Na maioria dos casos no mundo vegetal e animal, os indivíduos têm dois alelos para cada gene: um alelo é herdado do pai e o outro é herdado da  mãe. Então, um alelo é uma forma particular de um gene específico. 

Quando um organismo recebe dois alelos iguais ele é chamado de homozigoto. Voltando às ervilhas, o que Mendel concluiu é que a cor amarela da semente predominava sobre a cor verde.

O que temos, geneticamente falando, é que se uma planta recebe tanto da mãe quanto do pai o alelo que determina a cor amarela (vamos  chamá-lo de V), ela é homozigota dominante (porque o alelo para cor amarela inibe o alelo para cor verde). 

Mas se ela recebe de ambos os pais o alelo que determina a cor verde  (vamos chamá-lo de v), ela é homozigota recessiva. Há ainda a  possibilidade de que ela receba o alelo dominante de um dos pais e o  alelo recessivo do outro. Neste caso, ela é heterozigota, também  chamada de híbrida. 

O fato de um alelo ser dominante sobre outro não significa que ele seja  melhor, nem que ele seja o mais comum. Existem doenças que são  expressas quando os genes estão em homozigose dominante, por  exemplo a doença de Huntington (doença degenerativa do cérebro que  afeta a capacidade cognitiva). 

- Parental (P): Plantas com sementes amarelas e lisas (VVRR) x  Plantas com sementes verdes e rugosas (vvrr). 

As plantas da geração F1, resultantes desse cruzamento, eram todas  heterozigotas para ambas as características (VvRr) e apresentavam  sementes amarelas e lisas, pois esses são os traços dominantes. 

Quando Mendel deixou essas plantas F1 se auto polinizarem, ele observou  a geração F2. Ele esperava ver a segregação das características de  acordo com uma proporção 9:3:3:1: 

• 9 plantas com sementes amarelas e lisas (V_R_). 

• 3 plantas com sementes amarelas e rugosas (V_rr). 

• 3 plantas com sementes verdes e lisas (vvR_). 

• 1 planta com sementes verdes e rugosas (vvrr).

• Casca da semente (lisa ou ondulada)

• Cor da semente (amarela ou verde)

• Cor da flor (púrpura ou branca)

• Forma da vagem (inflada ou constrita)

• Cor da vagem (verde ou amarela)

• Posição da flor (axial ou terminal)

• Comprimento do caule (alto ou anão)

Nesses experimentos, ele utilizou plantas chamadas de "puras", ou seja, plantas que, após sucessivas gerações, davam origem a plantas com a mesma característica

• Cada ser vivo é único e possui um par de genes para cada característica; 

• As características hereditárias serão repassadas para a semente, ou seja, metade virá pai e a outra metade da mãe;

Após esse experimento, Mendel junto com a sua curiosidade o levaram a indagar se os fatores responsáveis pela determinação destas  características seriam transmitidos obrigatoriamente juntos ou se haveria  um mecanismo de transmissão independente. É aí que entramos na 2° lei de Mendel.

Esses princípios foram fundamentais para a genética moderna, pois explica como a variação genética é gerada e transmitida entre às gerações. A segunda lei de Mendel se aplica a genes localizados em cromossomos diferentes ou a genes que estão distantes no mesmo cromossomo, onde o fenômeno do crossing-over durante a meiose pode ocorrer.