Segundo Bazin (1956, p.178), “a porta é decorada com ornamentos esculpidos em pedra calcária de estilo Dona Maria, semelhante aos que ornam as portas e janelas de São Gonçalo de Penedo (Alagoas)”.

Afirmar que a data de 1690 foi quando a Igreja foi construída é controversa. Quem chama a atenção para o fato é o historiador sancristovense Thiago Fragata (2000) a partir dos resultados da pesquisa empreendida no Arquivo do Judiciário de Sergipe (AJES), em especial nos Livros da Santa Casa de Misericórdia de São Cristóvão.

Para comprovar a assertiva, Thiago Fragata argumenta que durante a União Ibérica, “a concessão de privilégios e favores promovidos por Felipe II a Santa Casa da Bahia não se estenderam a Sergipe” (FRAGATA, 2000, p.2), que dependia de seus benfeitores, dentre eles Belchior Dias Moreya, falecido em 1622, que em testamento incluiu a obrigação a seu filho Rubélio Dias Moreya de reedificar algumas capelas sagradas.

De igual forma, por meio de testamento, há registro da existência da Capela Santa Isabel em 1626, a saber:

^{[...] É possível identificar sua criação entre 1607, quando a cidade se estabelece no monte Una, a esquerda do Rio Paramopama, e 1626, ano em que Baltazar Barbunda solicita via testamento sua inumação na capela Santa Isabel, orago da instituição. Dentre seus benfeitores figuram Belchior Dias Moreya e seu filho, Rubélio Dias Moreya, o capitão-mor Antônio Pinheiro de Carvalho, seu provedor Cosme Barbosa e o próprio Balthazar Barbunda. (FRAGATA, 2000, p.3) Grifo nosso.}

Tinha como missão “curar os doentes, acolher as crianças abandonadas e os alienados, socorrer nas epidemias e enterrar os mortos” (Barroso, 2009, p.27).

Com a restauração do trono (1640), Sergipe enquanto Comarca da Bahia, ainda não recebia os privilégios régios financeiros e jurídicos garantidos pela Coroa às Misericórdias, “uma vez [que] a Santa Casa sancristovense não tinha compromisso aprovado”, pontua Fragata (2000, p.4). Essa situação se estendeu por muitos anos, e a manutenção dos seus trabalhos dependiam do patrocínio das doações, juros de empréstimos, foros de terras e legados pios.

Ao considerar a exposição de documentos apresentados por Thiago Fragata, percebe-se o descrédito da instituição. Por emprestar dinheiro a juros algumas pessoas buscavam a filiação da Santa Casa para ter facilidade na concessão de empréstimos. A estrutura não era complexa, bastava um fiador, de preferência um irmão da Casa disposto a empenhar bens para hipoteca, na sua maioria senhores de engenho, militares, políticos.

Acumulavam-se os devedores pelas dívidas não sanadas, apesar da Santa Casa anunciar “na Folha Sergipense a lista de nomes de seus clientes em atraso, uma vez que não tinha condições de abordá-lo em suas residências” (FRAGATA, 2020, p. 15).

^{[...] A Misericórdia possuía vila de casas para aluguel na rua do Carmo e noutros pontos da cidade. Também alugava os salões da sede para os mais diversos inquilinos e propósitos. Em 1834 tinha sala alugada para a Sociedade Maçônica, para Assembleia Legislativa (1834-1842), para a Tesouraria Provincial (1837) e até para ensaio da Sociedade Dramática (1842-1843). [...] (FRAGATA, 2020, p. 15)}

Contudo, o não cumprimento dos pagamentos, recursos esses que o Hospital São Mateus dependia para sua manutenção, provocava constantemente a ameaça de fechamento; o que se efetivou no final do século XVIII.

Um novo prédio foi erguido para o Colégio da Imaculada Conceição, onde seriam lecionadas, além das matérias obrigatórias de estabelecimentos similares, todas as prendas e música, vindo a constituir-se em poderoso elemento educacional às órfãs e filhas de famílias católicas.

Com a transferência das irmãs para o Convento do Carmo, imóvel adquirido pela Ordem, o asilo, orfanato e escola Lar Imaculada Conceição, passou a ser administrada pelas Irmãs Missionárias da Irmandade Conceição Mãe de Deus (Irmãs Missionárias da Imaculada Conceição).