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La Guerra de los Mil Días en Colombia (1899-1902) fue un conflicto interno entre liberales y conservadores, marcado por tensiones políticas y económicas. Durante tres años, el país se sumió en la violencia y la guerra.

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El Decreto 1718 del 24 de noviembre de 1902 declaró indultados a todos los individuos que participaron en la guerra, se dispuso la cesación de las hostilidades y el 1 de junio de 1903 fue levantado el estado de sitio.8​

Al resto del país la noticia del fin de la guerra llegó tarde. Dada la lejanía del istmo de Panamá respecto al resto de Colombia, y a que las escasas líneas del telégrafo estaban interrumpidas en varios de sus tramos, las comunicaciones quedaron en manos de estafetas y comerciantes trashumantes.

Continuaron acaeciendo hechos violentos en el país, como la ejecución de Victoriano Lorenzo por orden del general Pedro Sicard Briceño en 1903, hecho considerado uno de los detonantes de la posterior separación del istmo.

El primero de junio de 1903, el gobierno declara el cese absoluto de hostilidades en el país, proclamando que el orden público había sido restablecido.

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Tenía como objetivo principal poner fin a la Guerra de los Mil Días en Colombia. Buscaba lograr un cese de hostilidades, promover la reconciliación nacional y contó con la intervención de Estados Unidos en la mediación. Aunque buscaba establecer la paz, la estabilidad en Colombia no se alcanzó de inmediato, enfrentando el país desafíos políticos y sociales en los años posteriores.

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Incluyó el restablecimiento del orden público, la libertad de los prisioneros de guerra de uno y otro bando, el cese del cobro de impuestos extraordinarios y de contribuciones de guerra, declaración de amnistía y suspensión de los juicios por causas políticas, así como jurisdicción ordinaria para los delitos comunes; convocatoria de elecciones para el Congreso, que habría de estudiar la cuestión del canal, las reformas presentadas por Marroquín en 1898 y la modificación del sistema monetario, derrumbado durante la guerra con emisiones incontroladas; la entrega de elementos de guerra por los revolucionarios, en especial el vapor Almirante Padilla; concesión de pasaportes y auxilios de marcha a los liberales que quisiesen salir del país; y devolución de banderas y espadas tomadas a oficiales del gobierno.

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​El tratado fue firmado por el general Lucas Caballero Barrera, en calidad de jefe del Estado Mayor del Ejército Unido del Cauca y Panamá, junto con el coronel Eusebio A. Morales, secretario de Hacienda de la dirección de guerra del Cauca y Panamá, en representación del general Benjamín Herrera y del partido liberal; y por el general Víctor Manuel Salazar, gobernador del istmo, y el general Alfredo Vázquez Cobo, jefe de Estado Mayor del ejército conservador en la Costa Atlántica, el Pacífico y Panamá, en representación del gobierno.

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Se firmó el 21 de noviembre de 1902 a bordo del acorazado estadounidense USS Wisconsin atracado en la bahía de Panamá.

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El Tratado del Wisconsin es el documento con el que oficialmente se pone fin a la guerra civil en Colombia, que se inició el 17 de agosto de 1899, conflicto que hoy se conoce como la guerra de los Mil Días.