Médico griego al servicio del ejército imperial romano, realizo una obra cuyo nombre es De Materia Medica (Los materiales de la medicina).

En ese mismo siglo, el biólogo andalusí Abu al-Abbas al-Nabati desarrolló un método científico para la botánica, introduciendo técnicas empíricas y experimentales para las pruebas y descripciones de las hierbas medicinales.

Alberto Magno (1193-1280), publica su obra De vegetabilis et plantis libri septem (Siete libros de vegetales y plantas).

Imprimen la primera versión del texto de Dioscórides. 

Suceden numerosas ediciones ilustradas y comentadas, entre las que destacan la italiana de Andrea Mattioli, la que contribuyó a la difusión de la obra de Dioscórides.

Otto Brunfels (1489-1535), herborista publica su obra Herbarium vivae Eicones. Otto Brunfels es considerado uno de los tres padres de la botánica alemana

Euricius Cordus (1486-1535) escribió el Botanologicon. y su hijo Valerius Cordus (1515-1544), fue autor de obras tan importantes como Historia stirpium libri V (1561), publicadas tras su muerte, en las que se describen 502 especies con excelentes ilustraciones. 

La obra New Kreuter Buch (Nuevo libro de hierbas, 1539) de Jerome Bock (también conocido como Hieronymus Tragus, 1498-1554) ha sido reconocida no sólo por sus descripciones de plantas sino también como una fuente del idioma alemán tal como se hablaba en el siglo XVI.

La obra De historia stirpium commentarii insignes (Comentarios notables acerca de la historia de las plantas, 1542) de Leonhart Fuchs (1501-1566), no se llegó a completar, pero sí la traducción alemana Neu Krauterbuch (‘Nuevo libro de hierbas’, 1543), en la que se dedican varias páginas a un glosario terminológico botánico y se describen 500 especies.

Elaboran el el primer jardín botánico y en Padua (Italia).

Valerius Cordus (1515-1544), fue autor de obras tan importantes como Historia stirpium libri V, publicadas tras su muerte, en las que se describen 502 especies con excelentes ilustraciones. 

Matthias de L'Obel (o Lobelius) (1538-1616), autor de Stirpium adversaria nova (1570), posteriormente editada con el título de Plantarum seu stirpium historia (1576) y en la que muestra una clasificación basada en caracteres de las hojas, que a pesar de llegar a conclusiones inexactas, traza de un modo muy aproximado la diferencia entre monocotiledóneas y dicotiledóneas.

Rembert Dodoens, publico su obra Stirpium historiae pemtades.

Joachim Jungius (1587-1657), filósofo, matemático y naturalista alemán, fue una de las principales figuras de la ciencia del siglo XVII. Sus obras, Doxoscopia (1662) e Isagoge phytoscopica (1679) aparecieron después de su muerte, gracias a sus alumnos.

Se considera a Hooke como el inventor del microscopio, con el cual observó diferentes tejidos y órganos vegetales. Su trabajo más importante, Micrographia (1667),

Historia generalis plantarum (Historia general de las plantas) del inglés John Ray (1627-1705), en el que se basó Carlos Lin. Ray intentó una primera clasificación natural de las plantas y expuso su método en tres obras: Methodus plantarum nova (1682), el primer volumen de Historia plantarum (1686) y en Methodus emendata (1703).

La obra de Rudolf Jakob Camerarius (1665-1721), De sexu plantarum epistola (1694), tuvo gran trascendencia ya que puso en evidencia el carácter sexual de las flores, órganos que a partir de entonces adquirirían gran importancia para los botánicos como criterio de clasificación.

Stephen Hales (1677-1761) fue el primero en describir científicamente el fenómeno de la transpiración en las plantas en su obra Vegetable staticks. 

Carlos Linneo (o Linnaeus, 1707-1778), publicó en 1735 Systema Naturae donde un sistema sexual (clavis systematis sexualis) separa a los vegetales en 24 clases.

