La separación entre Iglesia (sea esta anglicana, católica, luterana, presbiteriana, o cualquier tipo de culto religioso) y Estado es una idea que hunde sus orígenes en la lucha de la Iglesia Católica en contra del cesaropapismo del Imperio Bizantino que produjo el cisma de oriente en 1053. La idea comienza a resurgir a partir del humanismo, durante el Renacimiento. Se consolida con la Ilustración, por medio de la corriente filosófica racionalista, llegando a ser una política oficial durante la Revolución francesa, la Independencia estadounidense y las revoluciones liberales que buscan deshacer la llamada "alianza entre el Trono y el Altar".

Actualmente, la separación entre la Iglesia y el Estado se encuentra plasmada en muchas constituciones nacionales, mediante el establecimiento de un Estado laico, en unos casos, en otros mediante el establecimiento de un Estado aconfesional. De hecho hubo una tendencia en el mundo desde la edad moderna hacia una secularización del Estado, la cual ha disminuido con el fortalecimiento iglesias protestantes, y sobre todo del Islam.1​2​3​

Debe entenderse que la separación Iglesia-Estado es un espectro religioso-gubernamental, en donde se encuentran diferentes grados o niveles de separación, siendo el ateísmo de Estado su forma más radical, y el Estado aconfesional la forma más suave de separación Iglesia-Estado; así mismo en las teocracias, contundentemente no existe separación Iglesia-Estado.

Uno de los temas centrales de la filosofía moderna fue la epistemología, o el estudio del conocimiento. Los filósofos modernos se preocuparon por cómo podemos conocer el mundo y cómo podemos estar seguros de que nuestro conocimiento es verdadero. En este sentido, se enfocaron en la lógica, la ciencia y la teoría del conocimiento.

Otro tema importante fue la metafísica, o el estudio de la realidad. Los filósofos modernos se preguntaron qué existe realmente en el mundo y cómo podemos entender la naturaleza de la realidad. En este sentido, se enfocaron en la ontología, la filosofía de la mente y la filosofía de la naturaleza.

La ética también fue un área de interés para los filósofos de la modernidad. Se preocuparon por cómo podemos tomar decisiones éticas y cómo podemos vivir una vida moralmente responsable. En este sentido, se enfocaron en la ética normativa y la filosofía política.

La política también fue un tema central para los filósofos de la modernidad. Se preocuparon por la organización de la sociedad y el papel del gobierno en la protección de los derechos individuales y la promoción del bien común. En este sentido, se enfocaron en la filosofía política y la teoría del contrato social.

Por último, la religión y la ciencia también fueron temas importantes para los filósofos de la modernidad. Se preocuparon por la relación entre la fe y la razón, y cómo podemos reconciliar nuestras creencias religiosas con nuestra comprensión científica del mundo. En este sentido, se enfocaron en la filosofía de la religión y la filosofía de la ciencia.

Entre los temas de interés de los filósofos ilustrados se encontraban la educación, la libertad de pensamiento, la tolerancia religiosa, la igualdad ante la ley, el progreso tecnológico, la crítica a las instituciones del Antiguo Régimen y la promoción de la ciencia y la razón como herramientas para mejorar la sociedad.

Como resultado de sus ideas, los filósofos ilustrados contribuyeron a la Revolución Francesa, la independencia de las colonias americanas y la difusión de ideas democráticas y liberales en Europa y América Latina. También se produjo una mayor valoración de la educación y la ciencia, así como una mayor conciencia de los derechos individuales y la necesidad de limitar el poder del Estado.

Sin embargo, también hubo críticas a la Ilustración, como la de los románticos, que consideraban que la razón y la ciencia eran insuficientes para comprender la complejidad de la vida humana y que enfatizaban en la importancia de las emociones y la cultura en la formación de la identidad y la sociedad.

Estos son solo algunos de los principales exponentes de la Ilustración, pero hay muchos otros que también contribuyeron al movimiento, como Diderot, Hume, Adam Smith, Thomas Paine, entre otros.