Algunos de los elementos usados en el MK Ultra eran la radiación y el LSD, aunque el LSD fue descartado porque sus efectos eran imprevisibles. También se usaron anfetaminas, un proceso que se eliminó porque la muerte del interrogado era muy frecuente, además del uso de otras drogas las cuales  producían la muerte a  la persona que estaba siendo interrogada.

Entre las muertes más destacadas, está la muerte de Frank Olson, un bioquímico del Ejército de EE UU. Que durante el apogeo del “MK Ultra” se le administró LSD sin su consentimiento y éste se volvió psicótico. Después de una semana de haberle  sido administrada esta droga a Frank Olson, este se lanzó por la ventana de un hotel.

En el año 1964, se puso en práctica otra de las fases que formaban parte del MK Ultra, llamada “MK Search” la cual tenia como objetivo  crear un “suero de la verdad”, que era  administrado a los prisioneros de guerra, el cual permitía  obtener toda la información requerida de su prisionero. Las víctimas de ésta fase del experimento fueron en su mayoría espías rusos que eran capturados mediantes operaciones.