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Se dedica a estudiar los organismos que son sólo visibles a través del microscopio: organismos procariotas y eucariotas simples

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1675 - mediados del siglo XIX Primeros microscopistas

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1675 - mediados del siglo XIX Primeros microscopistas

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El microscopio fue inventado por Zacharias Janssen en 1590.
Robert Hooke pudo ver en una lámina de corcho que ésta estaba formada por pequeñas cavidades, similares a las celdas de un panal de abejas. Por ello, a dicha cavidad la llamó célula, la cual fue publicada en 1665.

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Anton van Leeuwenhoek; en 1675, mediante un microscopio simple observó que en una gota de agua habían muchas criaturas, invisibles al ojo humano, a las que el denominó animáculos.
En 1683 observa por primera vez bacterias.

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Controversia sobre la Generación Espontanea

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Controversia sobre la Generación Espontanea

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Antiguamente se pensaba que los microorganismos procedían de la materia orgánica en descomposición:
Esta hipótesis estuvo sostenida durante mucho tiempo; Aristóteles fue una de las personas que más la apoyó.

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Johann Van Helmontz hizo un experimento en el que dejó ropa sucia y trigo en un lugar determinado. Tras un período de tiempo, vio como la ropa y el trigo desaparecen y aparecen ratones. Esto lo atribuyó a un proceso de organización de la materia para crear organismos nuevos. Confundió los efectos con las causas.

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John Needham calentó caldo de carne, pensando que todos los microorganismos morían con la ebullición, y colocó la muestra en un sitio cerrado con un tapón de corcho. Vio que aparecían microorganismos en el extracto y dedujo que procedían de la carne.

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Siglo XIX se acabaría de desmentir por completo la  hipótesis de la Generación Espontanea. 

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Siglo XIX se acabaría de desmentir por completo la  hipótesis de la Generación Espontanea. 

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Georg Friedrich Schroeder y Theodor von Dusch. En su experimento cogieron caldo, lo hirvieron y lo colocaron en un matraz cerrado con algodón estéril, por el cual entraba el aire, pero que retenía a los microorganismos, por lo que éstos no aparecían en el caldo. Este experimento también demostró la efectividad del algodón como material para esterilizar el aire por filtración, algo útil para la preservación de alimentos.

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- Realizó un experimento para demostrar la función del algodón para retener microorganismos.
- Pasteur consiguió desmentir la generación espontánea definitivamente y cambió el pensamiento científico.

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Científicos como Cagniard-Latour, Theodore Schwann y Friedrich Kützing vieron el cambio de glucosa a alcohol, sólo se producían si había en el medio un determinado tipo de microorganismos, en ese caso las levaduras. De esta se forma se empezó a entender el proceso de fermentación.
Louis Pasteur descubrio la existencia de microorganismos anaerobios.

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- Siglo XVI, Girolano Fracastoro de Verona decía que las infecciones podían aparecer por partículas a las que llamó "fomes".
- siglo XVIII, Eugenio publicó importantes trabajos de medicina, en especial sobre la viruela.
- Joseph Lister cogió las ideas de Holmes y Semmelweis, y desarrolló un método de cirugía aséptica.
- el Instituto Pasteur estudia los procesos infectivos, la inmunidad del hospedador, y la obtención de vacunas.

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- Carl von Linneo, en su Systema Naturae, clasificó a todos los microorganismos en un mismo grupo, llamado Chaos.
- En 1878 Joseph Lister usaría las diluciones seriadas. También aparecen las placas de Petri, diseñadas en 1887 por el bacteriólogo alemán Julius Richard Petri cuando trabajaba como ayudante de Robert Koch.

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Sergei Winogradsky y Martinus Beijerinck

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Sergei Winogradsky y Martinus Beijerinck

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- Winogradsky estudió los procesos de la nitrificación, identificando los géneros Nitrosomonas y Nitrosococcus, que oxidan amonio a nitrito, y Nitrobacter, que oxida nitrito a nitrato. También identificó a Clostridium pasteurianum, capaz de fijar nitrógeno atmosférico.
- Beijerinck descubrió la fijación de N₂ atmosférico de las leguminosas, además de las bacterias reductoras de sulfato, una forma de respiración anaerobia.

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- Para mejorar los microscopios Koch colabora con la industria Schott, además de recibir ayuda de expertos en óptica, como Carl Zeiss y Ernst K. Abbé.
- Abbé también mejoró el diseño del microscopio para conseguir una mejor visión, creando el condensador de Abbe, aparato para conseguir iluminación inferior en microscopios, y el refractómetro de Abbe.

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Surgimiento o escisión de algunas especialidades:
- Virología
- Inmunología
- Quimioterapia
- Antibiosis

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- Bacteriología
- Parasitología
- Protozoologia
- Micología
- Virología
- Ficología