En Classes plantarum (1738), Linneo esbozó una clasificación natural al establecer 28 órdenes naturales cada uno equivalente aproximadamente a una familia actual, ya que él mismo reconoció la artificialidad de su sistema anterior.

Francés Michel Adanson (1727-1806) y su obra Families des Plantes (1763-64) se dio comienzo a una serie de investigaciones y propuestas de sistemas de naturales de clasificación de las plantas basados en la semejanza morfológica

Joseph Priestley (1733-1804), químico y ministro, descubre el oxígeno.

Antoine-Laurent de Jussieu (1748-1836). Antoine-Laurent estableció un sistema de clasificación en su obra Genera plantarum secundum ordines naturales disposita, juxta methodum in horto Regio Parisiensi exaratum anno 1774 (Los géneros de plantas ordenadas en familias naturales, de acuerdo al método usado en los jardines reales de París)

Jean Senebier, botánico y naturalista suizo, demostró que las plantas consumen dióxido de carbono y liberan oxígeno bajo la influencia de la luz, en su obra Mémoires physico-chimiques sur l'influence de la lumière solaire pour modifier les êtres des trois règnes de la nature (Memorias físico-químicas sobre la influencia de la luz solar para modificar los estados de los tres reinos de la naturaleza). 

Augustin Pyrame de Candolle (1778-1841) consideró como carácter taxonómico fundamental la complejidad del aparato vegetativo, dividiendo a las plantas en vasculares y celulares (Théorie élémentaire de la Botanique, Teoría elemental de la Botánica, 1813).

El botánico escocés Robert Brown (1773-1858), descubridor del núcleo celular en 1831, señaló en su obra Botanicarum facile princeps (1827)

Stephan Ladislaus Endlicher (1804-1849), botánico austriaco, estableció en su Genera Plantarum Secundum Ordines Naturales Disposita (1836-1840) una clasificación en la que las dicotiledóneas fueron agrupadas conjuntamente con las coníferas en una sección denominada Acramphibry

Wilhelm Hoffmeister (1824-1877) dio un gran impulso a la clasificación de las criptógamas, corroborando y ampliando los conceptos anteriores.

Charles Darwin (1809-1882) publica su obra The origin of species (1859), donde se establecieron las bases de la actual teoría de la evolución. 

El término ecología fue acuñado por el biólogo alemán Ernst Haeckel en 1866 quien lo definió como la "ciencia de las relaciones entre los organismos y su ambiente".

El primer sistema filogenético admitido fue el contenido en el Syllabus der Planzenfamilien (1892) de Adolf Engler (1844-1930).

Se escribe la primera obra dedicada a la ecología (Plantesamfund. Grundtræk af den økologiske Plantegeografi), junto con el primer curso universitario sobre el tema, fue escrita en 1895 por Eugenius Warming (1841-1924) al que por esa razón se lo considera el fundador de la ecología.

Se publica la obra Morphology of Angiosperms (Morfología de las angiospermas) de John Merle Coulter (1851-1928) y Charles Joseph Chamberlain (1863-1943).

Se publica la obra On the origin of angiosperms (Sobre el origen de las angiospermas) de Edward Alexander Newell Arber (E.A.N. Arber) y J. Parkin.

John Hutchinson en su obra The Families of Flowering Plants: Arranged According to a New System Based on Their Probable Phylogeny (Las familias de plantas con flores: dispuestas de acuerdo a un nuevo sistema basado en su filogenia probable) realizó una clasificación siguiendo la teoría euántica, en la que le brindó especial importancia al porte leñoso o herbáceo, por lo que reconoce en algunos grupos un origen polifilético.

Arthur John Cronquist publicó una clasificación del reino vegetal basada fundamentalmente en el tipo de nutrición, en la presencia o ausencia de clorofila y otros pigmentos, tipos de cilios o flagelos, estructura del núcleo, estructura de la pared celular y otros caracteres histológicos. 

Cronquist estableció para las angiospermas dos grandes clases, Magnoliatae y Liliatae, reconociendo además las subdivisiones.