais da Escola Militar da Praia Vermelha, incomodados com as limitações da cidadania inerentes ao Império por conta dos critérios aristocráticos e censitários, com o regime político imperial sendo considerado um obstáculo ao desenvolvimento nacional, enquanto a possibilidade de igualdade civil da República agradava os militares.

A questão da ideologia Positivista, que com sua influencia no Brasil acabou resultando em pensamentos muito diversos no império, conforme se combinou com outras correntes ideológicas. Nenhum setor teve maior presença da ideologia do que as Forças Armadas, de onde saiu o vitorioso movimento republicano e a ideia de adotar o lema “Ordem e Progresso”. Logo várias das medidas governamentais dos primeiros anos da República tiveram inspiração positivista, como a reforma educativa e a separação oficial entre Igreja e Estado, ambos em 1891.

A questão do movimento abolicionista que ganhou impulso no século XIX após a Guerra do Paraguai e teve importantes aliados em parte da jovem oficialidade que participara do conflito platino. Com o fim da escravidão nos Estados Unidos tornando o Brasil e a Cuba os únicos países escravistas do continente americano, o escravismo brasileiro foi confrontado no exterior por ligas inglesas favoráveis ao abolicionismo, e verdadeiras organizações não governamentais da época, e no Brasil, libertos, abolicionistas, republicanos e liberais combatiam o “infame comércio”. A imprensa teve também papel de destaque, como os jornais O Abolicionista e Gazeta de Notícias, o qual contava com a assinatura de José do Patrocínio. Os oficiais do Exército, em 1887, reunidos no Clube Militar, negaram-se a continuar a exercer funções de “capitães-do-mato”. Além dessas tivemos, as sociedades abolicionistas brasileiras, como a Sociedade Emancipadora Militar, Clube Abolicionista de Riachuelo, Clube dos Libertos de Niterói, dentre outras. Com todas essas criticas e movimentos contra o abolicionismo afetando diretamente e/ou indiretamente o regime monarquista pela legalização da escravidão, o que diminuiria com as leis abolicionistas, mesmo assim esses aspectos causaram pressão sob o regime imperial.

E a questão religiosa, que se originou do fato do Imperio Brasileiro manter a estreita relação entre a Igreja Católica e o Estado. Com o “padroado” estando previsto na Constituição de 1824 e estabelecia que as ações da Igreja Católica dependiam do Estado Imperial, mantenedor do catolicismo no Brasil que era a religião oficial do país e cabia ao Estado a obrigação de protegê-la. Em 1864, o Papa Pio IX editou as bulas Quanta Cura e Syllabus Errorum, nas quais a Igreja se posicionava contra o liberalismo político, reafirmando sua autoridade, além de condenar a maçonaria que no Brasil tinha penetrado em parte do clero católico, provocando a ira dos católicos tradicionalistas denominados de ultramontanos. Com essas tenções religiosas influenciando na instabilidade do Segundo reinado.

Com todos essas diferentes questões de tensão politica e certos grupos e movimentos estando insatisfeitos com o governo imperiais causando a "Proclamação da República Brasileira", também referida como Golpe Republicano ou golpe de 15 de novembro, que foi um golpe de Estado político-militar, ocorrido em 15 de novembro de 1889, que instaurou a forma republicana presidencialista de governo no Brasil, encerrando a monarquia do Império e, por conseguinte, destituindo o imperador D. Pedro II, que em seguida recebeu ordens de partir para o exílio na Europa.